Ecotoxicologie is de studie van hoe organismen, ecosystemen en populaties worden beïnvloed door giftige chemicaliën. Dit kan voorkomen op het niveau van de populatie, levensgemeenschap, het ecosysteem en de biosfeer. Het is een multidisciplinair vakgebied dat ecologie en toxicologie combineert. Het laat zien hoe biologische systemen kunnen worden verstoord door vervuilende stoffen zoals pesticiden en insecticiden.

Het wordt gebruikt om te begrijpen en te voorspellen hoe vervuiling de ecosystemen zal beïnvloeden. Met deze kennis is het mogelijk om milieuschade te voorkomen of te beperken. Ook wanneer vervuiling een ecosysteem al heeft aangetast, kunnen ecotoxicologische studies manieren vinden om de ecosysteemstructuren en -functies te herstellen.
Ecotoxicologie verschilt van milieutoxicologie; het onderzoekt de effecten van vervuiling op alle biologische niveaus, van moleculair niveau tot complete ecosystemen. Milieutoxicologie richt zich daarentegen specifiek op de manier waarop organismen worden beïnvloed, met name de menselijke gezondheid.
In Nederland stelt het RIVM de milieukwaliteitsnormen vast. Hierbij gaat zij uit van levenslange blootstelling aan het buitenmilieu. De normen zijn afgeleid van de EU-richtlijnen. De Toelaatbare Dagelijkse Inname (TDI) verschilt per toxische stof en ook aan de mate van blootstelling eraan. Daarom is TDI op bepaalde werkplekken waar er wordt gewerkt met deze stoffen lager. Een werkgever is verantwoordelijk voor het meten of schatten van de blootstelling van de werknemers aan deze stoffen volgens de RI&E (Risico-inventaristie en evaluatie).
| Soort stof | Parameter | Maximale omgevingswaarde (in μg/kg lg/d) |
|---|---|---|
| PCB's | PCB's | 0,01 |
| Gechloreerde koolwaterstoffen | Monochlooranilinen | 0,9 |
| Gechloreerde koolwaterstoffen | Dioxine | 0,000002 |
| Gechloreerde koolwaterstoffen | Chlooraftaleen | 80 |
| Organochloor-bestrijdingsmiddelen | DDT/DDE/DDD | 0,5 |
| Organochloor-bestrijdingsmiddelen | Aldrin | 0,1 |
| Organochloor-bestrijdingsmiddelen | Chloordaan | 0,5 |
| Chloorfenoxy-azijnzuur herbiciden | MCPA | 1,5 |
| Overige organische verbindingen | Ftalaten | 4,0 |
| Overige organische verbindingen | Pyridine | 1 |
| Overige organische verbindingen | Tetrahydrofuran | 10 |
| Overige organische verbindingen | Tetrahydrothiofeen | 180 |