Haddon ble født i 1962 i Northampton, og var elev ved Uppingham School og studerte deretter engelsk ved Merton College på Universitetet i Oxford. Etter videregående skole hadde han ulikt arbeid, blant annet ved å arbeide med mennesker med funksjonshemminger og autisme. Han hadde også en tid hvor han arbeidet som tegner av illustrasjoner og tegneserier for magasiner og aviser.
Han bodde i amerikanske Boston i Massachusetts for et år sammen med sin hustru før de flyttet tilbake til England. I hjemlandet begynte han som kunstmaler og utforsket abstrakt, ikkefigurativkunst. I 1987 skrev han sin første bok for baren- og ungdom, Gilbert’s Gobstopper. Denne ble fulgt av flere andre barnebøker som han ofte, men ikke alltid illustrerte selv.
Haddon er også kjent for sin bokserie om Agent Z. En av disse, Agent Z and the Penguin from Mars, ble i 1996 gjort til en situasjonskomedie for barn av BBC. Han skrev også manuskript for BBCs framstilling av Raymond Briggs' fortelling Fungus the Bogeyman (vist på BBC1 i 2004). I 2007 skrev han fjernsyndramaet Coming Down the Mountain for BBC.
I 2003 vant Haddon Whitbreads pris for årets bok for Den merkelige hendelsen med hunden den natten i kategorien romaner framfor kategorien barnelitteratur. Han vant også Samveldeforfatternes debutantpris for utgivelser rettet mot voksne, og avisen The Guardians pris for barnebok, som kun gis til en forfatter en gang, bedømt av en jury bestående av barnebokforfattere. I et intervju hevdet Haddon at Den merkelige hendelsen faktisk var skrevet med tanke på et voksent publikum og at han ble overrasket da utgiveren foreslo å markedsføre den for både voksne og barn. Hans andre roman skrevet for voksne, A Spot of Bother, kom i 2006, og oversatt til norsk av Kyrre Haugen Bakke som Noe til besvær (2012).
Personlig liv
Haddon er vegetarianer og beskriver seg selv som «en hardbarket ateist». I et intervju med The Observer hevdet han at han var «ateist på et meget religiøst vis.»
I 2009 donerte han novellen «The Island» til Oxfams prosjekt Ox-Tales, en bokserie på fire samlinger skrevet av 38 forfattere. Haddons fortelling ble utgitt i samlingen Fire.
(63 år)