Aenigmatarchaeota

„Candidatus Aenigmatarchaeota“
Systematik
Klassifikation: Lebewesen
Domäne: Archaeen (Archaea)
Reich: Nanobdellati (DPANN)
ohne Rang: DPANN Cluster 2
Stamm: „Candidatus Aenigmatarchaeota“
Wissenschaftlicher Name
„Candidatus Aenigmatarchaeota“
corrig. Rinke et al. 2013

„Candidatus Aenigmatarchaeota“ ist ein 2013 als „Ca. Aenigmarchaeota“ vor­geschlagenes Phylum (auch Stamm oder englisch division, lateinisch divisio) von Archaeen. Dessen erste Vertreter wurden, wie der Stamm (en. strain) SCGC AAA011-O16 (Spezies „Candidatus Aenig­mat­archaeum subterraneum“) in Abwässern von Bergwerken und in Sedimenten von Thermalquellen gefunden. Sie sind obligate Symbionten von Bakterien des Stammes (Phylums) Chloro­flexi und gehören zum Reich Nanobdellati [Super­phylum DPANN: Diaphero­trites, Parvarchaeaota, Aenigm­archaeota, Nanohaloarchaeota und Nano­archae­ota].

Systematik

Die hier angegebene Taxonomie basiert mit Stand 19. Februar 2022 auf den folgenden Quellen:

Die Taxonomie der Archaeen des Reichs Nanobdellati (DPANN-Archaeen) ist wie die der Archaeen überhaupt derzeit (Stand Februar 2022) noch in der Diskussion. Wie an der früheren Bezeichnung „Euryarchaeota DSEG Cluster“ zu erkennen ist, ordneten abweichende Taxonomien das Phylum dem Superphylum „Euryarchaeota“ i. w. S. (heute: Methanobacteriati) anstelle der DPANN-Gruppe (heute: Reich Nanobdellati) zu. Zudem wurde eine Reklassifizierung vorgeschlagen, die vielen Gruppen niedrigere Rangstufen als die überkommenen zuordnet. Aus dem Phylum Aenigmarchaeota wird danach eine Klasse Aenigmarchaea mit einer Ordnung Aenigmarchaeales als Subtaxon. Allerdings sind bisher nur einige Autoren diesem Vorschlag gefolgt, insbesondere die LPSN und die Taxonomie des NCBI sind diesem Vorschlag (bisher) nicht gefolgt. Die LPSN kennt im Phylum Aenigmarchaeota nur eine einzige Gattung „Ca. Aenigmarchaeum“ mit nur einer Spezies (Art), „Ca. Aenigmatarchaeum subterraneum“, die NCBI-Taxonomie listet noch eine Reihe weiterer Kandidatenspezies/Isolate mit vorläufigen Namen. Vertreter in doppelten Anführungszeichen sind noch nicht vollgültig taxonomisch beschrieben:

Phylum: „Candidatus Aenigmatarchaeota“ corrig. Rinke et al. 2013(L,N) [früher „Ca. Aenigmarchaeota“ Rinke et al. 2013(L,N), Candidate division DUSEL2(N), „Euryarchaeota DSEG Cluster“(N)],

Etymologie

Die Name des Phylum und der Gattung leiten sich ab von altgriechisch αἴνιγμα ainigma, deutsch ‚Rätsel‘, Plural αἰνίγματα ainigmata, die Endungen „-archaeota“ und „-archaeum“ sind für Archaeenphyla respektive -gattungen reserviert. Die Namen beschreiben somit enigmatische, rätselhafte Archaeen.

Das Artepitheton subterraneum ist lateinisch und bedeutet wörtlich ‚unterirdisch‘, was auf den Fundort dieser Bodenmikroben verweist.

Einzelnachweise

  1. 1 2 Nina Dombrowski, Tom A. Williams, Jiarui Sun, Benjamin J. Woodcroft, Jun-Hoe Lee, Bui Quang Minh, Christian Rinke, Anja Spang: Undinarchaeota illuminate DPANN phylogeny and the impact of gene transfer on archaeal evolution. In: Nature Communications. Band 11, Nr. 1, 7. August 2020, S. 3939, doi:10.1038/s41467-020-17408-w, PMID 32770105.
  2. ↑ UniProt Taxonomy. Aenigmarchaeota
  3. 1 2 Ken Takai, Duane P. Moser, Mary DeFlaun, Tullis C. Onstott, James K. Fredrickson: Archaeal Diversity in Waters from Deep South African Gold Mines. In: Applied and Environmental Microbiology. 1. Dezember 2001, S. 5750–5760, doi:10.1128/AEM.67.21.5750-5760.2001, PMID 11722932.
  4. ↑ Christian Rinke, Patrick Schwientek, Alexander Sczyrba, Natalia N. Ivanova, Iain J. Anderson, Jan-Fang Cheng, Aaron Darling, Stephanie Malfatti, Brandon K. Swan, Esther A. Gies, Jeremy A. Dodsworth, Brian P. Hedlund, George Tsiamis, Stefan M. Sievert, Wen-Tso Liu, Jonathan A. Eisen, Steven J. Hallam, Nikos C. Kyrpides, Ramunas Stepanauskas, Edward M. Rubin, Philip Hugenholtz, Tanja Woyke: Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter. In: Nature. Band 499, Nr. 7459, 25. Juli 2013, S. 431–437, doi:10.1038/nature12352, PMID 23851394.
  5. 1 2 3 LPSN: Phylum “Candidatus Aenigmarchaeota”
  6. ↑ NCBI: Candidatus Aenigmarchaeota (Liste), Details: Candidatus Aenigmarchaeota (phylum, heterotypic synonym: Aenigmarchaeota Rinke et al. 2013); graphisch: Candidatus Aenigmarchaeota, Lifemap NCBI Version.
  7. ↑ Céline Petitjean, Philippe Deschamps, Purificación López-García, David Moreira: Rooting the domain archaea by phylogenomic analysis supports the foundation of the new kingdom Proteoarchaeota. In: Genome Biology and Evolution. Band 7, Nr. 1, Januar 2015, ISSN 1759-6653, S. 191–204, doi:10.1093/gbe/evu274, PMID 25527841, PMC 4316627 (freier Volltext) – (Epub 19. Dezember 2014).
  8. ↑ Julia M. McGonigle, Jeremiah A. Bernau, Brenda B. Bowen, William J. Brazelton: Robust Archaeal and Bacterial Communities Inhabit Shallow Subsurface Sediments of the Bonneville Salt Flats. In: mSphere. 28. August 2019, doi:10.1128/mSphere.00378-19, PMID 31462415.
  9. ↑ DHVE3 group archaeon 000106-F11 und Gp0018860, Joined Genome Institute, DOE Office of Science.
  10. ↑ NCBI Taxonomy: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon JGI 0000106-F11 (ncbi.nlm.nih.gov).
  11. ↑ Homestake Mine (South Dakota), City of Lead. Auf: GeoNames.
  12. ↑ Go0011606 und Go0011606 §Environmental Metadata, Joined Genome Institute, DOE Office of Science.
  13. ↑ Aharon Oren, George M. Garrity, Charles T. Parker, Maria Chuvochina, Martha E.YR 2020 Trujillo: Lists of names of prokaryotic Candidatus taxa. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 70, Nr. 7, 30. Juni 2020, ISSN 1466-5034, S. 3956–4042, doi:10.1099/ijsem.0.003789.