Selon Agrippa, l'alphabet était utilisé alors pour un usage ésotérique par les cabalistes et est semblable à l’alphabet Celestial et à l’alphabet Malachim. Il dérive de l’alphabet hébreu.
Le nom doit faire référence au passage de l’Euphrate par les Hébreux à leur retour de Babylone pour reconstruire le temple.
Il est fait mention de l’alphabet Transitus fluvii dans le film Le Projet Blair Witch.