Homeobox

Homeodomain
Drosophila melanogaster'den gelen Antennapedia homeodomain proteini, DNA'nın bir parçasına bağlanmıştır. Tanıma heliksi ve yapılaşmamış N-terminus sırasıyla majör ve minör girintilere bağlanır.
Tanımlayıcılar
SembolHomeodomain
PfamPF00046
Pfam klanıCL0123
SMARTSM00389
PROSITEPDOC00027
SCOP21ahd / SCOPe / SUPFAM
Mevcut protein yapıları:
Pfam  yapılar / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumyapı özeti
PDB1ahd​, 1akh​, 1apl​, 1au7​, 1b72​, 1b8i​, 1bw5​, 1cqt​, 1du0​, 1du6​, 1e3o​, 1enh​, 1f43​, 1fjl​, 1ftt​, 1ftz​, 1gt0​, 1hdd​, 1hdp​, 1hf0​, 1hom​, 1ic8​, 1ig7​, 1jgg​, 1k61​, 1kz2​, 1le8​, 1lfb​, 1lfu​, 1mh3​, 1mh4​, 1mnm​, 1nk2​, 1nk3​, 1o4x​, 1ocp​, 1oct​, 1p7i​, 1p7j​, 1pog​, 1puf​, 1qry​, 1s7e​, 1san​, 1uhs​, 1vnd​, 1wi3​, 1x2m​, 1x2n​, 1yrn​, 1yz8​, 1zq3​, 1ztr​, 2cqx​, 2cra​, 2cue​, 2cuf​, 2dmq​, 2e1o​, 2ecb​, 2ecc​, 2h8r​, 2hdd​, 2hi3​, 2hoa​, 2jwt​, 2lfb​, 2p81​, 2r5y​, 2r5z​, 3hdd​, 9ant​

Bir homeobox, embriyonik gelişimin erken evrelerinde büyük ölçekli anatomik özellikleri düzenleyen yaklaşık 180 baz çifti uzunluğunda bir DNA dizisidir. Bir homeobox'da yaşanan mutasyonlar yetişkin organizmanın büyük ölçekli anatomik özelliklerini değiştirebilir.

Homeobox'lar, hayvanlarda, mantarlarda, bitkilerde ve birçok tek hücreli ökaryotta anatomik gelişim örüntülerinin düzenlenmesinde (morfogenez) rol oynayan genlerin içinde bulunur. Homeobox genleri, homeodomain protein ürünlerini kodlar. Bu proteinler, DNA'ya bağlanarak hedef genlerin ifadesini düzenleyen transkripsiyon faktörleridir ve karakteristik bir protein katlanma yapısına sahiptirler. Homeodomain proteinleri, erken embriyonik gelişim esnasında gen ifadesini ve hücre farklılaştırılmasını düzenler. Homeobox genlerinde yaşanan mutasyonlar gelişim bozukluklarına sebep olur.

Hemeosis terimi William Bateson tarafından, bir vücut parçasının başka bir vücut parçasıyla tamamen yer değiştirmesini (örneğin başındaki antenin bacağıyla yer değiştirdiği antennapedia sineği) tanımlamak için türetildi. "Homeo-" öneki, "homeobox" ve "homeodomain" kelimelerinde, bu genlerin bazıları hayvanlarda mutasyona uğradığında gözlemlenen mutasyonel fenotipe atıfta bulunarak türetilmiştir. Homeobox domini, ilk olarak Drosophila'daki bazı homeotik ve segmentasyon proteinlerinde tanımlanmıştı ancak şimdi omurgalılar da dahil olmak üzere birçok başka hayvanda iyi korunmuş olduğu bilinmektedir.

Kaynakça

  1. ↑ PDB: 1AHD​; Billeter M, Qian YQ, Otting G, Müller M, Gehring W, Wüthrich K (December 1993). "Determination of the nuclear magnetic resonance solution structure of an Antennapedia homeodomain-DNA complex". Journal of Molecular Biology. 234 (4): 1084-93. doi:10.1006/jmbi.1993.1661. PMID 7903398.
  2. 1 2 Bürglin TR, Affolter M (June 2016). "Homeodomain proteins: an update". Chromosoma. 125 (3): 497-521. doi:10.1007/s00412-015-0543-8. PMC 4901127 Özgürce erişilebilir. PMID 26464018.
  3. 1 2 Gehring WJ (August 1992). "The homeobox in perspective". Trends in Biochemical Sciences. 17 (8): 277-80. doi:10.1016/0968-0004(92)90434-B. PMID 1357790.
  4. ↑ Gehring WJ (December 1993). "Exploring the homeobox". Gene. 135 (1–2): 215-21. doi:10.1016/0378-1119(93)90068-E. PMID 7903947.
  5. ↑ "Homeoboxes". Genetics Home Reference (İngilizce). U.S. National Library of Medicine. 21 Aralık 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Kasım 2019.
  6. ↑ Materials for the study of variation, treated with especial regard to discontinuity in the origin of species William Bateson 1861–1926. London : Macmillan 1894 xv, 598 p
  7. ↑ Schofield PN (1987). "Patterns, puzzles and paradigms - The riddle of the homeobox". Trends Neurosci. 10: 3-6. doi:10.1016/0166-2236(87)90113-5.
  8. ↑ Scott MP, Tamkun JW, Hartzell GW (July 1989). "The structure and function of the homeodomain". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Reviews on Cancer. 989 (1): 25-48. doi:10.1016/0304-419x(89)90033-4. PMID 2568852.