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Au sens courant, autochtone qualifie ce qui habite en son lieu d'origine.
Autochtone peut aussi prendre les sens spécialisés suivants :
- Autochtone, en ethnologie, un membre d'un peuple autochtone ou un qualificatif de ce qui est lié à ce peuple ;
- Autochtone, au Canada, un membre des Premières Nations, des Inuit ou des Métis ;
- Autochtone, un synonyme d'Amérindiens, les peuples présents en Amérique avant la colonisation européenne et les descendants de ces peuples ;
- autochtone, en biologie, un synonyme d'indigène, le caractère local d'une espèce (animale, végétale, fongique…) ;
- autochtone, un terrain qui n'a pas été déplacé par un chevauchement ou une érosion ;
- autochtone, en mythologie grecque, un enfant né spontanément de la terre, sans parents.