Bernhaupten ist ein Gemeindeteil von Bergen im oberbayerischen Landkreis Traunstein.

Das Kirchdorf wurde als „Pernhupte“ um die Mitte des 12. Jahrhunderts erstmals urkundlich genannt.
Nördlich des Ortes wurde um 1866 der Bahnhof von Bergen errichtet. Diese Verkehrsanbindung und der Bau der Bundesautobahn 8 führten zum starken Anwachsen von Bernhaupten.
| Jahr | 1871 | 1950 | 1970 | 1987 |
| Einwohner | 59 | 135 | 397 | 599 |
Siehe auch: Liste der Baudenkmäler in Bergen (Chiemgau)#Weitere Ortsteile
Koordinaten: 47° 49′ 30,5″ N, 12° 35′ 34,7″ O