
Klaus Wowereits tredje senat var fra 23. november 2006 til 24. november 2011 Berlins delstatsregjering, kalt Senatet.
Etter valget til Berlins parlament 17. september 2006 var det mulig å danne både en rød-rød koalisjon (mellom SPD og Die Linke) og en rød-grønn koalisjon mellom SPD og Bündnis 90/Die Grünen. SPD bestemte seg for å fortsette den rød-røde koalisjon som ble etablert i 2002.
Delstatsregjeringen hadde disse medlemmene:
| Departement | Navn | Parti |
|---|---|---|
| Regjerende borgermester | Klaus Wowereit | SPD |
| Borgermester | Ingeborg Junge-Reyer | SPD |
| Borgermester | Harald Wolf | Die Linke |
| Senator for byutvikling | Ingeborg Junge-Reyer | SPD |
| Senator for næringsliv, teknologi og kvinner | Harald Wolf | Die Linke |
| Senator for utdannelse, vitenskap og forskning | Jürgen Zöllner | SPD |
| Senator for finans | Thilo Sarrazin fra 1. mai 2009: Ulrich Nußbaum | SPD partiløs |
| Senator for helse, miljø og forbrukersaker | Katrin Lompscher | Die Linke |
| Senator for indresaker og idrett | Ehrhart Körting | SPD |
| Senator for integrasjon, arbeid og sosiale saker | Heidi Knake-Werner fra 15. oktober 2009: Carola Bluhm | Die Linke |
| Senator for justisvesentet | Gisela von der Aue | SPD |