Cyklooxygenas, förkortat COX, är ett enzym som deltar i bildningen av flera olika viktiga ämnen i kroppen, bland annat prostaglandiner. Dessa deltar i, bland annat, inflammatoriska processer i kroppen. Många antiinflammatoriska läkemedel fungerar genom att hämma detta enzyms funktion. Exempel på COX-hämmare är acetylsalicylsyra och ibuprofen (så kallade NSAID-preparat).
COX föreligger i två olika former, isoenzymer, COX-1 och COX-2: