Jan Matsys (ou Massys, Metsys, Matsijs) (Antuérpia, 1510 — Antuérpia, 8 de outubro de 1575) foi um pintor flamengo do período renascentista, filho do também pintor Quentin Matsys (1466–1530).
Jan Matsys nasceu em Antuérpia e foi influenciado diretamente pelo estilo de seu pai, um dos principais nomes da pintura flamenga do início do século XVI. Sua produção artística inclui principalmente pinturas de temática religiosa, mitológica e retratos.
Sua obra apresenta influências do maneirismo, especialmente no uso de cores intensas e composições mais elaboradas. Durante parte de sua vida, deixou os Países Baixos, possivelmente por motivos religiosos, retornando posteriormente a Antuérpia, onde continuou sua atividade artística.