Bockscar (uttales boxcar, som er en engelsk term for transportvogn, spesielt som godsvogn i forbindelse med tog), er navnet som ble gitt til et av det amerikanske flyvåpenets bombefly av typen Boeing B-29 Superfortress. Bakgrunnen for navnet var «Bock's Car», fordi flyet vanligvis var ført av kaptein Frederick C. Bock fra Greenville i Michigan.
Bockscar er flyet som slapp det andre og siste atomvåpenet noensinne brukt i krigssammenheng. Bomben ble sluppet over Nagasaki, Japan den 9. august1945. Bomben ble kalt «Fat Man».