Em junho de 2012, a liga e a Associação de Árbitros não chegaram a um entendimento sobre o novo acordo coletivo de trabalho. Por consequência, os árbitros acabaram entrando em lockout (greve), forçando a NFL a substituir os juízes. Esses substitutos vinham de divisões baixas de campeonatos de faculdades ou escolas secundárias, sendo que nenhum deles pertence a 1ª Divisão da NCAA, da elite do futebol americano universitário. As negociações começaram mal, com ambos os lados acusando o outro de não agir o suficiente para por fim a greve e por violar leis trabalhistas no que tange a negociações contratuais.
Entre as principais exigências dos árbitros estavam melhores salários, além da manutenção de benefícios. A liga inicialmente ofereceu um acordo de sete anos, e aumento de 5% a 11% nas compensações, e um aumento na pensão pós-aposentadoria. A NFL também quer montar um grupo de juízes fixos trabalhando em tempo integral, contudo cerca de 90% dos árbitros ainda trabalham apenas em meio período e não queriam abrir mão dos outros trabalhos que possuiam. A Associação de Árbitros então comentou que não era contra juízes trabalhando em tempo integral mas queriam assegurados todas as compensações por tal esforço. Além disso, a NFL queria aumentar o número de árbitros trabalhando em cada jogo de 17 para 20.
Na noite de 26 de setembro de 2012, o sindicato dos árbitros e a Liga chegaram a um entendimento e assinaram um novo acordo trabalhista encerrando assim a greve. Nas três primeiras semanas da temporada, os jogos foram apitados por juízes substitutos e suas performances acabaram sendo altamente criticadas pelos jogadores e pela mídia americana. Segundo analistas, este foi um dos fatores para que o novo acordo fosse finalmente assinado.
Classificação
V = Vitórias, D = Derrotas, E = Empates, PCT = porcentagem de vitórias, PF= Pontos feitos, PS = Pontos sofridos
Classificados para os playoffs estão marcados em verde
New England conquistou a segunda melhor posição na AFC, apesar de ter campanha igual a Houston, por causa da vantagem no confronto direto entre as equipes durante a temporada.
New York Jets terminou à frente de Buffalo na AFC East baseado num melhor retrospecto contra adversários em comum (5–7 contra 3–9).
Baltimore conquistou o título da AFC North sobre Cincinnati por ter tido uma melhor campanha dentro da divisão (4–2 contra 3–3).
Minnesota conquistou a sexta posição na NFC sobre Chicago por ter tido uma melhor campanha dentro da divisão (4–2 contra 3–3).
Carolina e New Orleans terminaram à frente de Tampa Bay na NFC South baseado num melhor retrospecto contra adversários em comum (5–5 contra 4–6 de Tampa Bay), enquanto Carolina terminou em segundo lugar pois venceu o confronto direto contra New Orleans durante a temporada.
Ed Reed, do Baltimore Ravens, quebra o recorde de Rod Woodson de jardas após uma interceptação (1 497 jardas naquele momento da temporada).
Robert Griffin III, em sua estreia na liga, se tornou o único jogador da história da NFL a passar para mais de 300 jardas e 2 touchdowns sem lançar uma interceptação em sua estreia como profissional.
Semana 1: semana de abertura com maior número de pontos na história da NFL. O recorde agora é de 791 pontos, 3 a mais que o recorde anterior de 2002. Cinco times marcaram pelo menos 40 pontos, o que também é um recorde.
Recorde de quantidade de times (20) que começaram com 1 vitória e uma 1 derrota nos primeiros dois jogos.
Danny Amendola, do St. Louis Rams, conseguiu 12 recepções no primeiro tempo do jogo contra o Washington, na semana 2, empatando o recorde da NFL que pertence a Reggie Wayne do Indianapolis Colts, que o fez em 2007.
O Tennessee Titans quebrou o recorde da NFL com 5 touchdowns de mais de 60 jardas cada em um único jogo, contra os Lions na semana 3.
Na semana 3, no jogo entre New England Patriots e Baltimore Ravens, foi quebrado o recorde da liga com 13 first downs conseguidos por meio de faltas. New England conseguiu oito first downs e Baltimore cinco.
Drew Brees estabelece um recorde com 48 jogos seguidos com pelo menos um passe para touchdown na semana 5 contra o San Diego Chargers (o primeiro time que Brees jogou como profissional) quebrando a marca de Johnny Unitas que prevalecia desde 1960.
Charles Tillman e Lance Briggs quebram o recorde da liga interceptando passes para touchdown nas semanas 4 e 5 e se tornaram o primeiro par de jogadores do mesmo time a fazer isso na história da NFL.
Na semana 5, o San Francisco 49ers se tornou o primeiro time na história da NFL a conseguir 300 aéreas e 300 jardas terrestres em um único jogo, contra o Buffalo Bills.
Jacoby Jones, jogador do Baltimore Ravens, empatou o recorde da liga com um retorno de 108 jardas de kickoff, contra o Dallas Cowboys.
Chris Johnson, do Tennessee Titans, anotou um touchdown terrestre de 83 jardas no primeiro quarto da vitória do seu time contra o Buffalo Bills e se tornou o primeiro jogador na história da NFL com quatro touchdowns terrestres de 80 ou mais jardas na carreira.
Na semana 8, o New England agregou 350 jardas no ataque pelo 17º jogo seguido, quebrando um recorde da NFL que havia sido estabelecido pelo Rams de 1999-2000.
Ao permitir 530 jardas ao ataque do Denver Broncos na semana 8, o New Orleans Saints se tornou o primeiro time da NFL a ceder 400 ou mais jardas em sete jogos seguidos desde 1950, quando a STATS LLC começou a fazer a base de dados para estatísticas da Liga. Este recorde aumentou para nove jogos quando os Eagles conquistaram 447 jardas ofensivas contra os Saints na semana 9 e os Falcons com mais 454 jardas na semana 10.
Jason Witten, jogador do Dallas Cowboys, conseguiu 18 recepções contra o New York Giants na semana 8. Este acabou se tornando um recorde da NFL por recepções feitas por um tight end, e também foi a terceira melhor marca na história da liga por um recebedor.
Na semana 8 da temporada regular, o quarterback Peyton Manning estendeu seu recorde de maior quantidade de jogos com 300 ou mais jardas na carreira com 68 partidas com estes números.
Na semana 9, Andrew Luck quebrou o recorde da National Football League com 433 jardas aéreas em um jogo, a melhor marca da história para um calouro (rookie), na vitória do Indianapolis Colts sobre o Miami Dolphins por 23 a 20.
O Chicago Bears, na semana 9 da liga, se tornou o primeiro time da NFL a anotar um touchdown aéreo, um terrestre, um de retorno de interceptação e um de chute/punt bloqueado, tudo em um único quarto.
Na semana 9, Charles Tillman se tornou o primeiro jogador da NFL a forçar quatro fumbles em um único jogo desde que esta estatística começou a ser computada em 1991.
Na semana 9, o calouro Doug Martin se tornou o primeiro jogador na história da liga a anotar touchdowns de 70, 65 e 45 ou mais jardas em um único jogo. Ele se juntou a Mike Anderson, ex-jogador de Denver, como os únicos a conseguir 250 ou mais jardas terrestres e ainda anotar mais quatro touchdowns em um jogo.
Na semana 10, Jacoby Jones, jogador do Baltimore Ravens, se tornou o primeiro jogador na história da liga a conseguir dois retornos de kickoff de 105 ou mais jardas para touchdown na carreira. Os dois retornos para TD foram nesta temporada.
Andrew Luck quebra um recorde para um calouro com seis jogos com pelo menos 300 jardas.
Leon Washington, do Seahawks, retornou seu oitavo chute para touchdown na carreira, emptatando a melhor marca da história da NFL.
David Wilson, do NY Giants, quebra o recode do seu time de maior quantidade de jardas totais de scrimmage, com suas 327 jardas em 9 de dezembro de 2012, contra o Saints.
Calvin Johnson, recebedor dos Lions, quebra o recorde da NFL (que pertencia a Jerry Rice) de maior quantidade de jardas recebidas numa temporada, com 1 892 jardas totais.
Blair Walsh, dos Vikings, quebra o recorde da NFL de maior número de field goals de mais de 50 jardas feitos em um único ano.
Andrew Luck, dos Colts, quebra o recorde da liga com o maior número de jardas aéreas conquistadas em um ano por um quarterback novato (4 183 jardas).
Jason Witten, dos Cowboys, quebra o recorde da NFL de maior quantidade de recepções feitas por um tight end numa única temporada.
Adrian Peterson se torna o sétimo jogador na história da NFL que conseguiu agregar pelo menos 2 000 jardas terrestres em uma única temporada.
Os Patriots quebram o recorde da NFL com 444 first downs num ano.
Esta temporada quebrou um recorde da NFL com um total de 11 651 pontos marcados, uma média de 22,8 por jogo, a melhor marca desde a fusão AFL-NFL.
O New England Patriots empatou o recorde do St. Louis Rams de 1999-2001, de maior quantidade de temporadas seguidas (3) com 500 ou mais pontos marcados.
Nos Estados Unidos, a rede de televisão NBC foi responsável pela transmissão dos primeiros dois jogos de Wild Card (repescagem) dos playoffs. Já a Fox transmitiu o restante dos jogos da NFC. A CBS, por sua vez, exibiu os jogos da AFC e o Super Bowl.
No Brasil, todos os jogos de pós-temporada (incluindo a final do campeonato) foram transmitidos pela ESPN e pela TV Esporte Interativo.