Seizoen 1: Big Bad BeetleBorgs
De serie speelt zich af in het fictieve plaatsje Charterville, en gaat over drie kinderen genaamd Drew, Roland en Jo. In de eerste aflevering brengen ze in verband met een weddenschap een bezoek een al jaren verlaten huis genaamd Hillhurst. In dit huis bevrijden ze per ongeluk de geest Flabber uit een orgel. Hij vervult uit dank voor zijn vrijlating de grootste wens van de drie, en verandert hen in hun favoriete striphelden: de BeetleBorgs. De wens krijgt echter een negatieve bijwerking wanneer de Magnavors, de schurken uit de stripreeks, per ongeluk uit de strip naar de echte wereld ontsnappen. Tezamen met hun nieuw verkregen krachten en wapens gaan de BeetleBorgs de strijd aan met de Magnavors en hun leider Vexor.
Terwijl de serie vordert doen nieuwe personages hun intrede. Zo ontmoeten de BeetleBorgs Art Fortunes, de tekenaar van de BeetleBorg-strips. In een poging de BeetleBorgs te verslaan maakt Vexor zijn eigen BeetleBorg: ShadowBorg. Deze slaagt erin de krachten van de drie BeetleBorgs te stelen, maar hij wordt zelf verslagen door een tijdelijke vierde BeetleBorg: Josh.
In de laatste twee afleveringen van seizoen 1 steelt Vexor een tekening van een nieuw monster genaamd Nukus, en brengt hem tot leven. Nukus doet alsof hij voor Vexor werkt, en maakt voor hem een extra sterk monster genaamd Borgslayer. In werkelijkheid heeft Nukus echter zijn eigen plannen. Hij verraadt aan de BeetleBorgs hoe ze Borgslayer moeten verslaan. De vernietiging van Borgslayer veroorzaakt een vortex die de Magnavores terugzuigt hun stripboek in.
De Magnavores zijn verslagen, maar Nukus is er nog wel. En nu de concurrentie is uitgeschakeld, begint hij met het uitvoeren van zijn eigen plannen.
De Beetleborgs bevechten Nukus, maar hij is te sterk en vernietigt hun krachten. Wanneer Nukus ontdekt dat niet Art Fortunes maar diens criminele broer Les Fortunes zijn schepper is, bevrijdt Nukus hem uit de gevangenis om voor hem een leger te maken. Hij behandelt de tekenaar echter als een slaaf.
Omdat Nukus sterker is dan de Magnavores, ontwerpt Art voor de BeetleBorgs nieuwe sterkere wapens en harnassen. Flabber brengt deze harnassen naar de werkelijkheid, waardoor de kinderen veranderen in de sterkere BeetleBorgs Metallix.
Wanneer Nukus en zijn helper Vilor een upgrade krijgen, geeft Flabber de Beetleborgs Roboborg: een kolossale gevechtsmachine. Deze geeft de Beetleborgs ook een powerup door hun oude krachten te fuseren met hun nieuwe.
In een lange verhaallijn getiteld “The Lost Comic” krijgen de BeetleBorgs tijdelijk hulp van de Astralborgs. Nukus krijgt op zijn beurt in deze verhaallijn hulp van de Mantrons.
Tegen het einde van de serie maakt Art Fortunes voor Nukus ook een kolossale gevechtsmachine: Boron. Deze loopt in de finale echter over naar de kant van de BeetleBorgs. Nadat de Beetleborgs vervolgens ook nog eens Nukus’ sterkste monster ooit verslaan, besluit Les Fortunes terug te keren naar de gevangenis. Zonder Les kan Nukus geen nieuwe monsters meer oproepen.
De serie had een open einde daar aan het eind van seizoen 2 Nukus en zijn helpers zijn nog altijd niet verslagen. Bij gebrek aan nieuw beeldmateriaal is de serie nooit voortgezet.
Verenigde Staten
Japan
