Plutonium-239 (239Pu) er en isotop av grunnstoffet plutonium som er radioaktiv og har en halveringstid på 24 110 år og atommasse på 239,05216 u. Det oppstår som biprodukt i kjernereaktorer ved at Uran-238 (238U) tar opp et nøytron og via betahenfall danner neptunium-239 (239Np) som ved nytt betahenfall danner plutonium-239. Dette isotopet kan brukes i kjernevåpen.