RAD51

RAD51 homolog (RecA homolog, E. coli) (S. cerevisiae)
RAD51 homolog (RecA homolog, E. coli) (S. cerevisiae)
	PDB: 1PZN koordinatlarına göre çizilmiş bir Rad51 yedilisi.
Tanımlayıcılar
Sembol	RAD51
OMIM	179617
PDB	1b22 PDB: 1n0w

RAD51
Uygun yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1N0W, 1B22
Tanımlayıcılar
Başka adlar	RAD51
Dış kimlikler	OMIM: 179617 MGI: 97890 HomoloGene: 2155 GeneCards: RAD51
Gen yerleşimi (İnsan)
Krom.	15. Kromozom (insan)
Bitiş	40,732,340 bç
RNA ekspresyonu deseni
	; ;
	Daha çok ekspresyon verisi başvurusu
Gen ontolojisi
Moleküler işlevi	• nucleotide binding; • DNA binding; • ATP-dependent activity, acting on DNA; • DNA strand exchange activity; • DNA polymerase binding; • protein C-terminus binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein bağlanması; • four-way junction DNA binding; • identical protein binding; • endodeoxyribonuclease activity; • ATP binding; • single-stranded DNA binding; • double-stranded DNA binding; • GO:0043142 single-stranded DNA helicase activity; • chromatin binding; • enzyme binding;
Hücresel bileşeni	• sitoplazma; • site of double-strand break; • PML body; • Hücre iskeleti; • Nükleoplazma; • microtubule organizing center; • nuclear chromosome; • mitochondrial matrix; • Çekirdekçik; • mitokondri; • perinuclear region of cytoplasm; • Kromatin; • hücre çekirdeği; • Sitozol; • GO:0009327 protein-containing complex; • condensed chromosome; • condensed nuclear chromosome; • lateral element; • kromozom;
Biyolojik süreci	• strand invasion; • GO:1903211 mitotic recombination-dependent replication fork processing; • reciprocal meiotic recombination; • DNA recombination; • regulation of double-strand break repair via homologous recombination; • DNA metabolic process; • positive regulation of DNA ligation; • cellular response to camptothecin; • double-strand break repair via homologous recombination; • cellular response to ionizing radiation; • mitotic recombination; • protein homooligomerization; • GO:0100026 DNA onarımı; • DNA unwinding involved in DNA replication; • cellular response to DNA damage stimulus; • interstrand cross-link repair; • DNA recombinase assembly; • negative regulation of G0 to G1 transition; • telomere maintenance via recombination; • telomere maintenance via telomere lengthening; • replication fork processing; • GO:0007126 Mayoz bölünme; • GO:0051178 chromosome organization involved in meiotic cell cycle;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	5888
	19361
	ENSG00000051180
	n/a
	Q06609
	Q08297
	NM_001164269; NM_001164270; NM_002875; NM_133487
	NM_011234
	NP_001157741; NP_001157742; NP_002866; NP_597994
	NP_035364
	Vikiveri
İnsan'ı Gör/Düzenle	Fare'yi Gör/Düzenle

RAD51, bir insan genidir, bu genin ürünü olan ve aynı isme sahip olan protein DNA çift iplikçikli kesiklerini tamir eder. Bu protein RAD51 protein ailesinin üyelerinden biridir. RAD51 protein ailesi üyeleri bakteriyel RecA ve maya Rad51 ile homologdur. Protein, mayadan insana kadar çoğu ökaryotta korunmuştur.

Varyantlar

Bu genin iki alternatif uçbirleştirme varyantı bulunmaktadır, bunlar farklı proteinler kodlar. Ayrıca, alternatif poliA sinyallari kullanan transkriptler de mevcuttur.

İşlev

İnsanda, RAD51 homolog rekombinasyonda önemli bir rol oynayan, 339 amino asit uzunluğunda bir proteindir. Çift iplikçikli DNA kırıklarının tamiri sırasında bir kalıp iplikçik, birbiriyle eşleşmiş homolog DNA iplikçiklerini işgal eder, ATP-ye bağımlı olan bu süreç sonucunda bir iplikçik yer değiştirme reaksiyonu meydana gelir. RAD51 bu süreç sırasında homolog bölgelerin aranması ve iplikçiklerin eşleşmesinde rol oynar.

DNA metabolizmasında yer alan diğer proteinlerden farklı olarak RecA/Rad51 ailesinin üyeleri DNA üzerinde sarmal şekilli bir nükleoprotein filaman oluştururlar.

Bu protein tek iplikçikli DNA'ya bağlanan proteine (Replication protein A; RPA) ve RAD52 ile etkileşir.

Patoloji

Rad51 proteini ayrıca BRCA1 ve BRCA2 proteinleri ile de etkileşir. BRCA2, Rad51'in hem hücre içindeki lokalizasyonunu, hem de onun DNA'ya bağlanma yeteneğini düzenler. BRCA2'nin kaybı sonucu bu kontrollerin çalışmaması, genomik bozukluklar ve tümörigeneze yol açabilecek önemli bir olay olduğu düşünülmektedir. Bu etkileşimlerin hücrenin DNA hasarına tepkisinde önemli rol oynadığı düşünülmektedir.

Rad51 geni kromozom 15'te bulunur, bu gendeki bazı değişikliklerin göğüs kanseri olma riskini artırdığı bulunmuştur. Göğüs kanseri yatkınlık proteini BRCA2, homolog rekombinasyon yoluyla DNA tamirinde RAD51'in işlevini kontrol eder.

Gen ailesi

Memelilerde yedi recA-benzeri gen tespit edilmiştir: Rad51, Rad51L1/B, Rad51L2/C, Rad51L3/D, XRCC2, XRCC3 ve DMC1/Lim15. Tüm bu proteinler, mayoza özgü olan DMC1 hariç, memelilerde gelişme için gereklidir.

Etkileşimler

Rad51'in BRE, RAD54B, Ataxia telangiectasia mutated, BRCC3, BARD1, BRCA2, UBE2I, Abl gene, BRCA1, ATRX, RAD52, DMC1, P53 ve Bloom syndrome protein. ile etkileştiği gösterilmiştir.

Galeri

1b22: RAD51 (N-uç bölgesi)
1n0w: BRC tekrar kompleksinde RAD51-BRCA2 kristal yapısı

Kaynakça

1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000051180 - Ensembl, May 2017
↑ "İnsan PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ "Fare PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ Shin, D.S., Pellegrini, L., Daniels, D.S., Yelent, B., Craig, L., Bates, D., Yu, D.S., Shivji, M.K., Hitomi, C., Arvai, A.S., Volkmann, N., Tsuruta, H., Blundell, T.L., Venkitaraman, A.R., Tainer, J.A. (2003). "Full-length archaeal Rad51 structure and mutants: mechanisms for RAD51 assembly and control by BRCA2". Embo J. Cilt 22. ss. 4566-4576. PMID 12941707.
↑ Galkin VE, Wu Y, Zhang XP, Qian X, He Y, Yu X, Heyer WD, Luo Y, Egelman EH (2006). "The Rad51/RadA N-terminal domain activates nucleoprotein filament ATPase activity". Structure. 14 (6). ss. 983-92. doi:10.1016/j.str.2006.04.001. PMID 16765891.
↑ Daniel DC (2002). "Highlight: BRCA1 and BRCA2 proteins in breast cancer". Microsc. Res. Tech. 59 (1). ss. 68-83. doi:10.1002/jemt.10178. PMID 12242698.
1 2 Pellegrini L, Yu DS, Lo T, Anand S, Lee M, Blundell TL, Venkitaraman AR (2002). "Insights into DNA recombination from the structure of a RAD51-BRCA2 complex". Nature. 420 (6913). ss. 287-93. doi:10.1038/nature01230. PMID 12442171.
↑ Kawabata M, Kawabata T, Nishibori M (2005). "Role of recA/RAD51 family proteins in mammals". Acta Med Okayama. 59 (1). ss. 1-9. PMID 15902993.
1 2 3 4 5 6 Dong, Yuanshu (Kasım 2003). "Regulation of BRCC, a holoenzyme complex containing BRCA1 and BRCA2, by a signalosome-like subunit and its role in DNA repair". Mol. Cell. 12 (5). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 1087-99. ISSN 1097-2765. PMID 14636569.
1 2 Tanaka, K (Ağustos 2000). "A novel human rad54 homologue, Rad54B, associates with Rad51". J. Biol. Chem. 275 (34). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 26316-21. doi:10.1074/jbc.M910306199. ISSN 0021-9258. PMID 10851248.
1 2 3 Chen, G (Nisan 1999). "Radiation-induced assembly of Rad51 and Rad52 recombination complex requires ATM and c-Abl". J. Biol. Chem. 274 (18). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 12748-52. ISSN 0021-9258. PMID 10212258.
↑ Sharan, S K (Nisan 1997). "Embryonic lethality and radiation hypersensitivity mediated by Rad51 in mice lacking Brca2". Nature. 386 (6627). İngiltere. ss. 804-10. doi:10.1038/386804a0. ISSN 0028-0836. PMID 9126728.
↑ Lin, Horng-Ru (Eylül 2003). "M phase-specific phosphorylation of BRCA2 by Polo-like kinase 1 correlates with the dissociation of the BRCA2-P/CAF complex". J. Biol. Chem. 278 (38). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 35979-87. doi:10.1074/jbc.M210659200. ISSN 0021-9258. PMID 12815053.
↑ Yu, David S (Ekim 2003). "Dynamic control of Rad51 recombinase by self-association and interaction with BRCA2". Mol. Cell. 12 (4). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 1029-41. ISSN 1097-2765. PMID 14580352.
↑ Chen, P L (Nisan 1998). "The BRC repeats in BRCA2 are critical for RAD51 binding and resistance to methyl methanesulfonate treatment". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (9). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 5287-92. ISSN 0027-8424. PMID 9560268.
↑ Sarkisian, C J (Ekim 2001). "Analysis of murine Brca2 reveals conservation of protein-protein interactions but differences in nuclear localization signals". J. Biol. Chem. 276 (40). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 37640-8. doi:10.1074/jbc.M106281200. ISSN 0021-9258. PMID 11477095.
↑ Wong, A K (Aralık 1997). "RAD51 interacts with the evolutionarily conserved BRC motifs in the human breast cancer susceptibility gene brca2". J. Biol. Chem. 272 (51). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 31941-4. ISSN 0021-9258. PMID 9405383.
↑ Katagiri, T (Mart 1998). "Multiple possible sites of BRCA2 interacting with DNA repair protein RAD51". Genes Chromosomes Cancer. 21 (3). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 217-22. ISSN 1045-2257. PMID 9523196.
↑ Tarsounas, Madalena (Ocak 2004). "RAD51 localization and activation following DNA damage". Philos. Trans. R. Soc. Lond., B, Biol. Sci. 359 (1441). İngiltere. ss. 87-93. doi:10.1098/rstb.2003.1368. ISSN 0962-8436. PMID 15065660.
↑ Liu, J (Ocak 2001). "Inhibition of breast and brain cancer cell growth by BCCIPalpha, an evolutionarily conserved nuclear protein that interacts with BRCA2". Oncogene. 20 (3). İngiltere. ss. 336-45. doi:10.1038/sj.onc.1204098. ISSN 0950-9232. PMID 11313963.
1 2 Chen, J (Eylül 1998). "Stable interaction between the products of the BRCA1 and BRCA2 tumor suppressor genes in mitotic and meiotic cells". Mol. Cell. 2 (3). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 317-28. ISSN 1097-2765. PMID 9774970.
↑ Marmorstein, L Y (Kasım 1998). "The BRCA2 gene product functionally interacts with p53 and RAD51". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (23). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 13869-74. ISSN 0027-8424. PMID 9811893.
↑ Kovalenko, O V (Nisan 1996). "Mammalian ubiquitin-conjugating enzyme Ubc9 interacts with Rad51 recombination protein and localizes in synaptonemal complexes". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (7). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 2958-63. ISSN 0027-8424. PMID 8610150.
↑ Shen, Z (Ekim 1996). "Associations of UBE2I with RAD52, UBL1, p53, and RAD51 proteins in a yeast two-hybrid system". Genomics. 37 (2). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 183-6. doi:10.1006/geno.1996.0540. ISSN 0888-7543. PMID 8921390.
↑ Scully, R (Ocak 1997). "Association of BRCA1 with Rad51 in mitotic and meiotic cells". Cell. 88 (2). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 265-75. ISSN 0092-8674. PMID 9008167.
↑ Wang, Q (Ağustos 2001). "Adenosine nucleotide modulates the physical interaction between hMSH2 and BRCA1". Oncogene. 20 (34). İngiltere. ss. 4640-9. doi:10.1038/sj.onc.1204625. ISSN 0950-9232. PMID 11498787.
↑ Sigurdsson, Stefan (Kasım 2002). "Homologous DNA pairing by human recombination factors Rad51 and Rad54". J. Biol. Chem. 277 (45). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 42790-4. doi:10.1074/jbc.M208004200. ISSN 0021-9258. PMID 12205100.
↑ Masson, J Y (Kasım 1999). "The meiosis-specific recombinase hDmc1 forms ring structures and interacts with hRad51". EMBO J. 18 (22). İngiltere. ss. 6552-60. doi:10.1093/emboj/18.22.6552. ISSN 0261-4189. PMID 10562567.
↑ Stürzbecher, H W (Nisan 1996). "p53 is linked directly to homologous recombination processes via RAD51/RecA protein interaction". EMBO J. 15 (8). İngiltere. ss. 1992-2002. ISSN 0261-4189. PMID 8617246.
↑ Buchhop, S (Ekim 1997). "Interaction of p53 with the human Rad51 protein". Nucleic Acids Res. 25 (19). İngiltere. ss. 3868-74. ISSN 0305-1048. PMID 9380510.
↑ Wu, L (Haziran 2001). "Potential role for the BLM helicase in recombinational repair via a conserved interaction with RAD51". J. Biol. Chem. 276 (22). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 19375-81. doi:10.1074/jbc.M009471200. ISSN 0021-9258. PMID 11278509.

[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000051180 - Ensembl, May 2017

[2] "İnsan PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[3] "Fare PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid12941707-4] Shin, D.S., Pellegrini, L., Daniels, D.S., Yelent, B., Craig, L., Bates, D., Yu, D.S., Shivji, M.K., Hitomi, C., Arvai, A.S., Volkmann, N., Tsuruta, H., Blundell, T.L., Venkitaraman, A.R., Tainer, J.A. (2003). "Full-length archaeal Rad51 structure and mutants: mechanisms for RAD51 assembly and control by BRCA2". Embo J. Cilt 22. ss. 4566-4576. PMID 12941707.

[pmid16765891-5] Galkin VE, Wu Y, Zhang XP, Qian X, He Y, Yu X, Heyer WD, Luo Y, Egelman EH (2006). "The Rad51/RadA N-terminal domain activates nucleoprotein filament ATPase activity". Structure. 14 (6). ss. 983-92. doi:10.1016/j.str.2006.04.001. PMID 16765891.

[6] Daniel DC (2002). "Highlight: BRCA1 and BRCA2 proteins in breast cancer". Microsc. Res. Tech. 59 (1). ss. 68-83. doi:10.1002/jemt.10178. PMID 12242698.

[pmid12442171-7] 1 2 Pellegrini L, Yu DS, Lo T, Anand S, Lee M, Blundell TL, Venkitaraman AR (2002). "Insights into DNA recombination from the structure of a RAD51-BRCA2 complex". Nature. 420 (6913). ss. 287-93. doi:10.1038/nature01230. PMID 12442171.

[pmid15902993-8] Kawabata M, Kawabata T, Nishibori M (2005). "Role of recA/RAD51 family proteins in mammals". Acta Med Okayama. 59 (1). ss. 1-9. PMID 15902993.

[pmid14636569-9] 1 2 3 4 5 6 Dong, Yuanshu (Kasım 2003). "Regulation of BRCC, a holoenzyme complex containing BRCA1 and BRCA2, by a signalosome-like subunit and its role in DNA repair". Mol. Cell. 12 (5). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 1087-99. ISSN 1097-2765. PMID 14636569.

[pmid10851248-10] 1 2 Tanaka, K (Ağustos 2000). "A novel human rad54 homologue, Rad54B, associates with Rad51". J. Biol. Chem. 275 (34). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 26316-21. doi:10.1074/jbc.M910306199. ISSN 0021-9258. PMID 10851248.

[pmid10212258-11] 1 2 3 Chen, G (Nisan 1999). "Radiation-induced assembly of Rad51 and Rad52 recombination complex requires ATM and c-Abl". J. Biol. Chem. 274 (18). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 12748-52. ISSN 0021-9258. PMID 10212258.

[pmid9126738-12] Sharan, S K (Nisan 1997). "Embryonic lethality and radiation hypersensitivity mediated by Rad51 in mice lacking Brca2". Nature. 386 (6627). İngiltere. ss. 804-10. doi:10.1038/386804a0. ISSN 0028-0836. PMID 9126728.

[pmid12815053-13] Lin, Horng-Ru (Eylül 2003). "M phase-specific phosphorylation of BRCA2 by Polo-like kinase 1 correlates with the dissociation of the BRCA2-P/CAF complex". J. Biol. Chem. 278 (38). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 35979-87. doi:10.1074/jbc.M210659200. ISSN 0021-9258. PMID 12815053.

[pmid14580352-14] Yu, David S (Ekim 2003). "Dynamic control of Rad51 recombinase by self-association and interaction with BRCA2". Mol. Cell. 12 (4). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 1029-41. ISSN 1097-2765. PMID 14580352.

[pmid9560268-15] Chen, P L (Nisan 1998). "The BRC repeats in BRCA2 are critical for RAD51 binding and resistance to methyl methanesulfonate treatment". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (9). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 5287-92. ISSN 0027-8424. PMID 9560268.

[pmid11477095-16] Sarkisian, C J (Ekim 2001). "Analysis of murine Brca2 reveals conservation of protein-protein interactions but differences in nuclear localization signals". J. Biol. Chem. 276 (40). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 37640-8. doi:10.1074/jbc.M106281200. ISSN 0021-9258. PMID 11477095.

[pmid9405383-17] Wong, A K (Aralık 1997). "RAD51 interacts with the evolutionarily conserved BRC motifs in the human breast cancer susceptibility gene brca2". J. Biol. Chem. 272 (51). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 31941-4. ISSN 0021-9258. PMID 9405383.

[pmid9523196-18] Katagiri, T (Mart 1998). "Multiple possible sites of BRCA2 interacting with DNA repair protein RAD51". Genes Chromosomes Cancer. 21 (3). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 217-22. ISSN 1045-2257. PMID 9523196.

[pmid15065660-19] Tarsounas, Madalena (Ocak 2004). "RAD51 localization and activation following DNA damage". Philos. Trans. R. Soc. Lond., B, Biol. Sci. 359 (1441). İngiltere. ss. 87-93. doi:10.1098/rstb.2003.1368. ISSN 0962-8436. PMID 15065660.

[pmid11313963-20] Liu, J (Ocak 2001). "Inhibition of breast and brain cancer cell growth by BCCIPalpha, an evolutionarily conserved nuclear protein that interacts with BRCA2". Oncogene. 20 (3). İngiltere. ss. 336-45. doi:10.1038/sj.onc.1204098. ISSN 0950-9232. PMID 11313963.

[pmid9774970-21] 1 2 Chen, J (Eylül 1998). "Stable interaction between the products of the BRCA1 and BRCA2 tumor suppressor genes in mitotic and meiotic cells". Mol. Cell. 2 (3). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 317-28. ISSN 1097-2765. PMID 9774970.

[pmid9811893-22] Marmorstein, L Y (Kasım 1998). "The BRCA2 gene product functionally interacts with p53 and RAD51". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (23). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 13869-74. ISSN 0027-8424. PMID 9811893.

[pmid8610150-23] Kovalenko, O V (Nisan 1996). "Mammalian ubiquitin-conjugating enzyme Ubc9 interacts with Rad51 recombination protein and localizes in synaptonemal complexes". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (7). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 2958-63. ISSN 0027-8424. PMID 8610150.

[pmid8921390-24] Shen, Z (Ekim 1996). "Associations of UBE2I with RAD52, UBL1, p53, and RAD51 proteins in a yeast two-hybrid system". Genomics. 37 (2). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 183-6. doi:10.1006/geno.1996.0540. ISSN 0888-7543. PMID 8921390.

[pmid9008167-25] Scully, R (Ocak 1997). "Association of BRCA1 with Rad51 in mitotic and meiotic cells". Cell. 88 (2). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 265-75. ISSN 0092-8674. PMID 9008167.

[pmid11498787-26] Wang, Q (Ağustos 2001). "Adenosine nucleotide modulates the physical interaction between hMSH2 and BRCA1". Oncogene. 20 (34). İngiltere. ss. 4640-9. doi:10.1038/sj.onc.1204625. ISSN 0950-9232. PMID 11498787.

[pmid12205100-27] Sigurdsson, Stefan (Kasım 2002). "Homologous DNA pairing by human recombination factors Rad51 and Rad54". J. Biol. Chem. 277 (45). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 42790-4. doi:10.1074/jbc.M208004200. ISSN 0021-9258. PMID 12205100.

[pmid10562567-28] Masson, J Y (Kasım 1999). "The meiosis-specific recombinase hDmc1 forms ring structures and interacts with hRad51". EMBO J. 18 (22). İngiltere. ss. 6552-60. doi:10.1093/emboj/18.22.6552. ISSN 0261-4189. PMID 10562567.

[pmid8617246-29] Stürzbecher, H W (Nisan 1996). "p53 is linked directly to homologous recombination processes via RAD51/RecA protein interaction". EMBO J. 15 (8). İngiltere. ss. 1992-2002. ISSN 0261-4189. PMID 8617246.

[pmid9380510-30] Buchhop, S (Ekim 1997). "Interaction of p53 with the human Rad51 protein". Nucleic Acids Res. 25 (19). İngiltere. ss. 3868-74. ISSN 0305-1048. PMID 9380510.

[pmid11278509-31] Wu, L (Haziran 2001). "Potential role for the BLM helicase in recombinational repair via a conserved interaction with RAD51". J. Biol. Chem. 276 (22). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 19375-81. doi:10.1074/jbc.M009471200. ISSN 0021-9258. PMID 11278509.