De Harnack-medaille is een wetenschapsprijs die door het Duitse Max-Planck-Gesellschaft uitgereikt wordt.
De in 1924 ingestelde Harnack-medaille is de hoogst mogelijke onderscheiding voor bijzondere verdiensten van het Max-Planck-Gesellschaft. Tot 1936 werd de onderscheiding uitgereikt door diens voorganger, het Kaiser-Wilhelm-Gesellschaft, en vanaf 1953 door het Max-Planck-Gesellschaft. De onderscheiding wordt op basis van een senaatsbesluit van het Max-Planck-Gesellschaft door de president uitgereikt. De naam is afkomstig van Adolf von Harnack, de oprichter en eerste president van het in 1911 opgerichte "Kaiser-Wilhelm-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften".