Spoligotypage

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Le spoligotypage, de l'anglais Spacer Oligonucleotide typing, est une technique de génotypage permettant d'identifier des séquences DR (Direct Repeat) au sein de la région CRISPR. Il existe un fort polymorphisme de ces séquences DR, par exemple dans le complexe Mycobacterium tuberculosis.

Cette technique permet d'identifier des sous-espèces de Mycobacterium tuberculosis (sous-espèces tuberculosis, bovis, africanum, etc).

Notes et références

  1. ↑ (en) Gary Napier, David Couvin, Guislaine Refrégier et Christophe Guyeux, « Comparison of in silico predicted Mycobacterium tuberculosis spoligotypes and lineages from whole genome sequencing data », Scientific Reports, vol. 13, no 1,‎ , p. 11368 (ISSN 2045-2322, PMID 37443186, PMCID PMC10345134, DOI 10.1038/s41598-023-38384-3, lire en ligne Accès libre, consulté le )