Blue Gene er en navnet på tidligere generasjon superdatamaskiner fra IBM. Prosjektet omfatter de tre generajonene Blue Gene/L, Blue Gene/P og Blue Gene/Q. Disse systemene har ofte ledet rankingene TOP500 og Green500 som viser de aller kraftigste og mest energieffektive superdatamaskiner i verden. Blue Gene systemer har også hatt topp-posisjoner i rankingen Graph500. Prosjektet ble i 2009 tildelt National Medal of Technology and Innovation.
I 2015 avsluttet IBM utviklingen av familien. Deres fokus har vært konsentrert om OpenPOWER Foundation for å videreutvikle Power-arkitekturen.