Im Rahmen ihres FictionJunction Projekts tat sie sich immer wieder mit einzelnen Sängerinnen zusammen, wobei sie bei Live-Auftritten meist auch am Klavier und gelegentlich als Backgroundsängerin zu sehen war. An den Namen FictionJunction wurde bei diesen Gruppierungen jeweils der Vorname der Sängerin angehängt. Das erfolgreichste dieser Duos war FictionJunction YUUKA, das sie 2003 mit Yūka Nanri bildete. Am 29. April 2009 wurde die Single Parallel Hearts mit Kaori Oda, Keiko Kubota, Wakana Ōtaki und Yuriko Kaida als Sängerinnen unter dem Namen FictionJunction –ohne weiteren Anhang– veröffentlicht, die als Opening für die Anime-Serie Pandora Hearts diente.
2007 gründete sie mit Keiko Kubota, Wakana Ōtaki, Hikaru Masai und Maya Toyoshima die Band Kalafina.
Am 8. August 2003 erschien ihr erstes Solo-Album Fiction, das auch in den USA erschien und seit August 2004 auch in Deutschland erhältlich ist. Das zweite Album mit dem Titel FictionII erschien am 30. März 2011 in Japan.
Ihre Musik klingt mystisch bis trancig und die Melodie wird oft von einer Violine getragen. Die Texte sind vorwiegend englisch, japanisch, selten lateinisch oder yukarisch (kajiurago), eine lateinisch anmutende Pseudosprache, die sie selbst erfunden hat und die aus einer freien Aneinanderreihung von Silben besteht.
Diskografie
Yuki Kajiura bei der Anime Expo 2012.
Alben
1993: Girl’s kitchen -fun house girl pop table- (2/12)
1994: Girlpop SenGen! fun house edition (2/10)
1994: Afternoon Tea I -interior music style- (1/7)
1994: Snow Kiss…Ing II ~for Friends~ (1/16)
1995: ROOMS Vol.1 Ima nara mou ichido hanashitai (1/10)