Hadesarchaea

Hadesarchaea
Rendszertani besorolás
Domén: Archeák (Archaea)
Ország: Euryarchaeota
Törzs: Hadesarchaeota
McGonigle et al. 2019
Osztály: Hadesarchaea
Baker et al. 2016
Rend: Hadesarchaeales
Család: Hadesarchaeaceae
Szinonimák
  • Hadarchaeota Chuvochina et al. 2019
  • Hadarchaeia Chuvochina et al. 2019
Nemzetségek
Hivatkozások
A Wikifajok tartalmaz Hadesarchaea témájú rendszertani információt.

A Hadesarchaea, korábbi nevén a dél-afrikai aranybányában talált egyéb Euryarchaea-csoport mély bányákban, hévforrásokban, tengeri üledékekben és egyéb föld alatti környezetekben talált termofil archeák csoportja.

Nevezéktan

Eredeti nevük dél-afrikai aranybányában talált egyéb Euryarchaea-csoport (SAGMEG) volt első felfedezésük helye után. A Hadesarchaea nevet Baker et al. javasolták 2016-ban Hádész, az alvilág görög istene után.

Filogenetika

Korábban a Hadesarchaea csak filogenetikai helyzete alapján volt ismert. 2016-ban metagenomikai teljes metagenom-szekvenálással lehetséges volt néhány közel teljes archeagenom összeállítása. A Hadesarchaea genomja közel 1,5 Mbp, 0,5 Mbp-ral kisebb a legtöbb archeáénál. Ezeket laboratóriumban nem sikerült még tenyészteni, de anyagcseréjük ismert a genomrekonstrukcióból. A Hadesarchaea metanogén ősből fejlődhetett más metanogén archeákhoz való genetikai hasonlóság alapján.

Taxonómia

Élőhely és anyagcsere

Először egy dél-afrikai aranybányában fedezték fel mintegy 3 km mélységben, ahol külső oxigén vagy fény nélkül tudnak élni. Később megtalálták a White Oak folyó torkolatánál Észak-Karolinában, valamint a Yellowstone Nemzeti Park Alsó Culex-medencéjében. E területek hőmérséklete közel 70 °C, és erősen lúgosak. 16S rRNS-kutatások alapján ősi bányaterületek talajában is jelen lehetnek a németországi Keleti-Harz-régióban.

Megtalálták tengeri környezetben is. Ilyen területek például a hideg nedves területek a Dél-kínai-tengerben. A Hadesarchaea a terület domináns tagja, ahol gáz-hidrát-tartalmú üledékek vannak, ahol a biogeokémiai ciklusokban fontosak. Feltehetően a Hadesarchaea a szén-dioxid és a víz reakciójában fontos e környezetben. A Hadesarchaeát megtalálták tengerfenék alatti élőhelyeken a Guaymas-medence és a Sonora Margin területén a Kaliforniai-öböl körül.

In addition to being present in marine sediments, mines, and hot springs, Hadesarchaea has been identified in the gut microbiome of certain fish species. The freshwater pufferfish (Tetraodon cutcutia), native to India, Assam, Bihar, and West Bengal, was found to have Hadesarchaea present in their gut microbiome. Hadesarchaea was found to be in the second most abundant in the archaeal community of the freshwater pufferfish. This was found to be similar to community abundance found in the gut of carnivorous Salmon and herbivorous grass carp. While Hadesarchaea are found to be in such high abundance for these environments, it is not completely known how they influence the health and trophic level of these fish.

A Hadesarchaea az ismert archeák közt egyedi abban, hogy a szén-monoxidot és a vizet szén-dioxiddá és oxigénné alakítja hidrogén melléktermékkel. Metagenom-összeállított genomadatok (MAG) alapján rendelkezik a Wood–Ljungdahl-úthoz, a metanogenezishez és az alkánanyagcseréhez kapcsolódó génekkel. A Hadesarchaea-genomok rendelkezhetnek heterotróf módon cukrok és aminosavak anyagcseréjét, valamint nitrit ammóniumionná való redukcióját lehetővé tevő génekkel is. Ezenkívül fontosak jelentős geokémiai folyamatokban is.

Kis genomjuk miatt feltehetően a Hadesarchaea-genomok genom-áramvonalasításon estek át, feltehetően a tápanyag-korlátozás miatt.

Jegyzetek

  1. 1 2 3 4 5 6 7 8 Baker, Brett J.; Saw, Jimmy H.; Lind, Anders E.; Lazar, Cassandra Sara; Hinrichs, Kai-Uwe; Teske, Andreas P.; Ettema, Thijs J. G. (2016. február 16.). "Genomic inference of the metabolism of cosmopolitan subsurface Archaea, Hadesarchaea". Nature Microbiology (angol nyelven). 1 (3): 16002. doi:10.1038/nmicrobiol.2016.2. PMID 27572167.
  2. ↑ Parkes, R. John; Webster, Gordon; Cragg, Barry A.; Weightman, Andrew J.; Newberry, Carole J.; Ferdelman, Timothy G.; Kallmeyer, Jens; Jørgensen, Bo B.; Aiello, Ivano W.; Fry, John C. (2007. július). "Deep sub-seafloor prokaryotes stimulated at interfaces over geological time" (PDF). Nature. 436 (7049): 390–394. doi:10.1038/nature03796. ISSN 0028-0836. PMID 16034418. S2CID 4390333.
  3. 1 2 Biddle, J. F.; Lipp, J. S.; Lever, M. A.; Lloyd, K. G.; Sorensen, K. B.; Anderson, R.; Fredricks, H. F.; Elvert, M.; Kelly, T. J.; Schrag, D. P.; Sogin, M. L. (2006. február 27.). "Heterotrophic Archaea dominate sedimentary subsurface ecosystems off Peru". Proceedings of the National Academy of Sciences. 103 (10): 3846–3851. doi:10.1073/pnas.0600035103. ISSN 0027-8424. PMC 1533785. PMID 16505362.
  4. ↑ Purkamo, Lotta; Bomberg, Malin; Kietäväinen, Riikka; Salavirta, Heikki; Nyyssönen, Mari; Nuppunen-Puputti, Maija; Ahonen, Lasse; Kukkonen, Ilmo; Itävaara, Merja (2016. május 30.). "Microbial co-occurrence patterns in deep Precambrian bedrock fracture fluids". Biogeosciences (angol nyelven). 13 (10): 3091–3108. doi:10.5194/bg-13-3091-2016. hdl:10023/10226. ISSN 1726-4189.
  5. ↑ Bomberg, Malin; Nyyssönen, Mari; Pitkänen, Petteri; Lehtinen, Anne; Itävaara, Merja (2015). "Active Microbial Communities Inhabit Sulphate-Methane Interphase in Deep Bedrock Fracture Fluids in Olkiluoto, Finland". BioMed Research International. 2015: 979530. doi:10.1155/2015/979530. ISSN 2314-6133. PMC 4573625. PMID 26425566.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link)
  6. 1 2 Ettema, Thijs (2016. február 17.). "New paper about the Hadesarchaea published!". Ettema Lab. 2016. március 4. dátummal az eredeti címről archiválva. Hozzáférés: 2016. február 25.
  7. ↑ Takai, K.; Moser, D. P.; DeFlaun, M.; Onstott, T. C.; Fredrickson, J. K. (2001. december 1.). "Archaeal Diversity in Waters from Deep South African Gold Mines". Applied and Environmental Microbiology. 67 (12): 5750–5760. doi:10.1128/aem.67.21.5750-5760.2001. ISSN 0099-2240. PMC 93369. PMID 11722932.
  8. 1 2 "Hadesarchaea: a New Archaeal Class of Cosmopolitan Deep Microbes". Deep Carbon Observatory. 2016. február 18. 2016. március 4. dátummal az eredeti címről archiválva. Hozzáférés: 2016. február 25.
  9. ↑ Evans, Paul N.; Boyd, Joel A.; Leu, Andy O.; Woodcroft, Ben J.; Parks, Donovan H.; Hugenholtz, Philip; Tyson, Gene W. (2019. április). "An evolving view of methane metabolism in the Archaea". Nature Reviews Microbiology (angol nyelven). 17 (4): 219–232. doi:10.1038/s41579-018-0136-7. ISSN 1740-1534. PMID 30664670. S2CID 58572324.
  10. ↑ "GTDB release 06-RS202". Genome Taxonomy Database.
  11. ↑ "ar122_r202.sp_label". Genome Taxonomy Database.
  12. ↑ "Taxon History". Genome Taxonomy Database.
  13. ↑ Sayers; et al. "Hadesarchaea". Biotechnológiai Információk Nemzeti Központja (NCBI) taxonomy database. Hozzáférés: 2021. június 5.
  14. ↑ "Scientists discover new microbes that thrive deep in the earth" (Press release) (angol nyelven). Uppsala University. 2016. február 15. Hozzáférés: 2016. február 25.
  15. ↑ "Underworld microbes shock scientists: Mystery of Hadesarchaea". India Today (angol nyelven). New Delhi. 2016. február 17. 2016. február 24. dátummal az eredeti címről archiválva. Hozzáférés: 2016. február 25.
  16. 1 2 Atherton, Matt (2016. február 15.). "God of the underworld microbes Hadesarchaea discovered living on toxic gas deep below Yellowstone hot springs". IB Times. Hozzáférés: 2016. február 25.
  17. ↑ Köhler, J. Michael; Kalensee, Franziska; Cao, Jialan; Günther, P. Mike (2019. július 9.). "Hadesarchaea and other extremophile bacteria from ancient mining areas of the East Harz region (Germany) suggest an ecological long-term memory of soil". SN Applied Sciences (angol nyelven). 1 (8): 839. doi:10.1007/s42452-019-0874-9. ISSN 2523-3971.
  18. ↑ Cui, Hongpeng; Su, Xin; Chen, Fang; Holland, Melanie; Yang, Shengxiong; Liang, Jinqiang; Su, Pibo; Dong, Hailiang; Hou, Weiguo (2019. február). "Microbial diversity of two cold seep systems in gas hydrate-bearing sediments in the South China Sea". Marine Environmental Research (angol nyelven). 144: 230–239. doi:10.1016/j.marenvres.2019.01.009. PMID 30732863. S2CID 73443709.
  19. ↑ Deb, Sushanta; Das, Lipika; Das, Subrata K. (2020. december). "Composition and functional characterization of the gut microbiome of freshwater pufferfish (Tetraodon cutcutia)". Archives of Microbiology (angol nyelven). 202 (10): 2761–2770. doi:10.1007/s00203-020-01997-7. ISSN 0302-8933. PMID 32737543. S2CID 220888551.
  20. ↑ Ramírez, Gustavo A.; McKay, Luke J.; Fields, Matthew W.; Buckley, Andrew; Mortera, Carlos; Hensen, Christian; Ravelo, Ana Christina; Teske, Andreas P. (2020. szeptember). "The Guaymas Basin Subseafloor Sedimentary Archaeome Reflects Complex Environmental Histories". iScience (angol nyelven). 23 (9): 101459. doi:10.1016/j.isci.2020.101459. PMC 7476861. PMID 32861995.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link)
  21. ↑ Hua, Zheng-Shuang; Wang, Yu-Lin; Evans, Paul N.; Qu, Yan-Ni; Goh, Kian Mau; Rao, Yang-Zhi; Qi, Yan-Ling; Li, Yu-Xian; Huang, Min-Jun; Jiao, Jian-Yu; Chen, Ya-Ting (2019. október 8.). "Insights into the ecological roles and evolution of methyl-coenzyme M reductase-containing hot spring Archaea". Nature Communications. 10 (1): 4574. doi:10.1038/s41467-019-12574-y. ISSN 2041-1723. PMC 6783470. PMID 31594929.
  22. ↑ Wang, Yinzhao; Wegener, Gunter; Hou, Jialin; Wang, Fengping; Xiao, Xiang (2019. március 4.). "Expanding anaerobic alkane metabolism in the domain of Archaea" (PDF). Nature Microbiology. 4 (4): 595–602. doi:10.1038/s41564-019-0364-2. ISSN 2058-5276. PMID 30833728. S2CID 71145257.

Fordítás

Ez a szócikk részben vagy egészben a Hadesarchaea című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.