Metawithius nepalensis est une espèce de pseudoscorpions de la famille des Withiidae.
Cette espèce a été décrite sous le protonyme Withius nepalensis par Beier en 1974. Elle est placée dans le genre Metawithius par Harvey en 2015.
Son nom d'espèce, composé de nepal et du suffixe latin -ensis, « qui vit dans, qui habite », lui a été donné en référence au lieu de sa découverte, le Népal.