ABC-transzporter

Az ABC-transzporterek (ATP-binding casette transporters, ATP-kötő kazetta transzporterek) az egyik legnagyobb és legősibb fehérje szupercsalád tagjai. Képviselői megtalálhatók minden létező taxonban a prokariótáktól az emberig. Ezek a transzmembrán fehérjék rendkívül sokféle anyag membránon való átjuttatását végezhetik, a sejtmembránon vagy a sejt belső membránjain keresztül. A transzportált anyagok lehetnek például metabolitok, lipidek, szteroidok, gyógyszerek. Az ABC-transzporterek kulcsszerepet játszhatnak a cisztás fibrózis, tumorrezisztencia, multidrog-rezisztencia, számos örökletes betegség és más fontos biológiai folyamatok során. A szupercsalád tagjait az ATP-kötő doménjük (vagy doménjeik) -más néven NBF (nucleotide binding fold)- aminosavsorrendje és elrendeződése alapján soroljuk ide.

Alcsaládok

Emberben

Emberben jelenleg 50 ABC transzporter ismert, ezeket hét alcsaládba soroljuk.

Család	Funkció	Példa
ABCA	Többek között koleszterin- és lipidtranszportért felelhetnek.	ABCA12
ABCB	Némelyik vér-agy gátban, mások a májban, mitokondriumokban fordulnak elő. Peptideket és epét transzportálhatnak, például.	ABCB5
ABCC	Ionok, sejtfelszíni receptorok, toxinok transzportját végzik. Közéjük tartozik a CFTR fehérje, melynek hiánya, hibás működése cisztikus fibrózist okoz.	ABCC6
ABCD	Mind a peroxiszómákban működnek.	ABCD1
ABCE/ABCF	Az ide tartozó fehérjék nem transzporterek, hanem csupán az ATP-kötő domént tartalmazzák, transzmembrán domén nélkül. A fehérjeszintézist és génexpressziót szabályozzák.	ABCE:RLI
ABCG	Lipidek, epe, koleszterin és más szteroidok transzportjáért felelnek.	ABCG1

Emberi transzporterek teljes listája itt található: .

Prokarióta alcsaládok

Importerek

Carbohydrate Uptake Transporter-1 (CUT1)
Carbohydrate Uptake Transporter-2 (CUT2)
Polar Amino Acid Uptake Transporter (PAAT)
Peptide/Opine/Nickel Uptake Transporter (PepT)
Hydrophobic Amino Acid Uptake Transporter (HAAT)
Sulfate/Tungstate Uptake Transporter (SulT)
Phosphate Uptake Transporter (PhoT)
Molybdate Uptake Transporter (MolT)
Phosphonate Uptake Transporter (PhnT)
Ferric Iron Uptake Transporter (FeT)
Polyamine/Opine/Phosphonate Uptake Transporter (POPT)
Quaternary Amine Uptake Transporter (QAT)
Vitamin B12 Uptake Transporter (B12T)
Iron Chelate Uptake Transporter (FeCT)
Manganese/Zinc/Iron Chelate Uptake Transporter (MZT)
Nitrate/Nitrite/Cyanate Uptake Transporter (NitT)
Taurine Uptake Transporter (TauT)
Cobalt Uptake Transporter (CoT)
Thiamin Uptake Transporter (ThiT)
Brachyspira Iron Transporter (BIT)
Siderophore-Fe3+ Uptake Transporter (SIUT)
Nickel Uptake Transporter (NiT)
Nickel/Cobalt Uptake Transporter (NiCoT)
Methionine Uptake Transporter (MUT)
Lipid Exporter (LipidE)

Exporterek

Capsular Polysaccharide Exporter (CPSE)
Lipooligosaccharide Exporter (LOSE)
Lipopolysaccharide Exporter (LPSE)
Teichoic Acid Exporter (TAE)
Drug Exporter-1 (DrugE1)
Lipid Exporter (LipidE)
Putative Heme Exporter (HemeE)
β-Glucan Exporter (GlucanE)
Protein-1 Exporter (Prot1E)
Protein-2 Exporter (Prot2E)
Peptide-1 Exporter (Pep1E)
Peptide-2 Exporter (Pep2E)
Peptide-3 Exporter (Pep3E)
Probable Glycolipid Exporter (DevE)
Na+ Exporter (NatE)
Microcin B17 Exporter (McbE)
Drug Exporter-2 (DrugE2)
Microcin J25 Exporter (McjD)
Drug/Siderophore Exporter-3 (DrugE3)
(Putative) Drug Resistance ATPase-1 (Drug RA1)
(Putative) Drug Resistance ATPase-2 (Drug RA2)
Macrolide Exporter (MacB)
Peptide-4 Exporter (Pep4E)
3-component Peptide-5 Exporter (Pep5E)
Lipoprotein Translocase (LPT)
β-Exotoxin I Exporter (βETE)
AmfS Peptide Exporter (AmfS-E)
SkfA Peptide Exporter (SkfA-E)
CydDC Cysteine Exporter (CydDC-E)

Jegyzetek

↑ Jones, P. M.; George, A. M.; Cellular and Molecular Life Sciences. 2004, 61, 682-699.
1 2 Saier MH Jr.; Microbiol Mol Biol Rev., 2000, 64(2), 354-411 TCDB

Források

Dean, Michael. The Human ATP-Binding Cassette (ABC) Transporter Superfamily. Bethesda (MD):National Library of Medicine (US), NCBI; 2002 November.
Szentpétery, Z.; Kern, A.; Liliom, K.; Sarkadi, B.; Váradi, A.; Bakos, E.; J. Biol. Chem. 2004, 279, 41670-41678. Archiválva 2008. február 9-i dátummal a Wayback Machine-ben
ABC Nomenclature Committee. ABC-Transporter Genes nomenclature scheme, enacted October 22, 1999. Verified availability August 2, 2005.
Fitzgerald, M. L.; Okuhira, K.; Short, G. F.; Manning, J. J.; Bell, S. A.; Freeman, M. W.; J. Biol. Chem. 2004, 279, 48477-48485.
Wain, H. M.; White, J. A.; Povey, S.
Deeley, R. G.
Matsson, P. ATP-Binding Cassette Efflux Transporters and Passive Membrane Permeability in Drug Absorption and Disposition. Acta Universitatis Upsaliensis.

További információk

ABC transzporterek csoportjai

Biológiaportál • összefoglaló, színes tartalomajánló lap

[1] Jones, P. M.; George, A. M.; Cellular and Molecular Life Sciences. 2004, 61, 682-699.

[saier2000-2] 1 2 Saier MH Jr.; Microbiol Mol Biol Rev., 2000, 64(2), 354-411 TCDB