August Krogh Instituttet var et selvstændigt institut for biokemi, fysiologi og cellebiologi ved Københavns Universitet, der blev indviet i 1970 samtidig med August Krogh-bygningen nær Institute of Computer Science i Universitetsparken. I dag er instituttet og bygningen en del af universitets Biologiske Institut, der igen indgår i Det Natur- og Biovidenskabelige Fakultet.
Såvel bygningen og instituttet er opkaldt efter fysiologen August Krogh.