Agenesi er et begrep innen medisin som betyr at en kroppsdel eller organ ikke er utviklet fra fødselen. Ordet agenesi har sin opprinnelse i gresk der ordet Genesis betyr skapelse eller forekomst og forstavelsen a refererer til et avslag, eller uten. Aplasi er et beslektet begrep, men omfatter i tillegg til agenesi, tap av kroppsdeler, organer eller vev også etter fødselen.
Mange former for agenesi er dødelige, mens andre forårsaker bare mindre problemer
Andre former for agenesi er fraværet av nyre, lunge, eggstokk, testikkel, blære, skjoldbruskkjertel, og skjelettdeler.