Onderzoek
Fu begon haar onderzoek aan het modelorganisme Arabidopsis en toonde aan dat fenotypische eigenschappen van de plant werden vastgelegd in het genotype. Het belang van deze bevinding werd benadrukt in de Nature Genetics Editorial "Modern lights" ter ere van de 200ste verjaardag van Darwin's geboorte en de 150e verjaardag van de publicatie van The Origin of Species. In 2008 stapte Fu over op het gebied van menselijke genetica.
Leveronderzoek
In samenwerking met Prof. Cisca Wijmenga en Prof. Marten Hofker gebruikte Fu integratieve genomica- en systeemgenetica-benaderingen om de invloed van genetische varianten op complexe ziekten te begrijpen.
Fu bouwde daarbij voort op haar expertise in bioinformatica om gegevens over genetica, genomica, het darmmicrobioom en de gegevens van het onderzoeks-cohort Lifelines, te combineren. Zo identificeerde zij risicofactoren en onderliggende moleculaire routes die individuele variatie in ziekterisico kunnen verklaren en ze verkreeg daarmee ook inzicht in de juiste behandeling voor het individu.
Haar onderzoek onthulde naast pleiotrope effecten van lipidengenen op dyslipidemie, een verstoorde verhouding van vetstoffen (cholesterol) in het bloed, en op diabetes type 2, ook weefselspecifieke genetische effecten op genexpressie. Ze identificeerde een kort RNA (lncRNA) dat betrokken is bij levensvatbaarheid van hepatocyten, een celtype in de lever, in relatie tot een niet-alcoholische vorm van leverontsteking (leververvetting). Dit nieuw ontdekte lncRNA kreeg de naam Liver Cell Viability Associated LncRNA (LIVAR) en is geïndexeerd in de Human Gene Database.
Darmonderzoek
Hierna richtte Fu haar onderzoek op het darmmicrobioom omdat dat, samen met het genotype, een belangrijke rol zou kunnen spelen in gepersonaliseerde geneeskunde. Ze onderzocht met name de gastheer-microbe-interacties. Fu heeft veel microbioomprojecten geïnitieerd, waaronder het Dutch Microbiome Project.
Fu maakt deel uit van het CVON-INCONTROL-consortium dat de rol van het darmmicrobioom bij immunosenescentie (veroudering van het immuunsysteem) en cardiovasculaire gezondheid onderzoekt. Haar onderzoek heeft grootschalige variatie in het darmmicrobioom in de algemene Nederlandse bevolking aan het licht gebracht en de individuele specificiteit van het darmmicrobioom benadrukt. Fu en haar groep hebben bijgedragen aan nieuwe ontdekkingen over de rol van het darmmicrobioom in cardiometabole gezondheid. Onder de cardiometabole ziekten worden gerekend: hart- en vaatziekten, diabetes mellitus, hypertensie, obesitas, dyslipidemie en chronisch nierfalen. Ook werden de verbanden tussen menselijke genetica en darmmicroben onderzocht en gastheer-microbe-dieet-interacties in het metabolisme.. Fu's meer recente onderzoek, gefinancierd door haar NWO VICI- en ERC-consolidatorbeurzen, focust op de causale rol van het darmmicrobioom in gezondheid en ziekte. Om de microbiële genetische variaties en de effecten daarvan te onderzoeken wordt gebruik gemaakt van organ-on-a-chip-technologie. Hiervoor werkt ze samen met het Nederlandse Organ-on-a-chip Initiative.
