In der Ortslage konnten germanische und slawische Körperbestattungen nachgewiesen werden. 1254 wurde Klessin (Knutschin slawischer Herkunft) erstmals urkundlich erwähnt. Längere Zeit war Clessin ein Gut der bekannten Familie von der Marwitz, vermutlich als Nebengut von Friedersdorf. Scheinbar ab 1839 war der Eigentümer dann der Kammergerichts-Präsident a. D. Bonseri.
Von 1824 bis 1874 war die briefadelige Familie von Gansauge, vertreten durch Louis von Gansauge, Gutspächter des alten Rittergutes Klessin. Er wurde 1870 zum Schiedsmann des Lebuser Kreises bestellt. Neun Jahre später war nach dem amtlichen Generaladressbuch der Ritterguts- und Gutsbesitzer für die Provinz Brandenburg das Clessiner Gut 361 ha groß. Oberamtmann von Gansauge wohnte auf der Domäne Lebus / Amt Lebus, welches zuerst von seinem 1861 geadelten Vater August von Gansauge (1795–1863), dann von seinen Bruder Emil von Gansauge (1829–1893) gepachtet war. Als Clessiner Pächter, 402 ha-Rittergut, folgte Hauptmann a. D. Heinrich von Gansauge, gleichfalls mit Hauptwohnsitz in Lebus. 1914 gilt als Rittergutsbesitzer der Leutnant d. R. Otto von Albedyll. Sein Besitz umfasste 447 ha, den Gutsbetrieb führte als Verwalter Inspektor Franz Krause. Vor der großen Wirtschaftskrise 1929/1930 besaß das Rittergut einen Umfang von genau 423,50 ha. Im Mittelpunkt stand die Schweinezucht und vor allem die Schafsviehwirtschaft. Des Weiteren wurde wohl bereits als technische Ausrüstung ein eigener Motorpflug eingesetzt.
Letzte Besitzer des Gutes war ab 1911 durch Kauf die Adelsfamilie von Albedyll, vertreten durch den Offizier Otto von Albedyll (1887–1957). Er hat eine wechselvolle Vita und war zum Schluss Präses, also Vorsitzender, des Familienverbandes und verbrachte seinen Lebensabend in der DDR.
Am 4. Februar 1945 befand sich ein Bataillon Volkssturm im Ort. Später trafen die ersten Einheiten der Panzergrenadier-Division „Kurmark“ ein und verstärkten die Volkssturmeinheit aus München.
Am 22. März musste Klessin aufgegeben werden. Durch die schweren und verlustreichen Kämpfe wurde der Ort völlig zerstört und in großen Teilen (Schloss mit Ortsmitte) nicht wieder aufgebaut. 2009 und 2010 konnten durch die ehrenamtlichen Helfer des Vereines zur Bergung Gefallener in Osteuropa (VBGO) weitere 13 gefallene deutsche Soldaten geborgen werden. Bisher konnte nur ein geringer Teil der geschätzten 300 deutschen Toten geborgen werden.
Seit 2008 wird das Radrennen Oderrundfahrt vom Frankfurter Radsport-Club 90 (FRC) aus Frankfurt (Oder) am Ort organisiert. Der Rundkurs besteht aus einer 4,5Kilometer langen Strecke, die mit einem steilen 800Meter langen Anstieg und einer nicht minder langen Abfahrt besteht und um die Orte Klessin und Wuhden führt.
2023 wurde vom Wuhdener Heimatverein e.V. auf dem Areal des heute wüst liegenden Ritterguts und des Schlosses der Gedenkort „Kriegsschauplatz Schloss Klessin 1945“ mit umfangreichen Informationen über die Ereignisse vom Februar und März 1945 eröffnet.
Gerald Ramm, Mathias Hiller: Gott mit uns: Kriegserlebnisse aus Brandenburg und Berlin. Verlag Gerald Ramm, Woltersdorf b. Berlin 2005, ISBN 978-3-930958-11-5.
Richard Lakowski: Seelow 1945. Die Entscheidungsschlacht an der Oder. 5. Auflage, Hrsg. Militärgeschichtliches Forschungsamt, Brandenburgisches Verlags-Haus-Sankt Augustin, Siegler Verlag, Königswinter 2005, ISBN 978-3-87748-634-4.
Klaus Stieger: Historische Ansichten aus dem Kreis Lebus. 1857–1945. Findling Verlag, Neuenhagen 2005, S.140. ISBN 978-3-933603-36-4.
Tony Le Tissier: Durchbruch an der Oder. Der Vormarsch der Roten Armee 1945. Ins Dt. Übertrag: Irene Meyer, Friederike Tribukait, Ullstein Hc, Berlin, Frankfurt/Main 1995, ISBN 978-3-550-07072-3.
R. Schulz-Rosengarten: Ein leidgeprüftes Land. Der brandenburgische Kreis Lebus in den Wirren der Jahre 1945–1952. Ereignisse und Berichte ehemaliger Kreisbewohner aus der damaligen Zeit/Heimatkreis Lebus. Hrsg. Heimatkreis Lebus, Eigenverlag Heimatkreis Lebus, Lebus 1992.
↑Freiherr L. v. Zedlitz-Neukirch:Neues Preussisches Adels-Lexicon oder genealogische und diplomatische Nachrichten. 1837. In: Vorstand von einem Vereine von Gelehrten und Freunden der vaterländischen Geschichte (Hrsg.): Standardwerk der Genealogie. Dritter Band I - O. Gebrüder Reichenbach, Leipzig 1837, S.362 (Digitalisat).
↑Ordens-Liste. 1845 Rother Adler-Orden. Dritte Klasse. Rother Adler-Orden. Dritte Klasse. Gedruckt in der Deckerschen Geheimen Ober=Hofbuchdruckerei, Berlin 1845, S.115 (Digitalisat).
↑Hand-Matrikel der in sämmtlichen Kreisen des Preussischen Staats auf Kreis- und Landtagen vertretenen Rittergüter. [1857]. Provinz Brandenburg. In: K. Fr. Rauer (Hrsg.): Übersicht für den Gutsbesitz. Verlag des Herausgebers, Berlin 1857, S.87 (Digitalisat).
↑Amts-Blatt der Königlich Preußischen Regierung zu Frankfurt a./ O. 1870. Redigiert im Bureau der Königlichen Regierung, Nr.33. Druck der Hofbuchdruckerei von Trowitzsch & Sohn, Frankfurt a./O 17.August 1870, S.230 (Digitalisat).
↑Georg Volger: Handbuch des Grundbesitzes im Deutschen Reiche. 1896. Erste Lieferung: Provinz Brandenburg. 3. Auflage, Kreis Lebus, Nicolai’sche Verlags-Buchhandlung R. Stricker, Berlin 1896, S. 74 f.
↑Ernst Seyfert: Güter-Adreßbuch für die Provinz Brandenburg. Verzeichnis sämtlicher Rittergüter, Güter und größeren Bauernhöfen. [1914]. Handbuch der Königlichen Behörden. Nach amtlichen Quellen und auf Grund direkter Angaben bearbeitet. In: Niekammer’s Landwirtschaftliche Güter-Adreßbücher, Band VII, 2. Auflage, Regierungsbezirk Frankfurt a.O. Kreis Lebus, Reichenbach’sche Verlagsbuchhandlung, Leipzig 1914, S. 284 f.
↑Ernst Seyfert, Hans Wehner, Alexander Haußknecht:Landwirtschaftliches Adreßbuch der Rittergüter, Güter und Höfe der Provinz Brandenburg. 1929. Verzeichnis sämtlicher Rittergüter, Güter und Höfe über 20 ha. Nach amtlichen Angaben. In: Paul Niekammer-Nachfolge (Hrsg.): Landwirtschaftliches Adressbuch. Letzte Ausgabe für die Provinz Brandenburg. 4. Auflage. BandVII.. Niekammer’s Adressbüchern GmbH, Leipzig 1929, S.233f. (Digitalisat).
↑Hubertus v. Albedyll:Chronik des Geschlechts der Gesamtfamilie Freiherr v. Albedy(h)ll - v. Albedy(h)ll. In: Familienverband (Hrsg.): Genealogie/Familienchronik. Überarbeitete und erweiterte Ausgabe Auflage. Eigenverlag, Lohmar-Honrath 2008, S.281–290 (DNB).
↑Richard Lakowski: Seelow 1945. Die Entscheidungsschlacht an der Oder. 1. Auflage, Mittler, im Maximilian Verlag GmbH & Co. KG, Hamburg 2017, S. 35. ISBN 978-3-8132-0974-7.
↑Heimatkreis Lebus (Hrsg.): Ein leidgeprüftes Land: Der brandenburgische Kreis Lebus in den Wirren der Jahre 1945–1952. Eigenverlag Heimatkreis Lebus, Lebus 1992, S.31 ff.
↑Tony Le Tissier: Durchbruch an der Oder. Der Vormarsch der Roten Armee 1945. Ullstein, Frankfurt a. M./ Berlin 1995, ISBN 3-550-07072-1, S. 106 ff.