B-DNA ist eine der möglichen Doppelhelix-Strukturen von DNA.
B-DNA ist eine der möglichen Doppelhelix-Strukturen von DNA.
B-DNA ist eine rechtsgängige doppelsträngige DNA-Doppelhelix, die im Vergleich zur A-Form entspannter ist und deren Nukleinbasen orthogonal zur Helixachse ausgerichtet sind. B-DNA ist die unter physiologischen Bedingungen typisch vorliegende Form doppelsträngiger DNA, z. B. bei Chromosomen in Zellen. Andere DNA-Strukturen sind z. B. A-DNA, Z-DNA, hairpin, triplex, cruciform, left-handed Z-form, tetraplex und A-motif. Aufgrund der entspannteren Form besitzt B-DNA im Vergleich zu A-DNA eine kleinere Anzahl an Nukleinbasen pro Windung der Helix, eine flachere große Furche, eine tiefere kleine Furche und ist um etwa 30 % länger pro Windung.
| Geometrie | A-Form | B-Form | Z-Form |
|---|---|---|---|
| Helix-Drehrichtung | rechtsgängig | rechtsgängig | linksgängig |
| Wiederholungseinheit | 1 bp | 1 bp | 2 bp |
| Rotation/bp | 33,6° | 34,6° | 60°/2 |
| bp/Windung | 11 | 10,4 | 12 |
| Inklination der bp zur Achse | +19° | −1,2° | −9° |
| Länge/bp entlang der Achse | 2,4 Å (0,24 nm) | 3,4 Å (0,34 nm) | 3,7 Å (0,37 nm) |
| Länge/Windung | 24,6 Å (2,46 nm) | 33,2 Å (3,32 nm) | 45,6 Å (4,56 nm) |
| Biegung (propeller twist) | +18° | +16° | 0° |
| Glycosylwinkel | anti | anti | Pyrimidin: anti, Purin: syn |
| Phosphatabstand | 5,9 Å | 7,0 Å | C: 5,7 Å, G: 6,1 Å |
| Glycosylflexibilität (sugar pucker) | C3’-endo | C2'-endo | C: C2'-endo, G: C3’-endo |
| Durchmesser | 23 Å (2,3 nm) | 20 Å (2,0 nm) | 18 Å (1,8 nm) |