NDC1

NDC1

識別子

NDC1, NET3, TMEM48, NDC1 transmembrane nucleoporin

外部ID

OMIM: 610115 MGI: 1920037 HomoloGene: 41224 GeneCards: NDC1

遺伝子の位置 (ヒト)

染色体	1番染色体 (ヒト)

バンド	データ無し	開始点	53,765,478 bp
バンド	データ無し	終点	53,838,463 bp

遺伝子の位置 (マウス)

染色体	4番染色体 (マウス)

バンド	データ無し	開始点	107,224,981 bp
バンド	データ無し	終点	107,273,543 bp

RNA発現パターン

さらなる参照発現データ

遺伝子オントロジー
分子機能	• structural constituent of nuclear pore
細胞の構成要素	• 細胞質 • integral component of membrane • 核膜 • nuclear envelope • 膜 • 細胞膜 • 核膜孔 • actin cytoskeleton • 細胞核 • スピンドル極体 • nuclear pore transmembrane ring • 宿主細胞
生物学的プロセス	• mRNA transport • nuclear pore complex assembly • viral transcription • protein sumoylation • mitotic nuclear membrane disassembly • homologous chromosome pairing at meiosis • 精子発生 • タンパク質輸送 • regulation of cellular response to heat • viral process • mRNA export from nucleus • intracellular transport of virus • tRNA export from nucleus • spindle pole body duplication • regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • 輸送 • nuclear pore organization
出典:Amigo / QuickGO

オルソログ

種

ヒト

マウス


55706


72787


ENSG00000058804


ENSMUSG00000028614


Q9BTX1


Q8VCB1

RefSeq
(mRNA)


NM_001168551 NM_018087


NM_028355

RefSeq
(タンパク質)


NP_001162023 NP_060557


NP_082631

場所
(UCSC)

Chr 1: 53.77 – 53.84 Mb

Chr 1: 107.22 – 107.27 Mb

PubMed検索

ウィキデータ

閲覧/編集ヒト

閲覧/編集マウス

ヌクレオポリンNDC1（英語: Nucleoporin NDC1）は、ヒトにおいてTMEM48 遺伝子にコードされているタンパク質である。核膜孔複合体にアラジン（英語版）を固定する。　

出典

1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000058804 - Ensembl, May 2017
1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028614 - Ensembl, May 2017
↑ Human PubMed Reference:
↑ Mouse PubMed Reference:
↑ “Topology of yeast Ndc1p: predictions for the human NDC1/NET3 homologue”. Anat Rec A Discov Mol Cell Evol Biol 288 (7): 681–94. (Aug 2006). doi:10.1002/ar.a.20335. PMC 3049984. PMID 16779818.
↑ “Nuclear membrane proteins with potential disease links found by subtractive proteomics”. Science 301 (5638): 1380–2. (Sep 2003). doi:10.1126/science.1088176. PMID 12958361.
↑ “Entrez Gene: TMEM48 transmembrane protein 48”. 2019年7月23日閲覧。
↑ Kind, Barbara; Koehler, Katrin; Lorenz, Mike; Huebner, Angela (December 2009). “The nuclear pore complex protein ALADIN is anchored via NDC1 but not via POM121 and GP210 in the nuclear envelope”. Biochemical and Biophysical Research Communications 390 (2): 205–210. doi:10.1016/j.bbrc.2009.09.080.

参考文献

“Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. (2003). doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
“Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs.”. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. (2004). doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
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“Phosphoproteome analysis of the human mitotic spindle.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (14): 5391–6. (2006). doi:10.1073/pnas.0507066103. PMC 1459365. PMID 16565220.
“The conserved transmembrane nucleoporin NDC1 is required for nuclear pore complex assembly in vertebrate cells.”. Mol. Cell 22 (1): 93–103. (2006). doi:10.1016/j.molcel.2006.02.015. PMID 16600873.
“NDC1: a crucial membrane-integral nucleoporin of metazoan nuclear pore complexes.”. J. Cell Biol. 173 (4): 509–19. (2006). doi:10.1083/jcb.200601001. PMC 2063861. PMID 16702233.
“The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1.”. Nature 441 (7091): 315–21. (2006). doi:10.1038/nature04727. PMID 16710414.
“Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks.”. Cell 127 (3): 635–48. (2006). doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.