Michael Heupel (Bonn, 1955) is een Duitse jazzfluitist.
Heupel studeerde fluit aan het conservatorium in Keulen. Van 1980 tot 1985 was hij lid van de multimediale groep Boury. Sinds 1984 treedy hij ook als solist op, met eigen composities. Met Norbert Stein's Pata Masters toerde hij in Azië, Afrika en Latijns-Amerika. Hij heeft jarenlang samengewerkt met Norbert Stein's Pata-projecten. In een duo met Xu Fengxia speelde hij de basfluit en de subcontrabasfluit. In 1990 begon hij een eigen kwartet. Verder werkte hij samen met musici als Markus Stockhausen, Christoph Haberer, Christopher Dell, Christian Ramond, Jeff Cascaro, Stefan Bauer en Majid Bekkas en speelde hij in het James Choice Orchestra en in de groep Flautomania (met Christian Torkewitz, Christian von Kaphengst en Andreas Molino). Met gitarist Uwe Kropinski heeft hij enkele duo-CD's opgenomen. Heupel doceert jazzfluit aan de Hochschule für Musik Köln.
