Middle River er en sideelv til Des Moines River i det sentrale Iowa i USA. Den er 198 km lang. og har et nedbørsområde på 1 269 km².. Via Des Moines River er den en del av nedbørsområdet til Mississippi-floden.
Middle River har sitt utspring i Guthrie County og først flyter den i sydøstlig retning gjennom Adair County, så i østlig retning gjennom Madison County, videre øst-nordøst gjennom Warren County, forbi byene Casey, Winterset, hvor den flyter under Roseman Covered Bridge, videre til Patterson, Bevington, Martensdale, Spring Hill og Charlise. En betydelig del av Middle Rivers løp gjennom Warren County er blitt rettet ut og lagt om til kanaler. Den flyter sammen med Des Moines River i Warren County nær Carlisle, 21 km sydøst for Des Moines.
South Fork Middle River, en kort sideelv til elven er kjent som South Fork Middle River. som har sitt utspring nær den vestlige kant av Guthrie County, om lag åtte km nord for Adair og renner stort sett øst-sydøst for om lag 8 km flyter forbi like syd for Casey før den dreier nordøst og renner ut i Middle River like øst for Casey på en høyde av 437 m