Celje (tysk Cilli) er en by i Slovenia. Den ligger ved elven Savinja. Celje har 38 079 innbyggere (2017) og er et viktig trafikknutepunkt i landet.
I middelalderen var Celje hovedstaden i det riksumiddelbare grevskapet Cilli. Fra 1456 til 1918 hørte Celje til det habsburgske hertugdømmet Steiermark. På en høyde ved byen ligger det historiske Celje slott.