Hydroakustikk er studiet og bruk av lyd i vann. Hydroakustikk, ved hjelp av ekkolodd teknologi, er den mest brukte metoden for overvåking av undersjøiske fysiske og biologiske egenskaper.
Hydroakustikk kan brukes til å oppdage dybden av en vannforekomst (bathymetry), så vel som tilstedeværelse - eller fravær av, overflod, utbredelse, størrelse og oppførsel av undersjøiske planter og dyr. Hydroakustisk registrering innebærer "passiv akustikk" (lytte etter lyder) eller aktiv akustikk (sende ut en lyd og lytte etter ekko), derav felles navn for teknikken, sonar eller ekkolodd.