Hun ble kjent med kvinnebedåreren og marxisten Edward Aveling, som var separert, men ikke formeldt skilt fra sin kone. I 1883 ble de to samboere. Eleanor Marx betraktet forholdet som et papirløst ekteskap, mens Aveling så på det som en ubunden avtale og fortsatte med å ha forhold med andre kvinner. De var begge svært opptatt av Henrik Ibsens forfatterskap, og Eleanor oversatte fire av Ibsens samtidsdramaer til engelsk. Under den første Dukkehjem-forestilling i England opptrådte hun også selv i rollen som Nora.
I 1897 kom Edvard Aveling til å forlate Eleanor Marx, for å etablere relasjoner til en yngre skuespiller. Først da han fikk alvorlige nyreproblemer vendte han tilbake til Eleanor Marx. 31. mars 1898 begikk hun selvmord, bare 43 år gammel. Det skjedde muligens under påvirkning av alle samlivsproblemene.
1877 – The Chicago Anarchists (sammen med Edward Aveling)
1883 – Marx's Theory of Value
1884 – The Irish Dynamiters
1885 - The Factory Hell (sammen med Edward Aveling). London: Socialist League Office
1886 – The Woman Question (sammen med Edward Aveling). London: Swan Sonnenschein & Co
1888 - Shelley's Socialism: Two Lectures. London: privattrykk
1890 – Speech on the First May Day, Hyde Park
1891 – The Factory Hell, a pamphlet (sammen med Edward Aveling)
1891 - "A doll's house" repaired (sammen med Israel Zangwill). London: "Time", March 1891
1891 – The Working Class Movement in America (sammen med Edward Aveling). London: Swan Sonnenschein & Co
Karl Marx: Revolution and Counter - Revolution or Germany in 1848. Edited by Eleanor Marx Aveling. George Allen & Company / Charles Scribners´ sons, London 1896
1896 - The Working Class Movement in England: A Brief Historical Sketch Originally Written for the "Voles lexicon". Redaktør Emmanuel Wurm. London: Twentieth Century Press
1897 – Biographical notes on Karl Marx
1897 – Karl Marx: The Eastern question. A reprint of letters written 1853-1856 dealing with events of the Crimean war. (Utgitt sammen med Edward Aveling). Sonnenschein & Co. Ltd., London
1897 – Die Arbeiterclassen-Bewegung in England. In: Volks-Lexikon. Nachschlagebuch für sämmtliche Wissenzweige mit besonderer Berücksichtigung der Arbeiter-Gesetzgebung, Gesundheitspflege, Handelswissenschaften Sozial-Politik. Hrsg. von Emanuel Wurm. Zweiter Bd. Wörlein & Comp., Nürnberg
1898 - Karl Marx: Value, price, and profit. Addressed to working men. (Redigert sammen med Edward Aveling). London 1898
1899 - Karl Marx: Secret diplomatic history of the eighteenth century. (Redigert sammen med Edward Aveling). London 1899
1899 - Karl Marx: The story of the life of Lord Palmerston. (Redigert sammen med Edward Aveling). London 1899
Oversettelser
1893 - Edward Bernstein, Ferdinand Lassalle as a Social Reformer. London: Swan Sonnenschein & Co