JARID2

JARID2
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PDB	オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
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	5HYN
識別子
記号	JARID2, JMJ, jumonji and AT-rich interaction domain containing 2
外部ID	OMIM: 601594 MGI: 104813 HomoloGene: 31279 GeneCards: JARID2
遺伝子の位置 (ヒト)
染色体	6番染色体 (ヒト)
終点	15,522,042 bp
遺伝子の位置 (マウス)
染色体	13番染色体 (マウス)
終点	45,075,119 bp
RNA発現パターン
	; ;
	さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	• DNA結合; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • クロマチン結合; • histone demethylase activity; • DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • 転写因子結合; • 血漿タンパク結合; • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • methylated histone binding; • histone H3-tri/di/monomethyl-lysine-4 demethylase activity;
細胞の構成要素	• ESC/E(Z) complex; • 核質; • 細胞核; • histone methyltransferase complex; • ミトコンドリア;
生物学的プロセス	• 細胞分化; • negative regulation of histone methylation; • regulation of transcription, DNA-templated; • 胸腺発生; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • 脾臓発生; • transcription, DNA-templated; • stem cell differentiation; • 多細胞個体の発生; • 中枢神経系発生; • negative regulation of gene expression, epigenetic; • regulation of cell population proliferation; • 肝臓発生; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of cell population proliferation; • positive regulation of histone H3-K9 methylation; • negative regulation of cardiac muscle hypertrophy; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • negative regulation of cardiac muscle cell proliferation; • chromatin organization; • histone demethylation; • クロマチンリモデリング; • histone H3-K4 demethylation, trimethyl-H3-K4-specific;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	3720
	16468
	ENSG00000008083
	ENSMUSG00000038518
	Q92833
	Q62315
	NM_001267040; NM_004973
	NM_001205043; NM_001205044; NM_021878; NM_001360281
	NP_001253969; NP_004964
	NP_001191972; NP_001191973; NP_068678; NP_001347210
	ウィキデータ
閲覧/編集ヒト	閲覧/編集マウス

JARID2（jumonji and AT-rich interaction domain containing 2）は、ヒトではJARID2遺伝子によってコードされているタンパク質である。

JARID2は転写リプレッサーとして機能するタンパク質である。マウスのJarid2タンパク質は胚発生に必要な核内タンパク質として知られており、ARIDドメイン（英語版）と呼ばれるDNA結合ドメインを含有するjumonjiファミリーに属する。Jarid2に関するin vitro研究では、ARIDドメインや他の機能的ドメインがDNA結合、核内局在、転写抑制、そしてPRC2のリクルートに関与していることが明らかにされている。こうした相互作用を担う細胞内機構は大部分が未解明である。

Jarid2は発生に重要な遺伝子の探索過程で、ジーントラップ法によって器官発生に必要な重要な因子として同定された。マウスの器官発生においては、Jarid2は神経管の形成や、肝臓、脾臓、胸腺、心血管系の発生に関与している。心臓組織ではJarid2は継続的に発現しており、胎児期の心臓発生と成体の心臓の双方において支配的役割を果たしていることが強調される。Jarid2の変異モデルでは、重度の心奇形、心室中隔欠損、心室壁の緻密化障害（英語版）、心房拡大がみられる。またJarid2のホモ接合型変異体は、出生直後に致死となる。マウスで過剰発現したJarid2は、細胞周期のマスターレギュレーターであるRbタンパク質との緊密な相互作用によって心筋細胞の増殖を抑制することが報告されている。

出典

1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000008083 - Ensembl, May 2017
1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038518 - Ensembl, May 2017
↑ Human PubMed Reference:
↑ Mouse PubMed Reference:
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1 2 3 “Nitric oxide induces gene expression of jumonji and retinoblastoma 2 protein while reducing expression of atrial natriuretic peptide precursor type B in cardiomyocytes”. Folia Biologica 54 (2): 65–70. (2008). PMID 18498724.
↑ “JARID2 regulates binding of the polycomb repressive complex 2 to target genes in ES cells.”. Nature 464 (7286): 306–10. (2010). Bibcode:2010Natur.464..306P. doi:10.1038/nature08788. PMID 20075857.
↑ “Nucleosome-binding activities within JARID2 and EZH1 regulate the function of PRC2 on chromatin”. Genes & Development 27 (24): 2663–77. (2013). doi:10.1101/gad.225888.113. PMC 3877756. PMID 24352422.
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↑ “Generation of a conditional null allele of jumonji.”. Genesis 44 (9): 407–11. (2000). doi:10.1002/dvg.20221. PMC 2002517. PMID 16900512.

外部リンク

JARID2 protein, human - MeSH・アメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス（英語）

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[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000008083 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038518 - Ensembl, May 2017

[3] Human PubMed Reference:

[4] Mouse PubMed Reference:

[pmid8894700-5] “Characterization of the human jumonji gene”. Hum Mol Genet 5 (10): 1637–41. (Feb 1997). doi:10.1093/hmg/5.10.1637. PMID 8894700.

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[Mysliwiec2-8] “Characterization of zinc finger protein 496 that interacts with jumonji/jarid2.”. FEBS Letters 581 (14): 2633–40. (2007). Bibcode:2007FEBSL.581.2633M. doi:10.1016/j.febslet.2007.05.006. PMC 2002548. PMID 17521633.

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[Pasini-12] “JARID2 regulates binding of the polycomb repressive complex 2 to target genes in ES cells.”. Nature 464 (7286): 306–10. (2010). Bibcode:2010Natur.464..306P. doi:10.1038/nature08788. PMID 20075857.

[Son-13] “Nucleosome-binding activities within JARID2 and EZH1 regulate the function of PRC2 on chromatin”. Genes & Development 27 (24): 2663–77. (2013). doi:10.1101/gad.225888.113. PMC 3877756. PMID 24352422.

[Jung-14] 1 2 “Roles of Jumonji in mouse embryonic development”. Developmental Dynamics 232 (1): 21–32. (2005). doi:10.1002/dvdy.20204. PMID 15580614.

[Mysliwiec-15] “Generation of a conditional null allele of jumonji.”. Genesis 44 (9): 407–11. (2000). doi:10.1002/dvg.20221. PMC 2002517. PMID 16900512.

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関連文献

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