Entrez

Az Entrez logója

Az Entrez (IPA: ɒnˈtreɪ) Global Query Cross-Database Search System összetett keresést lehetővé tevő keresőmotor vagy portál, mely lehetővé teszi több különböző orvostudományi adatbázis keresését a Biotechnológiai Információk Nemzeti Központja (NCBI) oldalán. Az NCBI a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) része, mely a Nemzeti Egészségügyi Intézet része, mely az Egyesült Államok Egészségügyi Minisztériumának része. Az „Entrez” név (mely franciául azt jelenti: „Lépjen be”) a nyilvánosság számára NLM által elérhetővé tett tartalmak keresésének lehetőségére utal.

Az Entrez globális lekérdezése integrált kereső és gyűjtőrendszer, mely lehetővé teszi minden adatbázis elérését egy lekérdezéssel és felhasználói felülettel. Hasonló szekvenciákat, szerkezeteket és hivatkozásokat is ki tud gyűjteni. Az Entrez gén- és fehérjeszekvenciák, valamint kromoszómatérképek nézeteit is be tudja mutatni. Egyes kézikönyvek elérhetők az Entrez rendszeren keresztül.

Funkciók

Az Entrez kezdőlapja alapértelmezés szerint a globális lekérdezéshez nyújt hozzáférést. Minden, az Entrez által indexelt adatbázis kereshető lekérdezéssel. A rendszer támogatja a Boole-operátorokat és a keresőcímkéket a keresés adott részeinek bizonyos területekre való korlátozásához. Egységes eredménylistát ad vissza, mely minden adatbázisban megmutatja a találatszámot, melyek összefüggnek az adott adatbázis tényleges eredményeivel.

Az Entrez hasonló felületet biztosít mindegyik adatbázis keresésére és a keresési eredmények pontosítására. A Limits funkció lehetővé teszi a keresés szűkítését. A History funkció a frissen elvégzett lekérdezések számozott listáját adja. Az előző lekérdezések eredményei számmal hivatkozhatók és Boole-operátorokkal is használhatók. A keresési eredmények elmenthetők átmenetileg a vágólapra. A MyNCBI-fiókkal rendelkező felhasználók véglegesen elmenthetik kereséseiket, és kérhetik a frissítésükről szóló értesítéseket az új eredmények e-mailben való elküldésével. Gyakran használják forrásként hallgatók és tudósok egyaránt.

Adatbázisok

Az Entrez az alábbi adatbázisokban keres:

Elérés

Az Entrez-ban való adatlekérdezésekhez használható keresőformák mellett az NCBI biztosítja az Entrez Programming Utilitiest (eUtils) a lekérdezési eredmények közvetlenebb eléréséhez. Ez speciális URL-ek NCBI-szerverhez való küldésével és az XML-válasz értelmezésével érhető el. 2015 júliusáig volt elérhető az eUtils SOAP-felület.

Történet

1991-ben jelent meg az Entrez CD-formátumban. 1993-ban a szoftver kliens-szerver változata is megjelent, melyhez internetelérés kellett. 1994-ben az NCBI weblapot hozott létre, az Entrez e kezdeti kiadás része volt. 2001-ben megjelent az Entrez könyvespolc, 2003-ban az Entrez-génadatbázis.

Jegyzetek

  1. ↑ "Definition of 'entrez'". Collins Dictionary (Internet).
  2. ↑ NCBI Resource Coordinators (2012). "Database resources of the National Center for Biotechnology Information". Nucleic Acids Research. 41 (Adatbázis): D8–D20. doi:10.1093/nar/gks1189. PMC 3531099. PMID 23193264.
  3. ↑ "Home - Gene - NCBI".
  4. ↑ Entrez Utilities. National Center for Biotechnology Information (US). 2010.
  5. ↑ The E-utility Web Service (SOAP). National Center for Biotechnology Information (US). 2015. január 23.
  6. ↑ Smith, Kent. "A Brief History of NCBI's Formation and Growth". The NCBI Handbook [Internet]. 2nd edition. Hozzáférés: 2014. május 3.

Fordítás

További információk