Jonathan Jeppsson, född 29 april 1972 i Hässleholm, är en svensk journalist och författare.
Jeppsson är chef för Aftonbladets grävredaktion och har tidigare haft rollen som nyhetschef och redaktör för samhällsredaktionen. Dessutom är han verksam som tidningens klimatkolumnist och har varit med att instifta Klimatjournalistpriset.
Som författare har han vunnit erkännande för sina böcker om klimatförändringarnaoch civilisationens sammanbrott.
När den senare boken kommit ut fanns också recensentersom menade att Jeppsson var alltför fokuserad på ekonomen Gaya Herringtons uppföljning av en 50 år gamla studie.
2024 nominerades han till Årets medieledare på Tidningsutgivarnas gala Årets dagstidning med motiveringen: "Han väckte ett nytt engagemang för journalistiken i en digital kontext, och gav en tydlig riktning för redaktionen. En rutinerad ledare som undviker eget strålkastarljus men får andra att växa och göra skillnad."