Autokefal (grekiska: αὐτοκεφαλία, autokephalia, "med egen chef", "självhövdad") är en term inom delar av kristenheten som syftar på en självständig ortodox nationalkyrka, som står under ett eget överhuvud. Termen förekommer främst inom de östortodoxa kyrkorna, och de flesta nationalkyrkor är autokefala.
En autokefal kyrka har absolut självständighet, men erkänner patriarken av Konstantinopel som den främste bland jämlikar (primus inter pares) bland de östortodoxa kyrkornas ledare. Överhuvudet kan vara en patriark, ärkebiskop eller metropolit.
Om en kyrka inte är autokefal är den antingen autonom, det vill säga har inre självstyrelse men står under någon autokefal kyrkas överhöghet, eller avhängig och står då direkt under någon autokefal kyrkas kontroll.