Gene cutter

Em biogenética, Gene Cutter ou Gene Cutter BRCA1 é uma ferramenta de extração de alinhamento de sequências e proteínas de HIV-1, HIV-2, SIV, semelhante ao sistema de CRISPR.

Aplicação

Os cientistas usaram uma enzima que corta o DNA, chamada Cas9, para cortar o vírus, a fim de forçar o mecanismo de reparação da célula a soldar as pontas soltas do genoma de volta - resultando em uma célula livre de vírus. A ferramneta alinha as seqüências de nucleotídeos (se elas não estiverem alinhadas); grampeia codificando regiões a partir de um alinhamento de nucleotídeos; códon-alinha todas as regiões de codificação; e gera alinhamentos de nucleotídeo e proteínas das regiões de corte. O processo poderia ser uma cura não só a SIDA, mas também para outras infecções latentes.

Referências

  1. ↑ Characterization of full-length HIV-1 CRF17_BF genomes and comparison to the prototype CRF12_BF strains por Paula C. Aulicino, et al, publicado "Infect Genet Evol." em 2012; 12(2): 443–447. - doi: 10.1016/j.meegid.2012.01.003
  2. ↑ Seven full-length HIV-1 nucleotide sequences from Argentina (AR.1999.ARMA038 AY037281, AR.2002.AR02-ARG1139 EU58 1825, AR.2002.AR02-ARG2233 EU581826); Bolivia (BO.2002. BO02-BOL119 EU581827); Paraguay (PY.2002.PY02-PSP0096 EU581823, PY.2002.PY02-PSP0073 EU581824); and Peru (PE.2002.PE02-PCR0155 [EU581828]) denoted as CRF17_BF were retrieved from the Los Alamos HIV Sequence Database and aligned with CRF12_BF, B, C, D and F1 subtype reference sequences using the GeneCutter Tool.
  3. ↑ Gene Cutter publicado por "Los Alamos National Security" (2016)
  4. ↑ HIV-1 Vpr induces ATM-dependent cellular signal with enhanced homologous recombination por C Nakai-Murakami, et al, publicado em "Oncogene" artigo 26, 477–486. doi:10.1038/sj.onc.120983 (2007)
  5. ↑ Scientists 'delete' HIV virus from human DNA for the first time por ELLIE ZOLFAGHARIFARD, publicado no "DailyMail" (2016)
  6. ↑ Gene Cutter Sequence Alignment and Protein Extraction publicado pelo "U.S. Department of Energy's National Nuclear Security Administration " (2016)
  7. ↑ DNA damage repair machinery and HIV escape from innate immune sensing por Christelle Brégnard et al, publicado por Front. Microbiol em (2014) | 10.3389/fmicb.2014.00176.
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