Myb
| Myb-like DNA-binding domain | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 識別子 | |||||||||
| 略号 | Myb_DNA-binding | ||||||||
| Pfam | PF00249 | ||||||||
| InterPro | IPR001005 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00037 | ||||||||
| SCOP | 1irz | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1irz | ||||||||
| CDD | cd00167 | ||||||||
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Mybは、動物や植物に存在する転写因子のファミリーである。ヒトでは、MYBに加えてMYBL1、MYBL2が存在する。さらに拡張したファミリーであるSANT/Mybファミリーには、SANTドメインや、他の類似した全てヘリックスから構成されるホメオボックス様ドメインを有するタンパク質が含まれる。
機能
ウイルス
Mybファミリーの名称は、トリ骨髄芽球症ウイルス（Avian myeloblastosis virus）に存在する遺伝子名に由来する。ウイルス性のMyb（v-Myb）は、5'-(C/T)AAC(G/T)G-3'配列を認識する。その名称が示す通り、このウイルスはニワトリにおいて骨髄芽球症（骨髄性白血病）の原因となる。正常な動物の細胞性のMyb（c-Myb）と比較して、v-MybではC末端の調節ドメインに欠失が生じており、その結果他のがん遺伝子の異常な活性化が引き起こされる。
動物
動物のMybタンパク質は、N末端のDNA結合ドメイン、中央部の転写活性化ドメイン、そして転写抑制に関与するC末端ドメインから構成される。Mybは細胞周期の調節に関与している可能性がある。MYB遺伝子はがん原遺伝子であり、他の遺伝子との組換え（多くの場合C末端ドメインの欠失を伴う）によってがんが引き起こされる場合がある。
植物
植物においても、保存されたMyb DNA結合ドメインを有するMybファミリーが存在する。植物は、R2R3型と呼ばれるタイプのMybドメインによって特徴づけられるMybファミリーを有する。
トウモロコシでは、赤色色素であるフロバフェンはフラボノイド合成経路によるフラバン-4-オールの重合によって合成される。トウモロコシのp1遺伝子はR2R3型Myb転写因子をコードしており、フロバフェン生合成に必要なジヒドロフラボノールレダクターゼ（ジヒドロフラバノノールをフラバン-4-オールへ還元する）をコードするa1遺伝子などを活性化することが知られている。P1が認識するのはCC(T/A)ACC配列であり、脊椎動物のMybが(C/T)AACGG配列を認識するのとは対照的である。
ソルガムではy1遺伝子がトウモロコシp1遺伝子のホモログであり、R2R3型Myb転写因子をコードしている。このタンパク質は、フラバン-4-オールの生合成に必要なカルコンシンターゼ、カルコンイソメラーゼ、ジヒドロフラボノールレダクターゼ遺伝子の発現を調節している。
柑橘類においては、Rubyがアントシアニン産生に必要な遺伝子の活性化を担うMyb転写因子である。大部分の品種ではRubyは機能していないが、ブラッドオレンジにおいてはRubyによってアントシアニン産生がアップレギュレーションされ、特徴的な赤色の果肉が生み出されている。
出典
- 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000118513 - Ensembl, May 2017
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019982 - Ensembl, May 2017
- ↑ Human PubMed Reference:
- ↑ Mouse PubMed Reference:
- ↑ Chen Y, Xu H, Liu J, Zhang C, Leutz A, Mo X (Jul 2007). “The c-Myb functions as a downstream target of PDGF-mediated survival signal in vascular smooth muscle cells”. Biochem Biophys Res Commun 360 (2): 433–6. doi:10.1016/j.bbrc.2007.06.078. PMID 17599807.
- ↑ “Entrez Gene: v-myb myeloblastosis viral oncogene homolog (avian)”. 2025年10月25日閲覧。
- ↑ “UniProt” (英語). UniProt. 2025年11月1日閲覧。
- ↑ Klempnauer KH, Symonds G, Evan GI, Bishop JM (June 1984). “Subcellular localization of proteins encoded by oncogenes of avian myeloblastosis virus and avian leukemia virus E26 and by chicken c-myb gene”. Cell 37 (2): 537–47. doi:10.1016/0092-8674(84)90384-2. PMID 6327074.
- 1 2 George OL, Ness SA (October 2014). “Situational awareness: regulation of the myb transcription factor in differentiation, the cell cycle and oncogenesis”. Cancers 6 (4): 2049–71. doi:10.3390/cancers6042049. PMC 4276956. PMID 25279451.
- ↑ Stracke R, Werber M, Weisshaar B (October 2001). “The R2R3-MYB gene family in Arabidopsis thaliana”. Curr. Opin. Plant Biol. 4 (5): 447–56. Bibcode:2001COPB....4..447S. doi:10.1016/s1369-5266(00)00199-0. PMID 11597504.
- ↑ Himi E, Mares DJ, Yanagisawa A, Noda K (July 2002). “Effect of grain colour gene (R) on grain dormancy and sensitivity of the embryo to abscisic acid (ABA) in wheat”. J. Exp. Bot. 53 (374): 1569–74. doi:10.1093/jxb/erf005. PMID 12096095.
- ↑ Winkel-Shirley B (June 2001). “Flavonoid biosynthesis. A colorful model for genetics, biochemistry, cell biology, and biotechnology”. Plant Physiol. 126 (2): 485–93. doi:10.1104/pp.126.2.485. PMC 1540115. PMID 11402179.
- ↑ Chopra S, Cocciolone SM, Bushman S, Sangar V, McMullen MD, Peterson T (March 2003). “The maize unstable factor for orange1 is a dominant epigenetic modifier of a tissue specifically silent allele of pericarp color1”. Genetics 163 (3): 1135–46. doi:10.1093/genetics/163.3.1135. PMC 1462483. PMID 12663550.
- ↑ Grotewold, E.; Drummond, B. J.; Bowen, B.; Peterson, T. (1994-02-11). “The myb-homologous P gene controls phlobaphene pigmentation in maize floral organs by directly activating a flavonoid biosynthetic gene subset”. Cell 76 (3): 543–553. doi:10.1016/0092-8674(94)90117-1. ISSN 0092-8674. PMID 8313474.
- ↑ Grotewold E, Drummond BJ, Bowen B, Peterson T (1994). “The myb-homologous P gene controls phlobaphene pigmentation in maize floral organs by directly activating a flavonoid biosynthetic gene subset”. Cell 76 (3): 543–554. doi:10.1016/0092-8674(94)90117-1. PMID 8313474.
- ↑ Boddu J, Svabek C, Ibraheem F, Jones AD, Chopra S (2005). “Characterization of a deletion allele of a sorghum Myb gene yellow seedl showing loss of 3-deoxyflavonoids”. Plant Science 169 (3): 542–552. Bibcode:2005PlnSc.169..542B. doi:10.1016/j.plantsci.2005.05.007. INIST:16983977
- ↑ Boddu J, Jiang C, Sangar V, Olson T, Peterson T, Chopra S (January 2006). “Comparative structural and functional characterization of sorghum and maize duplications containing orthologous myb transcription regulators of 3-deoxyflavonoid biosynthesis”. Plant Mol. Biol. 60 (2): 185–99. doi:10.1007/s11103-005-3568-1. PMID 16429259.
- ↑ Butelli E, Licciardello C, Zhang Y, Liu J, Mackay S, Bailey P, Reforgiato-Recupero G, Martin C (2012). “Retrotransposons control fruit-specific, cold-dependent accumulation of anthocyanins in blood oranges”. Plant Cell 24 (3): 1242–55. Bibcode:2012PlanC..24.1242B. doi:10.1105/tpc.111.095232. PMC 3336134. PMID 22427337.
関連文献
- Oh IH, Reddy EP (1999). “The myb gene family in cell growth, differentiation and apoptosis.”. Oncogene 18 (19): 3017–33. doi:10.1038/sj.onc.1202839. PMID 10378697.
- Nicolaides NC, Gualdi R, Casadevall C, Manzella L, Calabretta B (1991). “Positive autoregulation of c-myb expression via Myb binding sites in the 5' flanking region of the human c-myb gene.”. Mol. Cell. Biol. 11 (12): 6166–76. doi:10.1128/mcb.11.12.6166-6176.1991. PMC 361795. PMID 1944282.
- Kalkbrenner F, Guehmann S, Moelling K (1990). “Transcriptional activation by human c-myb and v-myb genes.”. Oncogene 5 (5): 657–61. PMID 2189102.
- Westin EH, Gorse KM, Clarke MF (1990). “Alternative splicing of the human c-myb gene.”. Oncogene 5 (8): 1117–24. PMID 2202948.
- Dasgupta P, Reddy EP (1990). “Identification of alternatively spliced transcripts for human c-myb: molecular cloning and sequence analysis of human c-myb exon 9A sequences.”. Oncogene 4 (12): 1419–23. PMID 2687764.
- Janssen JW, Vernole P, de Boer PA, Oosterhuis JW, Collard JG (1986). “Sublocalization of c-myb to 6q21----q23 by in situ hybridization and c-myb expression in a human teratocarcinoma with 6q rearrangements.”. Cytogenet. Cell Genet. 41 (3): 129–35. doi:10.1159/000132217. PMID 3007038.
- Slamon DJ, Boone TC, Murdock DC, Keith DE, Press MF, Larson RA, Souza LM (1986). “Studies of the human c-myb gene and its product in human acute leukemias.”. Science 233 (4761): 347–51. Bibcode:1986Sci...233..347S. doi:10.1126/science.3014652. PMID 3014652.
- Majello B, Kenyon LC, Dalla-Favera R (1987). “Human c-myb protooncogene: nucleotide sequence of cDNA and organization of the genomic locus.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83 (24): 9636–40. doi:10.1073/pnas.83.24.9636. PMC 387195. PMID 3540945.
- Szczylik C, Skorski T, Ku DH, Nicolaides NC, Wen SC, Rudnicka L, Bonati A, Malaguarnera L, Calabretta B (1993). “Regulation of proliferation and cytokine expression of bone marrow fibroblasts: role of c-myb.”. J. Exp. Med. 178 (3): 997–1005. doi:10.1084/jem.178.3.997. PMC 2191153. PMID 7688794.
- Krieg J, Oelgeschläger M, Janknecht R, Lüscher B (1995). “High affinity DNA binding of native full length c-Myb and differential proteolytic sensitivity of its N- and C-terminal domains.”. Oncogene 10 (11): 2221–8. PMID 7784067.
- Jacobs SM, Gorse KM, Westin EH (1994). “Identification of a second promoter in the human c-myb proto-oncogene.”. Oncogene 9 (1): 227–35. PMID 8302584.
- Favier D, Gonda TJ (1994). “Detection of proteins that bind to the leucine zipper motif of c-Myb.”. Oncogene 9 (1): 305–11. PMID 8302594.
- Glaser R, Lafuse WP, Bonneau RH, Atkinson C, Kiecolt-Glaser JK (1993). “Stress-associated modulation of proto-oncogene expression in human peripheral blood leukocytes.”. Behav. Neurosci. 107 (3): 525–9. doi:10.1037/0735-7044.107.3.525. PMID 8329139.
- Dash AB, Orrico FC, Ness SA (1996). “The EVES motif mediates both intermolecular and intramolecular regulation of c-Myb.”. Genes Dev. 10 (15): 1858–69. doi:10.1101/gad.10.15.1858. PMID 8756344.
- Vorbrueggen G, Lovrić J, Moelling K (1997). “Functional analysis of phosphorylation at serine 532 of human c-Myb by MAP kinase.”. Biol. Chem. 377 (11): 721–30. doi:10.1515/bchm3.1996.377.11.721. PMID 8960373.
- Tavner FJ, Simpson R, Tashiro S, Favier D, Jenkins NA, Gilbert DJ, Copeland NG, Macmillan EM, Lutwyche J, Keough RA, Ishii S, Gonda TJ (1998). “Molecular cloning reveals that the p160 Myb-binding protein is a novel, predominantly nucleolar protein which may play a role in transactivation by Myb.”. Mol. Cell. Biol. 18 (2): 989–1002. doi:10.1128/MCB.18.2.989. PMC 108811. PMID 9447996.
- Hedge SP, Kumar A, Kurschner C, Shapiro LH (1998). “c-Maf interacts with c-Myb to regulate transcription of an early myeloid gene during differentiation.”. Mol. Cell. Biol. 18 (5): 2729–37. doi:10.1128/mcb.18.5.2729. PMC 110652. PMID 9566892.
- Leverson JD, Koskinen PJ, Orrico FC, Rainio EM, Jalkanen KJ, Dash AB, Eisenman RN, Ness SA (1998). “Pim-1 kinase and p100 cooperate to enhance c-Myb activity.”. Mol. Cell 2 (4): 417–25. doi:10.1016/S1097-2765(00)80141-0. PMID 9809063.
- Thompson MA, Rosenthal MA, Ellis SL, Friend AJ, Zorbas MI, Whitehead RH, Ramsay RG (1998). “c-Myb down-regulation is associated with human colon cell differentiation, apoptosis, and decreased Bcl-2 expression.”. Cancer Res. 58 (22): 5168–75. PMID 9823328.
- Verbeek W, Gombart AF, Chumakov AM, Müller C, Friedman AD, Koeffler HP (1999). “C/EBPepsilon directly interacts with the DNA binding domain of c-myb and cooperatively activates transcription of myeloid promoters.”. Blood 93 (10): 3327–37. doi:10.1182/blood.V93.10.3327. PMID 10233885.