Kleen är ett efternamn som förekommer i Tyskland och i Sverige. En svensk släkt med detta namn, som antagits ha tyskt ursprung, är känd i Skåne sedan slutet av 1600-talet. En medlem av släkten, generallöjtnanten Johan Kleen, adlades 1858 med namnet af Kleen. Namnet, som finns i flera varianter, har upprepade gånger ärvts eller tagits från morssidan.
I april 2016 uppges följande antal personer bosatta i Sverige med namnvarianterna
Tillsammans blir detta 154 personer. Antalet personer i Tyskland med efternamnet Kleen beräknas till 2008.