Dès fut créé un Conseil supérieur de la Défense nationale (CSDN), organisme d'étude qui réunissait périodiquement les ministres de la Guerre, des Affaires étrangères et de l'Intérieur. La permanence du besoin d'une coordination s'affirmait déjà et n'a jamais cessé depuis lors.
Entre et , tirant les leçons de la Première Guerre mondiale, le gouvernement confiait à un conseil supérieur de la Défense nationale et à son secrétariat général permanent, la préparation des mesures de mobilisation humaine, économique et administrative pour le temps de guerre.
Après la Seconde Guerre mondiale, la coordination de la Défense fut assurée par un seul organisme, l'état-major général de la Défense nationale, devenu par la suite état-major permanent du Président du conseil.
En fut réinstauré le partage des rôles entre le secrétariat général permanent de la Défense nationale (SGPDN) et un état-major combiné des forces armées, placés tous les deux sous l'autorité du chef du gouvernement.
Sous la Cinquième République, après quelques années, vit de nouveau la dissociation des deux compétences entre un état-major des armées dépendant du ministère de la Défense et le SGDN, placé sous l'autorité du Premier ministre. Dans le même temps, l'évolution de la notion et des réalités de la Défense et de la Sécurité orientait les missions du SGDN vers un cadre plus large.
Au , le secrétariat général de la Défense nationale élargit ses missions et devient le secrétariat général de la Défense et de la Sécurité nationale en absorbant le secrétariat général du conseil de la sécurité intérieure (SGCSI) créé en 2002,.
Organisation et missions
Le SGDSN est responsable des plans gouvernementaux de défense et de sécurité, dont le plan Vigipirate.
Le SGDSN assiste le Premier ministre dans l'exercice de ses responsabilités en matière de Défense et de Sécurité nationale. À ce titre:
il anime et coordonne les travaux interministériels relatifs à la politique de Défense et de Sécurité nationale et aux politiques publiques qui y concourent;
en liaison avec les départements ministériels concernés, il suit l'évolution des crises et des conflits internationaux pouvant affecter les intérêts de la France en matière de Défense et de Sécurité nationale et étudie les dispositions susceptibles d'être prises; il est associé à la préparation et au déroulement des négociations ou des réunions internationales ayant des implications sur la Défense et la Sécurité nationale et est tenu informé de leurs résultats;
il propose, diffuse et fait appliquer et contrôler les mesures nécessaires à la protection du secret de la défense nationale; il prépare la réglementation interministérielle en matière de Défense et de Sécurité nationale, en assure la diffusion et en suit l'application;
en appui du coordonnateur national du renseignement et de la lutte contre le terrorisme, il concourt à l'adaptation du cadre juridique dans lequel s'inscrit l'action des services de renseignement et à la planification de leurs moyens et assure l'organisation des groupes interministériels d'analyse et de synthèse en matière de renseignement;
il élabore la planification interministérielle de Défense et de Sécurité nationale, veille à son application et conduit des exercices interministériels la mettant en œuvre; il coordonne la préparation et la mise en œuvre des mesures de Défense et de Sécurité nationale incombant aux divers départements ministériels et s'assure de la coordination des moyens civils et militaires prévus en cas de crise majeure;
il s'assure que le président de la République et le Gouvernement disposent des moyens de commandement et de communications électroniques nécessaires en matière de Défense et de Sécurité nationale et en fait assurer le fonctionnement;
il propose au Premier ministre et met en œuvre la politique du Gouvernement en matière de sécurité des systèmes d'information; il dispose à cette fin du service à compétence nationale dénommé «Agence nationale de la sécurité des systèmes d'information»;
il veille à la cohérence des actions entreprises en matière de politique de recherche scientifique et de projets technologiques intéressant la Défense et la Sécurité nationale et contribue à la protection des intérêts nationaux stratégiques dans ce domaine.
l'opérateur des systèmes d'information interministériels classifiés (OSIIC) osiic.fr, créé en par fusion du centre de transmissions gouvernemental (CTG), créé en par le gouvernement provisoire, et de la sous-direction numérique (SDN) de l'ANSSI,;
Le Groupement interministériel de contrôle (GIC) est un service à compétence nationale rattaché fonctionnellement au Premier ministre et administrativement au SGDSN. Ce dernier est notamment chargé de la passation des marchés, de la gestion budgétaire et financière et du recrutement des agents du service.
Stéphane Bouillon, «Le secrétariat général de la défense et de la sécurité nationale, socle interministériel de la protection française», Administration, Association du corps préfectoral et des hauts fonctionnaires du ministère de l'Intérieur, no283 «L'esprit de défense», , p.23–25 (DOI10.3917/admi.283.0023, lire en ligne).
Guillaume Denglos (dir.) et Philippe Vial (dir.), Au cœur de l'État: Une histoire du Secrétariat général de la défense et de la sécurité nationale, XIXe – XXIesiècles, Paris, Nouveau Monde Éditions, , 754p. (ISBN978-2-38094-346-7).
Béatrice Guillaumin, «Le Secrétariat général de la défense et de la sécurité nationale: Acteur incontournable de la réponse de l'État face aux crises?», dans Xavier Dupré de Boulois (dir.) et Xavier Philippe (dir.), Gouverner et juger en période de crise, Le Kremlin-Bicêtre, Mare et Martin, coll.«Collection de l'Institut des sciences juridique et philosophique de la Sorbonne» (no71), , 342p. (ISBN978-2-84934-691-4, HALhal-03846150), p.67–79.
*François-Xavier Le Pelletier de Woillemont occupe par intérim la fonction entre le départ de Claire Landais et la nomination de Stéphane Bouillon.
**Cédric Gaudillière occupe par intérim la fonction entre le départ de Stéphane Bouillon et la nomination de Nicolas Roche.
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