Histoire
Le club est fondé en 1994 par des membres de la Sportgemeinschaft (SG) Fischkombinat (FiKo) Rostock et de l'Université de Rostock. En 1997, il monte pour la première fois en 2e Regionalliga. Le club ne parvient pas à se maintenir, mais retrouve cette division dès la saison 1998-1999. L’équipe accède pour la première fois à la 1re Regionalliga en 2007. Malgré un début de saison réussi, la relégation immédiate ne peut toutefois pas être évitée. Cependant, lors de la saison 2009-2010, le maintien n’est pas assuré. En 2011, le club obtient une nouvelle promotion en 1re Regionalliga. Durant l’été 2012, le nom EBC Rostock Seawolves est créé, et l’équipe joue désormais sous cette appellation.
L'équipe est promue en ProB Nord en 2014-2015. Le nom du club est raccourci en Rostock Seawolves. L’équipe termine la saison régulière de la ProB Nord à la première place et se qualifie pour les playoffs, où elle atteint les demi-finales avant d’être éliminée par Oldenbourg, le futur champion. En 2016-2017, les Rostockers se qualifient pour les playoffs de ProB en terminant huitièmes du classement, mais sont éliminés dès le premier tour par le PS Karlsruhe sur le score de 0-2 dans la série. Les Rostockers terminent la saison régulière de 2017-2018 à la troisième place du classement. Lors des playoffs, ils atteignent la finale et assurent ainsi leur montée en ProA.
Pour sa première saison en deuxième division, Rostock termine la saison régulière à la cinquième place du classement, avant de s’incliner en quart de finale contre les Hamburg Towers sur le score de 1-3 dans la série.
En 2020, Dirk Bauermann devient entraîneur du club. À la mi-mars 2020, la saison est interrompue prématurément en raison de la pandémie de Covid-19. À ce moment-là, Rostock occupe la douzième place avec douze victoires et quinze défaites. Début avril 2020, le contrat de Bauermann est prolongé. En avril 2021, Rostock termine la saison régulière à la première place du classement. Cependant, lors de la seconde phase de groupes destinée à déterminer les équipes promues en Bundesliga, le club est éliminé. En mai 2021, le club se sépare de l’entraîneur Dirk Bauermann, et son assistant Christian Held est promu entraîneur principal. En mai 2022, l’équipe atteint la finale du championnat de deuxième division, ce qui permet aux Rostockers d’assurer leur montée en Bundesliga. Rostock avait déjà obtenu au début du mois de mai 2022 une licence conditionnelle pour participer à la Bundesliga en cas de promotion sportive. Lors de la finale contre Tübingen, l’équipe remporte ensuite le titre de champion de ProA.
À l’issue de cette première saison dans l’élite, Rostock termine à la neuvième place du championnat. Selom Mawugbe est élu meilleur défenseur de la saison 2022-2023 de Bundesliga. En juin 2023, le club annonce sa première participation aux tours qualificatifs d’une compétition européenne, la coupe d'Europe FIBA. Lors de leur tout premier match européen, début octobre 2023, les Rostockers s’imposent largement 101-72 contre le club macédonien du Feniks 2010 lors du tour de qualification. Cependant, le club est éliminé à l’issue de la première phase de groupes. En Bundesliga, lors de la saison 2023-2024, Rostock termine à la 15e place et assure de justesse son maintien. À la suite de cette saison, le contrat de l’entraîneur Christian Held n’est pas prolongé. Pour lui succéder, les Rostockers engagent le Polonais Przemysław Frasunkiewicz, tandis que le Français Kévin Anstett devient le nouveau directeur sportif.
Le club termine à la 10e place lors de la saison 2024-2025 et se qualifie à nouveau pour la coupe d'Europe FIBA. Il est en tête de son groupe de la saison régulière et se qualifie pour le deuxième tour. Il termine à la 3e place et est éliminé à l'issue de cette phase.
