Nyomozásai
1986-ban Deer, első nyomozásainak egyikében leleplezte az ausztrál Deakin Egyetem brit tudósának, prof. Michael Briggsnek a fogamzásgátló tabletták biztonságosságáról írt kutatását. Deer riportja feltárta, hogy Briggs számos tanulmányát meghamisította annak érdekében, hogy a termék keringési rendszerre gyakorolt hatása biztonságosnak tűnjön. A kutatást nagy részben a Schering AG nevű német gyógyszergyár finanszírozta.
1994-ben a Wellcome Trusttal kapcsolatos nyomozása vezetett ahhoz, hogy az Egyesült Királyságban kivontak a forgalomból egy sikeresnek számító antibiotikumot, a Septrint (Bactrim néven is árulták), és hogy a Wellcome Trust eladta gyógyszergyártó leányvállalatát.
2005-ben, miután kivonták a Vioxx nevű fájdalomcsillapítót, Deer nyomozást folytatott arról, kik felelősek a gyógyszer forgalomba hozataláért.
2006-ban saját, „Dispatches” című dokumentumsorozatának „A félresikerült gyógyszerkísérlet” (The drug trial that went wrong) című epizódjában a TGN1412 kísérleti monoklonális antitest után nyomozott. A filmet jelölték a Royal Television Society díjára is.
2008-ban Deer nyomozását követően Raj Persaud tévés pszichiátert felfüggesztették az orvosi hivatás gyakorlása alól, és az akadémiai tagságáról is lemondott, miután bűnösnek találták plagizálás miatt.
Az MMR védőoltással kapcsolatos viták
2004 és 2010 közötti riportsorozatában Deer az MMR oltásokkal kapcsolatos aggályokat vizsgálta, amelyeket Andrew Wakefield 1998-ban a Lancet orvosi szaklapban publikált kutatása keltett. Deer kiderítette, hogy Wakefieldnek több el nem ismert érintettsége volt az eset kapcsán, manipulálta a bizonyítékokat, és ő a felelős azért, amit a British Medical Journal című orvosi szaklap később „jól kidolgozott csalásnak” nevezett.
Deer nyomozása a brit orvosi kamara valaha volt leghosszabb vizsgálatához vezetett. 2010 januárjában a kamara Wakefieldet tisztességtelennek, etikátlannak és érzéketlennek titulálta, 2010 májusában pedig kizárták az Egyesült Királyság orvosai közül. Deer megállapításaira alapozva, a Lancet 2004 februárjában részben, 2010 februárjában pedig – az orvosi kamara döntését követően – teljes egészében visszavonta Wakefield cikkét. 2011-ben a British Medical Journalben a szerkesztők jóváhagyásával Deer megjelentette az ügyben tett megállapításait.
2004. november 14-én a Channel 4 tévécsatorna „Dispatches” című sorozatában leadta Deer dokumentumfilmjét, amelynek címe: „MMR: Amiről nem beszéltek” (MMR: What they didn’t tell you). Wakefield válaszként beperelte Deert, az ügyet azonban ejtették, és Wakefieldet az eljárás és az alperesek költségeinek a megtérítésére kötelezték. 2012 januárjában Wakefield ismét beperelte Deert a British Medical Journallel együtt, ezúttal Texasban, ám az ügyet mind a kerületi, mind a fellebbviteli bíróságon ejtették, Wakefieldet pedig ismét az eljárási költségek megtérítésére kötelezték.
