Flintholm er en bydel på Frederiksberg, som grenser opp mot Vanløse i Københavns kommune.
Bydelen har navn etter gården Flintholm. Jacob Flint kjøpte jorden på auksjon fra Ladegården i 1765. Gården ble senere en lystgård, som etter hvert kom i Frederiksberg kommunes eie og ble tatt i bruk som lasarett, senere reservehospital. I 1895 bygde kommunen gasskraftverk. Hospitalet ble nedlagt og gården revet da kommunen utvidet gasskraftverket i 1945.
Produksjonen ved gasskraftverket opphørte i 1964, og i 2004 ble gasskraftverket revet for å utvikle bydelen for bolig-, kontor- og lagerformål. Det eneste som står igjen etter gasskraftverket er den gule direktørboligen, oppført i 1908, som er tatt i bruk som foreningshus.
Den nåværende Flintholm stasjon åpnet i 2004 og er en av Danmarks mest trafikkerte stasjoner.