Gizli harekât, gizli şekilde yürütülen bir istihbarat veya askeri operasyondur. Operasyon genel nüfus veya belirli düşman kuvvetleri tarafından fark edilmez. Gizli harekâtların büyük kısmı istihbarat toplamakla ilgilidir.
1970'lere kadar, gizli harekâtlar esasen doğası gereği politikti ve genellikle sponsorun tercih ettiği gruplara veya uluslara yardım etmeyi amaçlıyordu.