Televisiewerk
Samenwerking met Glen Morgan
Wong werkte als scenarist en verhaalredacteur aan 21 Jump Street en Booker. Bij Wiseguy en The Commish vervulde hij daarnaast een functie als superviserend producent. Hij was ook verhaalredacteur van Knightwatch. In 1991 werkte hij ook aan The 100 Lives of Black Jack Savage.
In 1993 gingen Wong en Morgan aan de slag bij The X-Files, de serie van Chris Carter. Zij schreven onder meer de afleveringen "Squeeze", "Beyond the Sea", "E.B.E.", "Little Green Men" en "One Breath". Hun werk omvatte ook de introductie van personages als Walter Skinner en het trio The Lone Gunmen. Na een vierjarige overeenkomst met Fox met een waarde van acht miljoen dollar ontwikkelden zij Space: Above and Beyond, dat in 1995–1996 werd uitgezonden.
Na het einde van die serie keerden zij terug naar het vierde seizoen van The X-Files. Zij schreven voor dat seizoen onder meer "Home", de eerste aflevering van de serie waarbij de zender een waarschuwing voor ouders liet zien. Zij combineerden dat werk met scenario's voor Millennium. Wong maakte zijn televisieregiedebuut in 1996 met de aflevering "Musings of a Cigarette-Smoking Man" van The X-Files. Wong en Morgan namen vervolgens de leiding over Millennium. Zij werkten later ook als uitvoerend producent aan The Others.
Later televisiewerk
Wong werkte als regisseur aan Tower Prep en als scenarist, regisseur en mede-uitvoerend producent aan The Event. Bij American Horror Story was hij scenarist en producent. Voor verschillende seizoenen werd hij als mede-uitvoerend of uitvoerend producent voor een Emmy genomineerd.
In 2014 schreef hij mee aan de miniserie Rosemary's Baby. Voor de terugkeer van The X-Files schreef en regisseerde hij "Founder's Mutation", uitgezonden in 2016, en "Ghouli", uitgezonden in 2018. In 2018 regisseerde hij ook "Nothing Lasts Forever", geschreven door Karen Nielsen. Tot zijn latere werk behoren een functie als adviserend producent bij neXt, een scenario voor Almost Paradise en scenario- en regiewerk voor 9-1-1. Zo regisseerde hij in 2024 de aflevering "Buzzkill" van 9-1-1.
Filmwerk
Wong en Morgan schreven het scenario van The Boys Next Door, geregisseerd door Penelope Spheeris. De film wordt als een productie uit 1985 vermeld; de AFI-catalogus dateert de Amerikaanse bioscoopuitbreng in 1986.
Met Final Destination (2000) maakte Wong zijn debuut als regisseur van een speelfilm. Hij schreef mee aan het scenario, samen met Morgan en Jeffrey Reddick. Het project was ontstaan uit een ongevraagd scenario dat Reddick voor The X-Files had geschreven. Wong en Morgan werkten dat materiaal om tot een speelfilm. Vervolgens regisseerde hij The One (2001), een sciencefiction-actiefilm met Jet Li, waarvoor hij eveneens met Morgan het scenario schreef.
In 2003 produceerde Wong Willard, geregisseerd en geschreven door Morgan. Hij keerde terug naar de Final Destination-reeks met Final Destination 3 (2006), waarvoor hij de regie voerde, meeschreef aan het scenario en als producent optrad. Datzelfde jaar was hij producent van Black Christmas; Morgan verzorgde het scenario en de regie. In 2009 regisseerde Wong Dragonball Evolution, met een scenario van Ben Ramsey. De verfilming werd overwegend negatief ontvangen door filmcritici.
Benadering van horror
Bij Final Destination kozen Wong en Morgan ervoor de dood niet als een zichtbare tegenstander te laten verschijnen. In plaats daarvan ontstaat het gevaar uit alledaagse voorwerpen en kettingreacties. Reddick beschreef in The Advocate hoe deze keuze afweek van zijn eerdere scenario, waarin de dood uiteindelijk een lichamelijke vorm aannam. Wong legde in een interview uit 2025 uit dat hij met die opeenvolging van gebeurtenissen zowel verwachtingen wilde oproepen als de toeschouwer wilde verrassen.
