Minisyncoccia

Minisyncoccia
	TEM-Aufnahme einer sich gerade teilenden Zelle von Minisyncoccus archaeiphilus PMX.108ᵀ, anhaftend an einem Archaeon (Methanospirillum hungatei DSM 864ᵀ)
Systematik
Domäne:	Bakterien (Bacteria)
Reich:	Terrabakterien (Bacillati)
Stamm:	CPR-Gruppe (Minisyncoccota)
Klasse:	Minisyncoccia
Wissenschaftlicher Name
	Minisyncoccia
	Nakajima et al. 2025

Minisyncoccia (zuvor „Ca. Paceibacteria“) ist eine Klasse von Bakterien im Phylum (Abteilung, englisch division, lateinisch divisio) Minisyncoccota (früher „CPR-Gruppe“).

Die Mitglieder waren lange Zeit nur durch ihre Gensequenzen bekannt (Metagenomik). Erst 2025 gaben Nakajima et al. die Kultivierung von Minisyncoccus archaeiphilus bekannt, sodass heute Minisyncoccus als Typusgattung der nach ihr neu benannten Klasse gilt.

Zur Klade der „Parcunitrobakterien“ (etwa Klasse „Ca. Parcunitrobacteria“) siehe unten.

Beschreibung

Wie andere Vertreter des Phylums Minisyncoccota haben diese Bakterien ein kleines Genom und eingeschränkte Stoffwechselfunktionen. sodass sie auf die Symbiose mit anderen Mikroorganismen angewiesen sind. Einige Vertreter der Klasse Minisyncoccia konnten als Endosymbionten von mit Archaeen dokumentiert oder sogar mit diesen co-kultiviert werden. Dazu gehören beispielsweise die folgenden Mitglieder:

Minisyncoccus archaeiphilus, Familie Minisyncoccaceae in der Ordnung Minisyncoccales
„Ca. Yanofskyibacterium parasiticum“, Familie „Ca. Yanofskyibacteriaceae“ [f__UBA5738] (nicht Teil der Ordnung „Yanofskybacterales“ [o__2-02-FULL-40-12], sondern auch von Minisyncoccales)
UBA5738 sp022530585 [Ca. Nealsonbacteria bacterium DGGOD1a], laut GTDB ebenfalls Familie „Ca. Yanofskyibacteriaceae“, nicht Familie „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01^(G)]

Alle diese Beispiele werden in der GTDB daher in die Ordnung Minisyncoccales klassifiziert.

Im Gegensatz zur Klasse „Ca. Saccharimonadia“ [„Ca. Saccharibacteria“] handelt es sich hier also nicht um eine Symbiose mit anderen Bakterien (Mikroorganismen der eigenen Domäne, etwa als Intra-Domänen-Parasitismus), sondern um einen Inter-Domänen-Parasitismus (zwischen Organismen verschiedener Domänen).

Familie „Ca. Yanofskyibacteriaceae“ [f__UBA5738]

Kyohei Kuroda et al. berichteten 2022–2024 über ihre Entdeckung einiger kleiner Bakterien, die sie in die Gruppe „Ca. Patescibacteria“ (heute Phylum Minisyncoccota) einordneten und die in in Bioreaktoren zur Behandlung von Abwässern vorkommen. Diese leben als Symbionten auf Methanothrix-ähnlichen methanogener Archaeen – damals zum Superphylum DPANN klassifiziert, heute in die Ordnung Methanosarcinales des Archaeen-Reichs Methanobacteriati gestellt. Mittels mittels Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (FISH) zeigte sich, dass fast alle dieser der GTDB-Familie f__UBA5738 zugehörigen Minibakterien an Filamenten von Methanothrix hafteten (95,7 ± 2,1 %). Keine der Zellen war an andere Bakterien gebunden war, was auf eine hohe und ganz spezifische Abhängigkeit vom diesem Wirt hindeutete. FISH zeigte auch, dass es bei den (mehrzelligen) Methanothrix-Filamenten mit anhaftenden Minibakterien von f__UBA5738 deutlich mehr Zellen ohne oder mit nur geringer Aktivität ihrer Ribosomen gab; TME-Aufnahmen zeigten zudem häufig Deformationen an den Anhaftungsstellen. Metagenomik-Analysen zeigten, dass den Minibakterien die meisten für das Zellwachstum notwendigen Biosynthesewege fehlen. All dies deutet darauf hin, dass diese Symbiose zum Schaden der Archaeen ist, und es sich daher um eine Form von Parasitismus handelt. Die GTDB-Familie f__UBA5738 wurde damals der Klade „Ca. Yanofskybacteria“ zugerechnet, sodass die Autoren die in dieser Umgebug überwiegend vorkommende Spezies „Ca. Yanofskyibacterium parasiticum“ nannten und der Familie die noch freie Bezeichnung „Ca. Yanofskyibacteriaceae“ gaben. Heute wird allerdings diese Familie in der GTDB in die Ordnung Minisyncoccales gestellt, während die meisten früher als Yanofskyibacteria bezeichneten Stämme in der GTDB der Ordnung o__2-02-FULL-40-12 („Yanofskybacterales“) angehören – beide Ordnungen sind jedoch Mitglieder der gleichen Klasse Minisyncoccia.

Minisyncoccaceae

Kyohei Kuroda et al. fiel in den methanogenen Bioreaktoren eine weitere dominierende Familie von „Ca. Patescibacteria“ (heute Phylum Minisyncoccota) auf, nämlich Minisyncoccaceae (ursprüngliche GTDB-Bezeichnung f__UBA5633). Vorherrschend war hier der Stamm 32_520 (NCBI-Bezeichnung Parcubacteria bacterium 32_520, GTDB-Gattung 32-520). Wie bei Methanothrix mit anhaftenden Zellen von „Ca. Yanofskyibacteriaceae“ konnte mit FISH gezeigt werden, dass auch die Archaeen von Methanospirillum (Ordnung Methanomicrobiales im Reich Methanobacteriati) mit anhaftenden Minisyncoccaceae eine deutlich geringere Zellaktivität aufweisen als andere, die frei von diesen Minibakterien sind.

Meri Nakajama et al. berichteten dann im Jahr 2025 über ihre erfolgreiche Co-Kultivierung eines Bakteriums dieser Familie zusammen mit einem Methanospirillum-Archaeon:

die neue Spezies Minisyncoccus archaeiphilus mit ihrem Referenzstamm JCM 39522 alias PMX.108; Mitglied der CPR-Gruppe (von ihnen erstmals als Minisyncoccota bezeichnet),
die Archaeenspezies Methanospirillum hungatei mit ihrem Referenzstamm DSM 864 alias JF-1; Familie Methanospirillaceae, Ordnung Methanomicrobiales, Klasse Methanomicrobia, Phylum (Methanobacteriota)

Diese beiden Prokaryoten leben in der von den Autoren erstmals co-kultivierten domänenübergreifenden Symbiosegemeinschaft, wobei das anaerobe Bakterium ein obligater Parasit des Archaeons ist, denn es war nicht möglich, das Bakterium in Reinkultur (axenischer Kultur) zu züchten, da es strikt abhängig von seinem Wirt Methanospirillum hungatei ist.

Der Bakterienstamm Stamm PMX.108^T wurde aus mesophilem methanogenem Schlamm in einem anaeroben Bioreaktor isoliert, in dem Produktionsabwasser einer Synthese von Terephthalat und Dimethylterephthalat gereinigt wurde. Das Genom von PMX.108^T ist im Vergleich zu anderen CPR-Mitgliedern mit 1,54 Mbp (Megabasenpaaren) relativ groß. Einige fehlende Stoffwechsel-Gene erklären die Abhängigkeit vom Wirt, von dem die Substanzen bezogen werden müssen, die das Bakterium nicht selbst biosynthetisieren kann. Stattdessen kodiert das ultrakleine Bakterium Gene für Typ-IV-Pili, die mit der parasitären Lebensweise in Verbindung stehen. Der G+C-Gehalt der Genom-DNA beträgt 36,6 mol%. Aufgrund dieser erstmaligen (Co-)Kultivierung eines CPR-Mitglieds schlugen die Autoren für seine Familie, Ordnung, Klasse und das Phylum selbst als offizielle Bezeichnungen Minisyncoccaceae, Minisyncoccales, Minisyncoccia und Minisyncoccota (im Bakterienreich Bacillati) vor.

Phylogenie und Taxonomie

Diskussion

Der taxonomische Status der Parcunitrobakterien-Klade (mit Typusart „Candidatus Parcunitrobacter nitrogeniphilus“ und ihrem Referenzstamm bzw. MAG GW2011_GWA2_38_13b) ist noch in der Diskussion (Stand 1. März 2026):

in der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI) bilden sie eine eigene Klasse „Ca. Parcunitrobacteria“ innerhalb der „Patescibacteria-Gruppe“ (und damit des Phylums Minisyncoccota alias „Patescibacteriota“ oder CPR-Gruppe).
in der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) bilden sie ein eigenes Bakterien-Phylum „Ca. Parcunitrobacterota“ (synonym zum früheren „Ca. Parcunitrobacteria“ im Rang eines Phylums) ohne Zuweisung zueinem der Bakterienreiche.
in der Genome Taxonomy Database (GTDB) bildet die Klade um den Stamm GW2011_GWA2_38_13b eine Ordnung o__GWA2-38-13b des Phylums „Patescibacteriota“ [Minisyncoccota], mit Familie f__GWA2-38-13b, Gattung GWA2-38-13b und Spezies GWA2-38-13b sp000992445, was zeigt, dass hier auf jeder Rangstufe entsprechend synonymisiert werden kann von der Art (Spezies) bis hinauf zur Ordnung „Ca. Parcunitrobacterales“ syn. o__GWA2-38-13b.

Die unten angegebene Phylogenie folgt der GTDB mit den obigen Synonymisierungen, die Systematik bildet dagegen die Taxonomie des NCBI in den hohen Rangstufen („Megataxonomie“) transparent ab.

Viele weitere Teilgruppen wurden ursprünglich als Phyla vorgeschlagen. Die Unterschiede in den kleinen Genomen dieser Bakterien gelten heute jedoch als ursprünglich überbewertet, so dass für diese Kladen heute niedrigere taxonomische Rangstufen angenommen (Ordnungen oder Familien) werden. Viele Gruppen wurden aufgeteilt, sei es wegen Polyphylie oder um Kladen mit Rang zwischen Familie und Ordnung auf Teilgruppen mit Familienrang herabzubrechen (siehe unten).

Wegen dieser Verschiebungen gehört die Familie „Ca. Yanofskyibacteriaceae“ [f__UBA5738] zur Ordnung Minisyncoccales und nicht zur Ordnung „Yanofskybacterales“ [o__2-02-FULL-40-12], die abgesehen davon etliche andere als Yanofskybacteria bezeichnete Stämme als Mitglieder anderer Familien enthält (siehe unten).

Phylogenie

Phylogenie der Minisyncoccia inkl. Parcunitrobacteria

„Moranbacterales“

o__UBA6257 ^♠

„Jorgensenbacteraceae“ [f__GWB1-50-10]

„Wolfebacteraceae“ [f__UBA9933]

„Colwellbacteraceae“

	„Harrisonbacteraceae“ [f__WO2-44-18]

	„Liptonbacteraceae“ [f__2-01-FULL-56-20]

„Brennerbacteraceae“

^♣

	„Spechtbacterales“

	„Terrybacterales“

„Parcunitrobacterales“ [o__GWA2-38-13b]

„Portnoybacterales“

„Paceibacterales“ [Minisyncoccales]

„Wildermuthbacteraceae“ [f__UBA10102]

„Gribaldobacteraceae“ [f__CG1-02-41-26]

„Paceibacteraceae“ [„Parcubacteria“]

	„Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]

	„Staskawiczbacteraceae“

„Azambacterales“ [o__UBA10092]

„Yanofskybacterales“ [o__2-02-FULL-40-12]

„Sungbacterales“

„Ryanbacterales“

„Giovannonibacterales“ (UBA11713)

„Niyogibacterales“ [o__HO2-45-28]

„Tagabacterales“ [o__JAHISW01]

Phycocordibacterales [o__UBA9973] ^◆

„Yonathbacteraceae“ [f__UBA1539]

„Nomurabacteraceae“ [f__UBA9973]

	„Adlerbacteraceae“ [f__SBAW01]

	„Kaiserbacteraceae“ [f__UBA2103]

„Campbellbacteraceae“ [f__UBA12079]

	„Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]

	„Zambryskibacteraceae“

„Vogelbacteraceae“ [f__XYD1-FULL-46-19]

^♣

Klade „Parcubacteria 2“

^♠

Klade „Parcubacteria 3“

^◆

Klade „Parcubacteria 4“

Systematik

Die Systematik der Klasse Minisyncoccia ist mit Stand 5. März 2026 auszugsweise wie folgt:

Klasse Minisyncoccia Nakajima et al. 2025^(L,N,G)
„Ca. Paceibacteria“ Chuvochina et al. 2023^(N)
„Ca. Elulimicrobia“ Rodriguez-R et al. 2020^(N) bzw. Rodriguez et al. 2020^(L)
„Ca. Elulimicrobiia“ corrig. Rodriguez et al. 2020^(L)

Ordnung „Ca. Azambacterales“^(G°) [o__UBA10092^(G)] – früher Phylum „Ca. Azamiibacteriota“ corrig. Brown et al. 2015 [„Ca. Azambacteria“ Brown et al. 2015]^(L°,N)
- Familie f__UBA10092^(G)
  - Gattung 2-02-FULL-45-18^(G)
    - Spezies 2-02-FULL-45-18 sp001774075^(G) [Ca. Azambacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_44_84^(N,G)]
  - Gattung GWA1-42-19^(G)
    - Spezies GWA1-42-19 sp000994805^(G) [Ca. Azambacteria bacterium GW2011_GWA2_42_9^(N,G)]
  - Gattung JACPHB01^(G)
    - Spezies JACPHB01 sp016188835^(G) [Parcubacteria group bacterium isolate NC_groundwater_403_Ag_B-0.1um_39_20^(N,G)]
    - Spezies JACPHB01 sp016186325^(G) [Parcubacteria group bacterium isolate NC_groundwater_531_Ag_S-0.1um_41_15 ^(N,G)]
  - Gattung UBA10092^(G)
    - Spezies UBA10092 sp003455995^(G) [Ca. Azambacteria bacterium UBA12106^(N,G)]

Ordnung „Ca. Giovannonibacterales“^(G°) [o__UBA11713^(G)] – früher Phylum „Ca. Giovannoniibacteriota“ corrig. Brown et al. 2015^(L,N) [„Ca. Giovannonibacteria“ Brown et al. 2015]^(L°,N) – siehe auch Abspaltung o__JACPKW01 mit Familie f__UBA11713 in dieser Klasse
- Familie f__2-01-FULL-45-33^(G)
  - Gattung 2-01-FULL-45-33^(G)
    - Spezies 2-01-FULL-45-33 sp001778875^(G) [Ca. Giovannonibacteria bacterium RIFCSPLOWO2_02_FULL_43_54^(N,G)]

Ordnung Minisyncoccales Nakajima et al. 2025^(L,G) [„Ca. Paceibacterales“ Chuvochina et al. 2023^(L)]
- Familie „Gribaldobacteraceae“^(G°) [f__CG1-02-41-26^(G)] – früher Phylum „Ca. Gribaldonibacteriota“ corrig. Probst et al. 2018 [„Candidatus Gribaldobacteria“ Probst et al. 2018]^(L°,N)
  - Gattung CG1-02-41-26^(G)
    - Spezies CG1-02-41-26 sp002773545^(G) [Ca. Gribaldobacteria CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_41_12^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie Minisyncoccaceae Nakajima et al. 2025^(L,N,G) [„Ca. Minisyncoccaceae“ Kuroda et al. 2024^(L), f__UBA5633^(G°)]
  - Gattung „Ca. Microsyncoccus“ Kuroda et al. 2024^(L,N,G)
    - Spezies „Ca. Microsyncoccus archaeolyticus“ Kuroda et al. 2024^(L,N,G)
  - Gattung Minisyncoccus Nakajima et al. 2025^(L,N,G)„Ca. Minisyncoccus“ Kuroda et al. 2024^(L,N)
    - Spezies Minisyncoccus archaeiphilus Nakajima et al. 2025^(L,N,G) (Typusart)
    - Spezies Minisyncoccus sp023228085^(G) [Bacterium isolate SO_2017_LW4 bin 114^(N,G)]
    - Spezies Minisyncoccus sp023229485^(G) [Minisyncoccota bacterium isolate SO_2016_LW1_35^(N,G)]
    - Spezies …^(G)
  - Gattung GCA-002790695^(G)
    - Spezies GCA-002790695 sp002780915^(G) [Ca. Nealsonbacteria bacterium CG02_land_8_20_14_3_00_34_20^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung 32-520^(G°)
    - Spezies Parcubacteria bacterium 32_520^(N,G)
- Familie „Ca. Nealsonbacteraceae“^(G°) [f__PWPS01^(G)] – früher Phylum „Ca. Nealsoniibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 „Ca. Nealsonbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
  - Gattung PWHW01^(G)
    - Spezies PWHW01 sp003551435^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate B1Sed10_223R1^(N,G)]
  - Gattung PWNV01^(G)
    - Spezies PWNV01 sp003551425^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate B1Sed10_223R2^(N,G)]
  - Gattung PWPS01^(G)
    - Spezies PWPS01 sp003557065^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate CSSed10_436R1^(N,G)]
  - Gattung T1SED10-78^(G)
    - Spezies T1SED10-78 sp003553505^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate T1Sed10_78^(N,G)]
- Familie „Ca. Paceibacteraceae“ Chuvochina et al. 2023^(L,N,G)
  - Gattung „Ca. Paceibacter“ Rinke et al. 2013^(L,N,G)
    - Spezies „Ca. Paceibacter normanii“ Rinke et al. 2013^(L,N,G), Stamm SCGC AAA255-P19^(L,N,G)
    - Spezies Paceibacter sp001872265^(G) [Parcubacteria group bacterium CG1_02_39_15^(N,G), Ca. Nealsonbacteria bacterium CG_4_10_14_0_2_um_filter_39_15^(N,G)] (letzterer verschoben)
    - Spezies Ca. Paceibacter sp. isolate SulCav_AS07-7_36_24^(N,G)
- Familie „Ca. Staskawiczbacteriaceae“ Chuvochina et al. 2023^(L°) [Staskawiczbacteraceae^(G)] – früher Phylum „Ca. Staskawicziibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Staskawiczbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
  - Gattung 01-FULL-38-12b^(G)
    - Spezies 01-FULL-38-12b sp001820175^(G) [Ca. Staskawiczbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_02_FULL_42_22^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie „Ca. Wildermuthbacteraceae“^(G°) [f__UBA10102^(G), RIF21-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Wildermuthiibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [ „Ca. Wildermuthbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
  - Gattung UBA10102^(G)
    - Spezies UBA10102 sp001825035^(G) [Ca. Wildermuthbacteria bacterium RIFOXYD1_FULL_50_12^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- TME-Aufnahmen der kleinen Zellen (Familie „Ca. Yanofskybacteraceae“ [f__UBA5738]), die sich nach 40 Tagen im Kultursystem A-d2 an die Methanothrix-ähnlichen Wirtszellen anlagert haben. S bezeichnet die Hüllstrukturen der Wirtszellen.
  Familie „Ca. Yanofskyibacteriaceae“ Kuroda et al. 2024^(L,N)) [f__UBA5738^(G)] – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01], aber hier in der Ordnung Minisyncoccales verblieben und nicht abgetrennt mit Ordnung „Yanofskybacterales“ [o__2-02-FULL-40-12]
  - Gattung „Ca. Yanofskyibacterium“ Kuroda et al. 2024^(L,N)
    - Spezies „Ca. Yanofskyibacterium parasiticum“ Kuroda et al. 2024^(L,N) mit Stamm PMX_810_sub^(L,N,G)
  - Gattung CAINCQ01^(G)
    - Spezies CAINCQ01 sp022710775^(G) [Patescibacteria group bacterium isolate RA.bin35^(N,G)]
    - Spezies CAINCQ01 sp903847095^(G) [Uncultured bacterium isolate AM-2014-D8_bin-0821^(N,G)]
  - Gattung UBA5738^(G)
    - Spezies UBA5738 sp002419295^(G) [Patescibacteria group bacterium UBA5738^(N,G)]
    - Spezies UBA5738 sp002423555^(G) [Patescibacteria group bacterium UBA6102^(N,G)]
    - Spezies UBA5738 sp022530585^(G) [Ca. Nealsonbacteria bacterium DGGOD1a^(N,G)]
    - Spezies UBA5738 sp025453415^(G) [Minisyncoccota bacterium isolate Prado154^(N,G)]
    - Spezies UBA5738 sp034678605^(G) [Patescibacteria group bacterium isolate POMEDNA-B22^(N,G)]
    - Spezies UBA5738 sp035362275^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon isolate AMR_MDS_1835^(N,G)]
    - Spezies UBA5738 sp041663885^(G) [Ca. Minisyncoccota bacterium isolate SO_2016_LW1_25^(N,G)]
- Familie f__2-12-FULL-40-12^(G) – abgetrennt von „Wildermuthbacteraceae“ [f__UBA10102]
  - Gattung 2-12-FULL-40-12^(G)
    - Spezies 2-12-FULL-40-12 sp001823315^(G) [Ca. Wildermuthbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_12_FULL_40_12^(N,G)]
  - Gattung BBTXV01^(G)
  - Gattung VMFS01^(G)
- Familie f__CSSED10-335(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung CSSED10-335^(G)
    - Spezies CSSED10-335 sp003557585^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate CSSed10_355^(N,G)]
- Familie f__DG-74-1^(G)
  - Gattung DG-74-1
    - Spezies DG-74-1 sp001303125^(G) [Parcubacteria bacterium DG_74_1^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__DG-74-3^(G)
  - Gattung DG-74-3^(G)
    - Spezies DG-74-3 sp001302985^(G) [Ca. Parcubacteria bacterium DG_74_3^(N,G)]
  - Gattung …
- Familie f__DAOVPY01^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung DAOVPY01^(G)
    - Spezies DAOVPY01 sp030628945^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate CSMAG_1561^(N,G)]
- Familie f__GBS-2^(G)
  - Gattung CALHEE01^(G)
  - Gattung DAIRUS01^(G)
  - Gattung GBS-2^(G)
    - Spezies GBS-2 sp001443025^(G) [Parcubacteria bacterium GBS-2^(N,G)]
- Familie f__GCA-002773005^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung GCA-002773005^(G)
    - Spezies GCA-002773005 sp002771215^(G) [Ca. Nealsonbacteria bacterium CG23_combo_of_CG06-09_8_20_14_all_40_13^(N,G)]
- Familie f__GCA-002782225^(G)
  - Gattung GCA-002782225^(G)
    - Spezies GCA-002782225 sp002787295^(G) [Ca. Nealsonbacteria bacterium CG11_big_fil_rev_8_21_14_0_20_37_68
- Familie f__GCA-002779355^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gatung GCA-002779355^(G)
    - Spezies GCA-002779355 sp002779355^(G) [Ca. Nealsonbacteria bacterium CG07_land_8_20_14_0_80_39_13^(N,G)]
- Familie f__GWA2-38-27^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung XYB1-FULL-40-15^(G)
    - Spezies XYB1-FULL-40-15 sp001821555^(G) [Ca. Nealsonbacteria bacterium RIFOXYB1_FULL_40_15^(N,G)]
- Familie f__GWA2-46-15^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung GWA2-46-15^(G)
    - Spezies GWA2-46-15 sp016207115^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate NC_groundwater_1329_Ag_S-0.2um_51_38^(N,G)] (verschoben)
    - Spezies GWA2-46-15 sp001823105^(G) [Ca. Wildermuthbacteria bacterium GWA2_46_15^(N,G)] (verschoben)
- Familie f__JAGGXC01^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung JAPLXH01^(G)
    - Spezies JAPLXH01 sp026396195^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate LacPavin_0920_SED3_MAG_35_17^(N,G)]
  - Gattung JAPLXH01^(G)
- Familie f__JAGMDC01^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung DAOWLG01^(G)
    - Spezies DAOWLG01 sp030643485^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate CSMAG_2115^(N,G)]
  - Gattung JAGMDC01^(G)
- Familie f__JAHXGN01^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung JAHXGN01^(G)
    - Spezies JAHXGN01 sp019923625^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate Unc4B^(N,G)]
- Familie f__JANBVM01^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung JANBVM01^(G)
  - Gattung Nealson33H^(G)
    - Spezies Nealson33H sp026016225^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate Nealson33H^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__JAUWAW01^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung JAUWAW01^(G)
    - Spezies JAUWAW01 sp030601865^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate CSMAG_1304^(N,G)]
- Familie f__MHMH01^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung MHMH01^(G)
    - Spezies MHMH01 sp001819335^(G) [Ca. Nealsonbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_43_32^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__PETJ01^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung PETJ01^(G)
    - Spezies PETJ01 sp002781125^(G) [Ca. Nealsonbacteria bacterium CG01_land_8_20_14_3_00_12^(N,G)]
- Familie f__PEYH01^(G) – abgetrennt von „Wildermuthbacteraceae“ [f__UBA10102]
  - Gattung JBBIKX01^(G)
    - Spezies JBBIKX01 sp037445205^(G) [Ca. Wildermuthbacteria bacterium isolate MTF170219_bin_196^(N,G)]
  - Gattung PEYH01^(G)
  - Gattung …^(G)
- Familie f__PWMZ01^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung JAQVFW01^(G)
  - Gattung PWMZ01^(G)
    - Spezies PWMZ01 sp003556925^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate CSSed10_466R1^(N,G)]
- Familie f__RBG-13-36-15^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung __RBG-13-36-15^(G)
    - Spezies RBG-13-36-15 sp001819145^(G) [Ca. Nealsonbacteria bacterium RBG_13_36_15^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__RBG-13-42-11^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung RBG-13-42-11^(G)
    - Spezies RBG-13-42-11 sp001821455^(G) [Ca. Nealsonbacteria bacterium RBG_13_42_11^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__UBA6532^(G) – abgetrennt von „Nealsonbacteraceae“ [f__PWPS01]
  - Gattung JACPLN01^(G)
    - Spezies JACPLN01 sp016186485^(G) [Ca. Nealsoniibacteriota bacterium isolate NC_groundwater_522_Ag_S-0.1um_41_12^(N,G)]
  - Gattung JAUSNC01^(G)
  - Gattung UBA6532^(G)
- Familie …^(G)

Ordnung „Ca. Moranbacterales“ Chuvochina et al. 2023^(G°) [OD1-i-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Moraniibacteriota“ corrig. Brown et al. 2015 [„Ca. Moranbacteria“ Brown et al. 2015]^(L°,N)
- Familie „Ca. Fipalanaceae“ Pallen et al. 2022^(N) [f__UBA1568^(G)] – synonym wg. Gattung Ca. Niblixella
  - Gattung „Ca. Niblixella“ Pallen et al. 2022^(N) [g__SSEF01, SSEF01^(N,G)]
    - Spezies SSEF01 sp008012175^(G) [Ca. Moraniibacteriota bacterium isolate Bin_68_2^(N,G)]
    - Spezies SSEF01 sp016699425^(G) [Ca. Moraniibacteriota bacterium isolate EsbW_18-Q3-R4-48_MAXAC.278_cln^(N,G)]
  - Gattung UBA1568^(G)
  - Gattung …^(G)
- Familie f__GWC2-37-73^(G)
  - Gattung GWC2-37-8^(G)
  - Gattung UBA12068^(G)
    - Spezies UBA12068 sp000991645^(G) [Ca. Moranbacteria bacterium GW2011_GWE2_36_40^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__UBA11712^(G)
  - Gattung UBA11712^(G)
    - Spezies UBA11712 sp000995965^(G) [Ca. Moranbacteria bacterium GW2011_GWC2_40_12^(N,G)]
- Familie f__UBA9337^(G)
  - Gattung DYKS01^(G)
    - Spezies DYKS01 sp020722485^(G) [Ca. Elulimicrobium sp. isolate SulCav_AS07-7_35_57^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung UBA12151^(G)
    - Spezies UBA12151 sp000990585^(G) [Ca. Moranbacteria bacterium GW2011_GWE2_35_2-^(N,G)]
  - Gattung UBA9337^(G)
    - Spezies UBA9337 sp000990945^(G) [Ca. Moranbacteria bacterium GW2011_GWF2_35_54^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie …^(G)

Ordnung „Ca. Niyogibacterales“^(G°) [o__H02-45-28^(G), RIF11-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Niyogiibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Niyogibacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
- Familie f__H02-45-28^(G)
  - Gattung HO2-45-28^(G)
    - Spezies HO2-45-28 sp001819395^(G) [Ca. Niyogibacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_45_48^(N,G)]
  - Gattung …^(G)

Ordnung „Ca. Phycocordibacterales“ Jonas et al. 2025^(L,N) [o__UBA9973^(N,G), „Parcubacteria 4“, „Ca. Elulimicrobiales“ Rodriguez-R et al. 2020^(L,N)]
- Familie „Ca. Adlerbacteraceae“^(G°) [f__SBAW01^(G)] – früher Phylum „Ca. Adleribacteriotaa“ corrig. Brown et al. 2015 [„Ca. Adlerbacteria“ Brown et al. 2015]^(L°,N)
  - Gattung CALREW01^(G)
    - Spezies CALREW01 sp943356415^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate Ike-100m-41^(N,G)]
  - Gattung GWA1-54-10^(G)
    - Spezies GWA1-54-10 sp009691465^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate Baikal-deep-G203^(N,G)] (verschoben)
    - Spezies GWA1-54-10 sp943356495^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate TH-Jun18-118^(N,G)] (verschoben)
    - Spezies GWA1-54-10 sp001004665^(G) [Ca. Adlerbacteria bacterium GW2011_GWA1_54_10^(N,G)] u. a. m.
  - Gattung …^(G)
- Familie „Ca. Campbellbacteraceae“^(G°) [f__UBA12079^(G)] – früher Phylum „Ca. Campbelliibacteriota“ corrig. Brown et al. 2015 [„Ca. Campbellbacteria“ Brown et al. 2015]^(L°,N)
  - Gattung UBA12079^(G)
    - Spezies UBA12079 sp001029775^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium GW2011_OD1_34_28 / N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie „Ca. Elulimicrobiaceae“ Rodriguez-R et al. 2020^(L,N) [f__UBA918^(G)] – abgetrennt von „Ca. Kaiserbacteraceae“ [f__UBA2103]
  - Gattung „Ca. Elulimicrobium“ Rodriguez-R et al. 2020^(L,N) [OLB19^(G)]
    - Spezies „Ca. Elulimicrobium humile“ Rodriguez-R et al. 2020^(L,N) Stamm WB6_2A_207^(L,N)
    - Spezies OLB19 sp020720815^(G) [Ca. Elulimicrobium sp. isolate SulCav_GS09_5_3_41_19^(N,G)
    - Spezies Ca. Elulimicrobium sp. isolate SulCav_PC08_66_47_31^(N,G)]
  - Gattung 1-14-0-10-47-16^(G)
    - Spezies 1-14-0-10-47-16 sp002773395^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_59_10^(N,G)]
  - Gattung Damh-18^(G)
    - Spezies Damh-18 sp016699245^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate Damh_18-Q3-R51-60_MAXAC.235_fly^(N,G)]
  - Gattung HO2-49-34^(G)
    - Spezies HO2-49-34 sp001783515^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_50_10^(N,G)]
  - Gattung JACQKD01^(G)
    - Spezies JACQKD01 sp016204695^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate NC_groundwater_1168_Ag_S-0.1um_54_98^(N,G)]
  - Gattung JAGQLY01^(G)
    - Spezies JAGQLY01 sp020428905^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate HKST-UBA28^(N,G)]
  - Gattung JAHQWD01^(G)
    - Spezies JAHQWD01 sp019634005^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate MAG.121^(N,G)]
  - Gattung OLB19^(G)
    - Spezies OLB19 sp001567365^(G) [Parcubacteria bacterium OLB19^(N,G)]
    - Spezies OLB19 sp001779595^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_01_FULL_46_22^(N,G)]
    - Spezies OLB19 sp023898585^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate HK-STAS-PATE-25^(N,G)] (verschoben)
    - Spezies OLB19 sp943359405^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate RE-15aug16-192^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung …^(G)
- Klade (Familie?) „Ca. Hugbacteria“ – früher Phylum „Ca. Hugiibacteriota“ corrig. Danczak et al. 2017 [„Ca. Hugbacteria“ Danczak et al. 2017]^(L°)
  - Gattung incertae sedis
    - Spezies „Ca. Hugbacteria Y2_MetaBAT.48“
    - Spezies „Ca. Hugbacteria Y4_MetaBAT.14“
- Familie „Ca. Kaiserbacteraceae“^(G°) [f__UBA2103^(G)] – früher Phylum „Ca. Kaiseribacteriota“ corrig. Brown et al. 2015 [„Ca. Kaiserbacteria“ Brown et al. 2015]^(L°,N)
  - Gattung „Ca. Minusculum“ Jonas et al. 2025^(N) [„Ca. Togastosa“ Pallen et al. 2022^(N), UBA2103^(G)] – verschoben, mit
    - Spezies Ca. Minusculum obligatum^(N) [UBA2103 sp002331145^(G), Patescibacteria group bacterium UBA2103^(G)]
    - Spezies UBA2103 sp002400985^(G) [Ca. Wolfebacteria bacterium isolate NORP156^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung 1-14-0-10-45-20^(G)
    - Spezies 1-14-0-10-45-20 sp002773335^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_45_20^(N,G)]
  - Gattung C7867-001^(G)
    - Spezies C7867-001 sp001781915^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium RIFOXYD1_FULL_47_14^(N,G)]
    - Spezies C7867-001 sp001783465^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_02_FULL_54_13^(N,G)]
    - Spezies C7867-001 sp002773355^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_56_12^(N,G)]
    - Spezies C7867-001 sp943355045^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate LH-02apr19-231^(N,G)] (verschoben), C7867-001 sp001189075^(G) [Parcubacteria bacterium C7867-004^(N,G)], C7867-001 sp001189195^(G) [Parcubacteria bacterium C7867-007^(N,G)]
- Familie „Ca. Lloydbacteraceae“ [f__UBA6899^(G)] – früher Phylum „Ca. Lloydiibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Lloydbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
  - Gattung DATIBL01^(G)
    - Spezies DATIBL01 sp035457505^(G) [Minisyncoccota bacterium isolate SMAG_U16289^(N,G)]
  - Gattung JAJZQJ01^(G)
    - Spezies JAJZQJ01 sp021851895^(G) [Ca. Lloydbacteria bacterium isolate clean809^(N,G)]
    - Spezies JAJZQJ01 sp035583355^(G) [Minisyncoccota bacterium isolate SMAG_U8478^(N,G)]
  - Gattung MHLP01
    - Spezies MHLP01 sp001819095^(G) [Ca. Lloydbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_02_FULL_54_12^(N,G)]
    - Spezies MHLP01 sp001821395^(G) [Ca. Lloydbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_02_FULL_50_18^(N,G)]
    - Spezies MHLP01 sp001821435^(G) [Ca. Lloydbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_50_20^(N,G)]
    - Spezies MHLP01 sp001821435^(G) [Ca. Lloydbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_02_FULL_50_11^(N,G)]
    - Spezies MHLP01 sp001821395^(G) [Ca. Lloydbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_01_FULL_49_22^(N,G)]
    - Spezies MHLP01 sp001819095^(G) [Ca. Lloydbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_01_FULL_54_11^(N,G)]
  - Gattung UBA6899^(G)
    - Spezies UBA6899 sp002451235^(G) [Patescibacteria group bacterium UBA6899^(N,G)]
- Familie „Ca. Nomurabacteraceae“^(G°) [f__UBA9973^(G)] – früher Phylum „Ca. Nomuraibacteriota“ corrig. Brown et al. 2015 [„Ca. Nomurabacteria“ Brown et al. 2015]^(L°,N)
  - Gattung CALRHK01^(G)
    - Spezies CALRHK01 sp943359475^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate Ike-200m-38^(N,G)]
  - Gattung GCA-2401345^(G)
    - Spezies GCA-2401345 sp002401345^(G) [Ca. Wolfebacteria bacterium isolate NORP133^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung UBA4124^(G)
    - Spezies UBA4124 sp002413705^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium UBA5155^(N,G)]
  - Gattung UBA8515^(G)
    - Spezies UBA8515 sp000505065^(G) [Parcubacteria bacterium RAAC4_OD1_1^(N,G)]
  - Gattung UBA9973^(G)
    - Spezies UBA9973 sp000999465^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium GW2011_GWB1_43_19^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie „Ca. Phycocordibacteraceae“ Jonas et al. 2025^(L,N) [„Ca. Usinibraceae“ Pallen et al. 2022^(N), f__UBA2163^(N,G)] – abgetrennt von „Campbellbacteraceae“ [f__UBA12079]
  - Gattung „Ca. Phycocordibacter“ Jonas et al. 2025^(L,N) [„Ca. Usinibra“ Pallen et al. 2022^(N), UBA2163^(G)]
    - Spezies UBA2163 sp001774455^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_02_35_12^(N,G)]
    - Spezies UBA2163 sp002327585 [Ca. Phycocordibacter aenigmaticus^(N), Patescibacteria group bacterium UBA2163 ^(G)]
    - Spezies UBA2163 sp016784285^(G) [Parcubacteria group bacterium isolate BS150m-G57^(N,G)]
    - Spezies UBA2163 sp001774455^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_02_35_12^(N,G)] (verschoben)
    - Spezies UBA2163 sp002778715^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_35_52^(N,G)] (verschoben)
- Familie „Ca. Taylorbacteraceae“^(G°) [f__PALSA-1337^(G), RIF16-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Tayloriibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Taylorbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
  - Gattung C7867-002^(G)
    - Spezies C7867-002 sp001189105^(G) [Parcubacteria bacterium C7867-002^(N,G)]
    - Spezies C7867-002 sp943355185^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate TrH-25oct19-38^(N,G)] (verschoben)
    - Spezies C7867-002 sp001821055^(G) [Ca. Taylorbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_12_FULL_45_16^(N,G)]
    - Spezies C7867-002 sp001822575^(G) [Ca. Taylorbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_02_FULL_44_12^(N,G)]
    - Spezies C7867-002 sp003170325^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate fen_1323^(N,G)]
  - Gattung CAIOGI01^(G)
    - Spezies CAIOGI01 sp943349555^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate MaH-04nov19-97^(N,G)] (verschoben)
    - Spezies CAIOGI01 sp903839695^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate KTt_bin-0984^(N,G)]
    - Spezies CAIOGI01 sp903857825^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate Loclat_bin-01970^(N,G)]
  - Gattung JACRJP01^(G)
    - Spezies JACRJP01 sp016215455^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate NC_groundwater_1832_Pr3_B-0.1um_40_24^(N,G)]
  - Gattung JAPLZH01^(G)
    - Spezies JAPLZH01 ^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate LacPavin_0920_WC57_MAG_39_17^(N,G)]
  - Gattung JAQBRD01^(G)
    - Spezies JAQBRD01 sp028286665^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate RYN_390^(N,G)]
  - Gattung PALSA-1337^(G)
    - Spezies PALSA-1337 sp003151615^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate palsa_1337^(N,G)]
  - Gattung SCTV01^(G)
    - Spezies SCTV01 sp943350765^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate CH-Oct18-75^(N,G)}
  - Gattung …^(G)
- Familie „Ca. Vogelbacteraceae“^(G°) [f__XYD1-FULL-46-19^(G), RIF14-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Vogeliibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Vogelbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
  - Gattung XYB1-FULL-42-16^(G)
    - Spezies XYB1-FULL-42-16 sp001823055^(G) [Ca. Vogelbacteria bacterium RIFOXYB1_FULL_42_16^(N,G)]
  - Gattung XYD1-FULL-44-32^(G)
    - Spezies XYD1-FULL-44-32 sp001823065^(G) [Ca. Vogelbacteria bacterium RIFOXYD1_FULL_44_32^(N,G)]
  - Gattung XYD1-FULL-46-19^(G)
    - Spezies XYD1-FULL-46-19 sp001824825^(G) [Ca. Vogelbacteria bacterium RIFOXYD1_FULL_46_19^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie „Ca. Yonathbacteraceae“^(G°) [f__UBA1539^(G), RIF44-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Yonathiibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Yonathbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
  - Gattung BTQM01^(G)
  - Gattung UBA1539^(G)
    - Spezies UBA1539 sp002788135^(G) [Ca. Yonathbacteria bacterium CG_4_8_14_3_um_filter_46_25^(N,G)]
- Familie „Ca. Zambryskibacteraceae“^(G) [RIF15-Grupe] – früher Phylum „Ca. Zambryskiibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Zambryskibacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
  - Gattung 12-FULL-43-12b
    - Spezies 12-FULL-43-12b sp001823875^(G) [Ca. Zambryskibacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_12_FULL_43_12b^(N,G)]
  - Gattung JAIFWN01
    - Spezies JAIFWN01 sp001189165^(G) [Ca. Parcubacteria bacterium C7867-005^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__01-FULL-45-15b^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung 01-FULL-45-15b^(G)
    - Spezies 01-FULL-45-15b sp001822655^(G) [Ca. Taylorbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_45_15b^(N,G)]
- Familie f__1-14-0-10-42-12^(G) – abgetrennt von „Ca. Zambryskibacteraceae“
  - Gattung 1-14-0-10-42-12^(G)
    - Spezies 1-14-0-10-42-12 sp002787695^(G) [Ca. Zambryskibacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_42_12^(N,G)]
- Familie f__2-01-FULL-51-21^(G) – abgetrennt von „Ca. Kaiserbacteraceae“ [f__UBA2103]
  - Gattung 2-01-FULL-51-21^(G)
    - Spezies 2-01-FULL-51-21 sp001781435^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_51_21^(N,G)]
- Familie f__2-02-FULL-43-11^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung 2-02-FULL-43-11^(G)
    - Spezies 2-02-FULL-43-11 sp001820955^(G) [Ca. Taylorbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_02_FULL_43_32b^(N,G)]
- Familie f__2-02-FULL-48-16^(G) – abgetrennt von „Ca. Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung 2-02-FULL-48-16^(G)
    - Spezies 2-02-FULL-48-16 sp001821135^(G) [Ca. Taylorbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_48_100^(N,G)]
- Familie f__21-14-all-36-13^(G) – abgetrennt von „Ca. Campbellbacteraceae“ [f__UBA12079]
  - Gattung 21-14-all-36-13^(G)
    - Spezies 21-14-all-36-13 sp002771585^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium CG22_combo_CG10-13_8_21_14_all_36_13^(N,G)]
- Familie f__21-14-all-47-15^(G) – abgetrennt von „Ca. Lloydbacteraceae“ [f__UBA6899]
  - Gattung 21-14-all-47-15^(G)
    - Spezies 21-14-all-47-15 sp002771515^(G) [Ca. Lloydbacteria bacterium CG22_combo_CG10-13_8_21_14_all_47_15^(N,G)]
  - Gattung JACROH01^(G)
    - Spezies JACROH01 sp016214545^(G) [Ca. Lloydbacteria bacterium isolate NC_groundwater_1956_Pr3_S-0.2um_47_5^(N,G)]
- Familie f__CAIJYI01^(G) – abgetrennt von „Ca. Nomurabacteraceae“ [f__UBA9973]
  - Gattung CAIJYI01^(G)
    - Spezies CAIJYI01 sp943356445^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate Ike-200m-9^(N,G)]
- Familie f__CALRBL01^(G) – abgetrennt von „Ca. Nomurabacteraceae“ [f__UBA9973]
  - Gattung CALRBL01^(G)
    - Spezies CALRBL01 sp943354075^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate MsH-01oct19-81^(N,G)]
- Familie f__CSBR16-119^(G) – abgetrennt von „Ca. Nomurabacteraceae“ [f__UBA9973]
  - Gattung CSBR16-119^(G)
    - Spezies CSBR16-119 sp007117675^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate CSBr16_119^(N,G)]
- Familie f__CSBR16-193^(G) – abgetrennt von „Campbellbacteraceae“ [f__UBA12079]
  - Gattung CSBR16-193^(G)
    - Spezies CSBR16-193 sp007117035^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium isolate CSBr16_193^(N,G)]
  - Gattung BBDHZ01^(G)
  - Gattung SKVL01^(G)
    - Spezies SKVL01 sp007129455^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium isolate CSSed162cmB_160^(N,G)]
- Familie f__CAIRYW01^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung JAQBQZ01^(G)
    - Spezies JAQBQZ01 sp028286725^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate RYN_386^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung JARIGV01^(G)
    - Spezies JARIGV01 sp029288615^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate CullarsAll.DT.08^(N,G)] (verschoben)
- Familie f__CALRHW01^(G)
  - - Spezies SICJ01 sp009691505^(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate Baikal-deep-G202^(N,G)]
- Familie f__DATDWN01^(G) – abgetrennt von „Ca. Zambryskibacteraceae“
  - Gattung C7867-006^(G)
    - Spezies C7867-006 sp001189155^(G) [Parcubacteria bacterium C7867-006^(N,G)]
    - Spezies C7867-006 sp001825395^(G) [Ca. Zambryskibacteria bacterium RIFCSPLOWO2_02_FULL_39_26^(N,G)]
    - Spezies C7867-006 sp001824295^(G) [Ca. Zambryskibacteria bacterium RIFOXYD1_FULL_40_13^(N,G)]
    - Spezies C7867-006 sp003173855^(G) [Ca. Zambryskiibacteriota bacterium isolate Amazon_FNV_2010_10_3_1^(N,G)] etc.
  - Gattung UBA910^(G)
    - Spezies UBA910 sp026394775^(G) [Ca. Zambryskiibacteriota bacterium isolate LacPavin_0818_WC40_MAG_41_17^(N,G)]
- Familie f__DATGWK01^(G) – abgetrennt von „Ca. Zambryskibacteraceae“
  - Gattung JAHFLV01^(G)
    - Spezies JAHFLV01 sp023264565^(G) [Ca. Zambryskiibacteriota bacterium isolate nzgw441^(N,G)]
- Familie f__DSPV01^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung 01-FULL-45-34b^(G)
    - Spezies 01-FULL-45-34b sp001822675^(G) [Ca. Taylorbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_45_34b^(N,G)]
  - Gattung 2-02-FULL-44-35^(G)
    - Spezies 2-02-FULL-44-35 sp001822695^(G) [Ca. Taylorbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_02_FULL_44_35^(N,G)]
  - Gattung 2-02-FULL-46-13^(G)
    - Spezies 2-02-FULL-46-13 sp001821015^(G) [Ca. Taylorbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_02_FULL_46_13^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__EsbW-18^(G)
  - Gattung EsbW-18^(G)
    - Spezies EsbW-18 sp016699465^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium isolate EsbW_18-Q3-R4-48_MAXAC.283_fly_man^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung JAKEFG01^(G)
    - Spezies JAKEFG01 sp022616195^(G) [Ca. Wolfebacteria bacterium isolate PMV_2.61^(N,G)] (verschoben)
- Familie f__GCA-002724975^(G) – abgetrennt von „Campbellbacteraceae“ [f__UBA12079]
  - Gattung GCA-002724975^(G)
    - Spezies GCA-002724975 sp002771565^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium CG22_combo_CG10-13_8_21_14_all_43_18^(N,G)]
- Familie f__GCA-2401445^(G) – abgetrennt von „Wolfebacteraceae“ [f__UBA9933]
  - Gattung GCA-2401445^(G)
    - Spezies GCA-2401445 sp002401445^(G) [Ca. Wolfebacteria bacterium isolate NORP124^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung …^(G)
- Familie f__GCA-2747955^(G) – abgetrennt von „Campbellbacteraceae“ [f__UBA12079]
  - Gattung GCA-2747955^(G)
    - Spezies GCA-2747955 sp002747955^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium isolate DOLZORAL124_30_42^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__GWA1-40-21^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung Bog-1340^(G)
    - Spezies Bog-1340 sp026395155^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate LacPavin_0818_WC55_MAG_33_6^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__H02-43-120^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung HO2-43-120^(G)
    - Spezies HO2-43-120 sp001821295^(G) [Ca. Taylorbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_43_20^(N,G)]
- Familie f__J119^(G)
  - Gattung J119^(G)
    - Spezies J119 sp003694545^(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate J119^(N,G)]
- Familie f__JAACPR01^(G) – abgetrennt von „Ca. Nomurabacteraceae“ [f__UBA9973]
  - Gattung JAACPR01^(G)
    - Spezies JAACPR01 sp009995365^(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate CG_2015-02_34_13^(N,G)]
  - Gattung JACKFZ01^(G)
    - Spezies JACKFZ01 sp020632215^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate HK-STAS-PATE-18^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__JABAAK01^(G) – abgetrennt von „Ca. Kaiserbacteraceae“ [f__UBA2103]
  - Gattung JABAAK01^(G)
    - Spezies JABAAK01 sp014238395^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate bin48o^(N,G)]
  - Gattung JAPPJI01^(G)
    - Spezies JAPPJI01 sp028820405^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate RHO2_bin_44^(N,G)]
  - Gattung JAPPQH01^(G)
    - Spezies JAPPQH01 sp028817035^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium isolate STY4_bin_11^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung JASGCN01^(G)
- Familie f__JABMNX01^(G) – abgetrennt von „Ca. Kaiserbacteraceae“ [f__UBA2103]
  - Gattung 1-14-0-10-49-17^(G)
    - Spezies 1-14-0-10-49-17 sp002778575^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_49_17^(N,G)]
  - Gattung JABMNX01^(G)
    - Spezies JABMNX01 sp013204405^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate bin.102^(N,G)]
- Familie f__JACOZD01^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung JACOZD01^(G)
    - Spezies JACOZD01 sp016181525^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate NC_groundwater_196_Ag_S-0.1um_53_10^(N,G)]
- Familie f__JACOZG01^(G)
  - Gattung JACOZG01^(G)
    - Spezies JACOZG01 sp016181465^(G) [Ca. Vogelbacteria bacterium isolate NC_groundwater_199_Ag_S-0.1um_51_14^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung JADLCI01^(G)
    - Spezies JADLCI01 sp020847275^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate SJ22^(N,G)] (verschoben)
    - Gattunbg JAGVGK01^(G)
    - Spezies JAGVGK01 sp020057185^(G) [Minisyncoccota bacterium isolate DeMMO2_19^(N), Ca. Paceibacterota bacterium isolate DeMMO2_19^(G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__JACNGX01^(G) – abgetrennt von „Ca. Yonathbacteraceae“ [f__UBA1539]
  - Gattung JACNGX01^(G)
    - Spezies JACNGX01 sp013334825^(G) [Ca. Yonathbacteria bacterium isolate W9_Combined_metabat2_032^(N,G)]
- Familie f__JACRKE01^(G) – abgetrennt von „Vogelbacteraceae“ [f__XYD1-FULL-46-19]
  - Gattung 1-14-0-10-51-16^(G)
    - Spezies 1-14-0-10-51-16 sp002774795^(G) [Ca. Vogelbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_51_16^(N,G)]
  - Gattung JACRKE01^(G)
    - Spezies JACRKE01 sp016215335^(G) [Ca. Vogelbacteria bacterium isolate NC_groundwater_1847_Pr3_B-0.1um_44_19^(N,G)]
  - Gattung JBAZWG01^(G)
- Familie f__JAKAEA01^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung JARIGY01^(G)
    - Spezies JARIGY01 sp029288535^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate CullarsAll.DT.32^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__JARIHA01^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung JARIHA01^(G)
    - Spezies JARIHA01 sp029288475^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate CullarsAll.DT.40^(N,G)]
- Familie f__JAXHMZ01^(G) – abgetrennt von „Campbellbacteraceae“ [f__UBA12079]
  - Gattung JAXHMZ01^(G)
    - Spezies JAXHMZ01 sp034521025^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium isolate Salar_de_Ascotan_soil_MAG_ASO70^(N,G)]
- Familie f__SIBU01^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung SIBU01^(G)
    - Spezies SIBU01 sp009695005^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate Baikal-deep-G18^(N,G)]
- Familie f__UBA10002^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung UBA10002^(G)
    - Spezies UBA10002 sp943354745^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate MaH-04nov19-108^(N,G)] (verschoben)
    - Spezies UBA10002 sp001821155^(G) [Ca. Taylorbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_50_130^(N,G)]
    - Spezies UBA10002 sp001820935^(G) [Ca. Taylorbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_01_FULL_51_15^(N,G)]
- Familie f__UBA1006^(G) – abgetrennt von „Ca. Nomurabacteraceae“ [f__UBA9973]
  - Gattung 01-FULL-36-10b^(G)
    - Spezies 01-FULL-36-10b sp001785725^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_36_10b^(N,G)]
  - Gattung JACKGA01^(G)
    - Spezies JACKGA01 sp020632195^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate HK-STAS-PATE-19^(N,G)]
  - Gattung UBA1006^(G)
    - Spezies UBA1006 sp002698305^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium isolate NAT484^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung …^(G)
- Familie f__UBA11359^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung UBA11359^(G)
    - Spezies UBA11359 sp003455555^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate UBA11359^(N,G)]
- Familie f__UBA12445^(G) – abgetrennt von „Vogelbacteraceae“ [f__XYD1-FULL-46-19]
  - Gattung JACQCV01^(G)
    - Spezies JACQCV01 sp016201465^(G) [Ca. Vogelbacteria bacterium isolate NC_groundwater_977_Pr1_S-0.2um_41_15^(N,G)]
  - Gattung JACRKD01^(G)
    - Spezies JACRKD01 sp016215345^(G) [Ca. Vogelbacteria bacterium isolate NC_groundwater_1846_Pr3_B-0.1um_43_16^(N,G)]
  - Gattung JBAZWX01^(G)
  - Gattung UBA12445^(G)
- Familie f__UBA1539_B^(G) – abgetrennt von „Ca. Yonathbacteraceae“ [f__UBA1539]
  - Gattung 2-01-FULL-51-10^(G)
    - Spezies 2-01-FULL-51-10 sp001823605^(G) [Ca. Yonathbacteria bacterium RIFOXYD1_FULL_52_36^(N,G)]
    - Spezies 2-01-FULL-51-10 sp001823505^(G) [Ca. Yonathbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_01_FULL_51_10^(N,G)]
- Familie f__UBA1550^(G) – abgetrennt von „Ca. Yonathbacteraceae“ [f__UBA1539]
  - Gattung UBA1550^(G)
    - Spezies UBA1550 sp000998425^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium GW2011_GWC2_42_20^(N,G)], UBA1550 sp001823535^(G) [Ca. Yonathbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_02_FULL_44_14^(N,G)], UBA1550 sp001825115^(G) [Ca. Yonathbacteria bacterium RIFOXYC2_FULL_47_9^(N,G)], UBA1550 sp001823575^(G) [Ca. O2_01_FULL_47_33b^(N,G)] etc.
- Familie f__UBA12088^(G) – abgetrennt von „Ca. Kaiserbacteraceae“ [f__UBA2103]
  - Gattung CSSED11-315^(G)
    - Spezies CSSED11-315 sp003561715^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate CSSed11_315^(N,G)]
  - Gattung UBA12088^(G)
    - Spezies UBA12088 sp007116405^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate CSBr16_63^(N,G)]
- Familie f__UBA2100^(G) – abgetrennt von „Ca. Kaiserbacteraceae“ [f__UBA2103]
  - Gattung CALRFE01^(G)
    - Spezies CALRFE01 sp943356425^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate Ike-100m-32^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung JACQKA01^(G)
    - Spezies JACQKA01 sp016204805^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate NC_groundwater_1165_Ag_S-0.1um_52_75^(N,G)]
  - Gattung S139-169^(G)
    - Spezies S139-169 sp027066795^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate 4281-140_metabat1_scaf2bin.078^(N,G)]
  - Gattung S143-145^(G)
    - Spezies S143-145 sp026985835^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate 356-284_metabat2_scaf2bin.085^(N,G)]
  - Gattung UBA10103^(G)
    - Spezies UBA10103 sp001004345^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium GW2011_GWA2_52_12^(N,G)]
    - Spezies UBA10103 sp003599175^(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate SURF_53^(N,G)]
  - Gattung UBA2100^(G)
    - Spezies UBA2100 sp002401925^(G) [Ca. Kaiserbacteria bacterium isolate NORP88^(N,G)]
- Familie f__UBA5272^(G)
  - Gattung UBA11704
    - Spezies UBA11704 sp003518045^(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate UBA11704^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung UBA5272
    - Spezies UBA5272 sp034927475^(G) [Ca. Elulimicrobiales bacterium isolate CA_14^(N,G)]
- Familie f__UBA6065^(G) – abgetrennt von „Taylorbacteraceae“ [f__PALSA-1337]
  - Gattung UBA6065
    - Spezies UBA6065 sp016215405^(G) [Ca. Tayloriibacteriota bacterium isolate NC_groundwater_1833_Pr3_B-0.1um_56_22^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__UBA9988^(G) – abgetrennt von „Vogelbacteraceae“ [f__XYD1-FULL-46-19]
  - Gattung UBA9988^(G)
    - Spezies UBA9988 sp001823095^(G) [Ca. Vogelbacteria bacterium RIFOXYD1_FULL_51_18^(N,G)]
- Familie f__W02-35-19^(G) – abgetrennt von „Ca. Zambryskibacteraceae“
  - Gattung WO2-35-19^(G)
    - Spezies WO2-35-19 sp001824275^(G) [Ca. Zambryskibacteria bacterium RIFOXYC1_FULL_39_10^(N,G)]
    - Spezies WO2-35-19 sp001825335^(G) [Ca. Zambryskibacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_35_19^(N,G)]
    - Spezies WO2-35-19 sp001824215^(G) [Ca. Zambryskibacteria bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_39_16^(N,G)]
    - Spezies WO2-35-19 sp001823925^(G) [Ca. Zambryskibacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_39_39^(N,G)]
- Familie …^(G)

Ordnung „Ca. Portnoybacterales“ Chuvochina et al. 2023^(L°,G) [RIF22-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Portnoyibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Portnoybacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
- Familie f__CG1-02-40-25^(G)
  - Gattung CG1-02-40-25^(G)
- Familie …^(G)

Ordnung „Ca. Ryanbacterales“ Chuvochina et al. 2023^(L°,G) [RIF10-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Ryaniibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Ryanbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
- Familie f__2-02-FULL-48-12^(G)
  - Gattung 2-02-FULL-48-12^(G)
  - Gattung …^(G)
- Familie …^(G)

Ordnung „Ca. Spechtbacterales“ Chuvochina et al. 2023^(L°,G) – früher Phylum „Ca. Spechtiibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Spechtbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
- Familie f__2-12-FULL-38-22^(G)
- Familie f__H02-43-30^(G)
- Familie f__JACPHP01^(G)

Ordnung „Ca. Sungbacterales“ Chuvochina et al. 2023^(L°,G) [RIF17-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Sungiibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Sungbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
- Familie f__GWA2-42-14^(G)
  - Gattung GWA2-42-14^(G)
- Familie f__H02-52-23^(G)
- Familie f__JACQCQ01^(G)
- Familie f__JBBTQR01^(G)
- Familie f__SURF-37^(G)
  - - Spezies SURF-37 sp003599755^(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate SURF_37^(N,G)]

Ordnung „Ca. Tagabacterales“^(G°) [o__JAHISW01^(G), RIF12-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Tagaibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Tagabacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N), monotypisch
- Familie Tagabacteraceae^(G)
  - Gattung GCA-002793575^(G)
    - Spezies GCA-002793575 sp002774055^(G) [Ca. Tagabacteria bacterium CG09_land_8_20_14_0_10_41_14^(N,G)]
  - Gattung JAHISW01^(G)
  - Gattung JAHJQY01^(G)
  - Gattung JAQTSC01^(G)

Ordnung „Ca. Terrybacterales“ Chuvochina et al. 2023^(L°,G) – früher Phylum „Ca. Terryibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Terrybacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
- Familie f__2-01-FULL-58-14^(G)
  - Gattung 2-01-FULL-48-14^(G)
  - Gattung 2-01-FULL-58-14 ^(G)
- Familie f__GWB1-40-14^(G)
  - Gattung GWB1-40-14^(G)

Ordnung „Ca. Yanofskybacterales“^(G°) [o__2-02-FULL-40-12^(G)] – früher Phylum „Ca. Yanofskyibacteriota“ corrig. Brown et al. 2015 [„Ca. Yanofskybacteria“ Brown et al. 2015]^(L°,N) – in der GTDB abgetrennt von Ordnung Minisyncoccales, in der aber die Familie „Ca. Yanofskyibacteriaceae“ [f__UBA5738] verbleibt
- Familie f__2-02-FULL-40-12^(G)
  - Gattung 2-02-FULL-40-12^(G)
    - Spezies 2-02-FULL-40-12 sp001824375^(G) [Parcubacteria group bacterium RIFCSPHIGHO2_02_FULL_40_12^(N,G)]
    - Spezies 2-02-FULL-40-12 sp007376425^(G) [Parcubacteria group bacterium Gr01-1014_2^(N,G)]
  - Gattung JACPLU01^(G)
    - Spezies JACPLU01 sp016186395^(G) [Parcubacteria group bacterium isolate NC_groundwater_529_Ag_S-0.1um_38_18^(N,G)]
  - Gattung JBBTQD01^(G)
    - Spezies JBBTQD01 sp038062015^(G) [Patescibacteria group bacterium isolate H51-bin030_1^(N,G)]
    - Spezies JBBTQD01 sp038065855^(G) [Patescibacteria group bacterium isolate H51-bin021_1^(N,G)]
  - Gattung JBBTUA01^(G)
    - Spezies JBBTUA01 sp038063995^(G) [Patescibacteria group bacterium isolate H51-bin010_1^(N,G)]
- Familie f__GWA2-44-9^(G)
  - Gattung GWA2-44-9^(G)
    - Spezies GWA2-44-9 sp001794215^(G) [Ca. Yanofskybacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_01_FULL_44_24^(N,G)]
- Familie f__IGHO2-01-FULL-4-A^(G)
  - Gattung 1-14-0-10-36-16^(G)
    - Spezies 1-14-0-10-36-16 sp002794035^(G) [Ca. Yanofskybacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_36_16^(N,G)]
  - Gattung 2-01-FULL-44-17^(G)
    - Spezies 2-01-FULL-44-17 sp016181175 [Ca. Yanofskyibacteriota bacterium isolate NC_groundwater_220_Ag_S-0.1um_46_18^(N,G)]
  - Gattung CAIUCV01^(G)
    - Spezies CAIUCV01 sp903897805^(G) [Ca. Yanofskyibacteriota bacterium isolate D14_bin-0819^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__IGHO2-12-FULL-4^(G)
  - Gattung 1-14-0-10-46-23^(G)
    - Spezies 1-14-0-10-46-23 sp002771135^(G) [Ca. Yanofskybacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_46_23^(N,G)]
  - Gattung 12-FULL-45-19b^(G)
    - Spezies 12-FULL-45-19b sp001794605^(G) [Ca. Yanofskybacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_12_FULL_45_19b^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie …

Ordnung o__1-14-0-10-42-19^(G) – abgetrennt von „Niyogibacterales“ [o__H02-45-28]
- Familie f__1-14-0-10-42-19^(G)
  - - Spezies 1-14-0-10-42-19 sp002774705^(G) [Ca. Niyogibacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_42_19^(N,G)]

Ordnung o__2-12-FULL-41-13^(G) – abgetrennt von „Niyogibacterales“ [o__H02-45-28]
- Familie f__2-12-FULL-41-13^(G)
  - Gattung 2-12-FULL-41-13^(G)
    - Spezies 2-12-FULL-41-13 sp001821615^(G) [Ca. Niyogibacteria bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_41_13^(N,G)]

Ordnung o__GCA-002779875^(G) – ausgegliedert aus o__JAHISW01 (Tagabakterien)
- Familie f__GCA-002779875^(G)
  - Gattung GCA-002779875^(G)
    - Spezies GCA-002779875 sp002792165^(G) [Ca. Tagabacteria bacterium CG_4_10_14_0_2_um_filter_40_13^(N,G)]

Ordnung o__GWC2-36-17^(G) – abgetrennt von „Ca. Azambacterales“ [o__UBA10092]
- Familie f__GWC2-36-17^(G)
- Familie f__JACQAJ01^(G)
  - Gattung JACQAJ01^(G)
    - Spezies JACQAJ01 sp016195045^(G) [Ca. Azambacteria bacterium isolate NC_groundwater_913_Pr1_S-0.2um_35_36^(N,G)]
- Familie f__M10-OD1-4^(G)
  - Gattung M10-OD1-4^(G)
    - Spezies M10-OD1-4 sp016200995^(G) [Ca. Azambacteria bacterium isolate NC_groundwater_1001_Pr1_S-0.65um_41_7^(N,G)]
- Familie f__WO2-46-25^(G)
  - Gattung WO2-46-25^(G)
    - Spezies WO2-46-25 sp001775835^(G) [Ca. Azambacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_02_FULL_52_12^(N,G)]
- Familie …^(G)

Ordnung o__JACPKW01^(G) – abgetrennt von „Ca. Giovannonibacterales“ [o__UBA11713]
- Familie f__UBA11713^(G)
  - Gattung UBA11713^(G)
    - Spezies UBA11713 sp001778985^(G) [Ca. Giovannonibacteria bacterium RIFOXYD1_FULL_48_21^(N,G)]
  - Gattung …^(G)

Ordnung o__JACROR01^(G) – abgetrennt von „Niyogibacterales“ [o__H02-45-28]
- Familie f__JACROR01^(G)
  - Gattung JACPL01^(G)
  - Gattung JACPLO01^(G)
    - Spezies JACPLO01 sp016186495^(G) [Ca. Niyogiibacteriota bacterium isolate NC_groundwater_523_Ag_S-0.1um_41_12^(N,G)]

Ordnung o__SURF-38^(G)
- Familie f__SURF-38^(G)
  - Gattung SURF-38^(G)
    - Spezies SURF-38 sp003599335^(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate SURF_38(N,G)]

Ordnung o__UBA6257^(G) [„Parcubacteria 3“]
- Familie „Ca. Brennerbacteraceae“^(G) [RIF18-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Brenneribacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Brennerbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
  - Gattung UBA10122^(G)
    - Spezies UBA10122 sp001817215^(G) [Ca. Brennerbacteria bacterium RIFOXYC1_FULL_41_11^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie „Ca. Colwellbacteraceae“^(G) [RIF41-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Colwelliibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Colwellbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
  - Gattung 2-12-FULL-43-11^(G)
    - Spezies 2-12-FULL-43-11 sp001817805^(G) [Ca. Colwellbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_43_11^(N,G)]
  - Gattung GWA2-46-10^(G)
    - Spezies GWA2-46-10 sp001817635^(G) [Ca. Colwellbacteria bacterium GWA2_46_10^(N,G)]
  - Gattung JAHXGO01^(G)
    - Spezies JAHXGO01 sp019923695^(G) [Ca. Liptonbacteria bacterium isolate Unc5^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung …^(G)
- Familie „Ca. Harrisonbacteraceae“^(G°) [f__WO2-44-18^(G), RIF43-Gruppe] – zum früheren Phylum „Ca. Harrisoniibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Harrisonbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
  - Gattung 2-02-FULL-40-20^(G)
    - Spezies 2-02-FULL-40-20 sp001818675^(G) [Ca. Harrisonbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_02_FULL_40_20^(N,G)]
  - Gattung JACOXP01^(G)
    - Spezies JACOXP01 sp016182295^(G) [Ca. Harrisonbacteria bacterium isolate NC_groundwater_156_Ag_S-0.1um_44_12^(N,G)]
  - Gattung WO2-44-18^(G)
    - Spezies WO2-44-18 sp001817915^(G) [Ca. Harrisonbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_44_18^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie „Ca. Jorgensenbacteraceae“^(G°) [f__GWB1-50-10^(G)] – früher Phylum „Ca. Joergenseniibacteriota“ corrig. Brown et al. 2015 [„Ca. Jorgensenbacteria“ Brown et al. 2015]^(L°,N)
  - Gattung CAIKKG01^(G)
    - Spezies CAIKKG01 sp037444725^(G) [Ca. Jorgensenbacteria bacterium isolate BR1F70218_bin_218^(N,G)]
  - Gattung DRGK01^(G)
    - Spezies DRGK01 sp011050075^(G) [Ca. Jorgensenbacteria bacterium isolate HyVt-344^(N,G)]
  - Gattung DYGI01^(G)
    - Spezies DYGI01 sp020724805^(G) [Ca. Microgenomatus sp. BE2012_3_53_27^(N,G)] (verschoben)
    - Spezies DYGI01 sp016183535^(G) [Ca. Brennerbacteria bacterium isolate NC_groundwater_333_Ag_B-0.1um_54_13^(N,G)] (Verschoben)
  - Gattung GWB1-50-10^(G)
    - Spezies GWB1-50-10 sp001004105^(G) [Ca. Jorgensenbacteria bacterium GW2011_GWB1_50_10^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie „Ca. Liptonbacteraceae“^(G°) [f__2-01-FULL-56-20^(G), RIF42-Gruppe] – zum früheren Phylum „Ca. Liptoniibacteriota“ corrig. Anantharaman et al. 2016 [„Ca. Liptonbacteria“ Anantharaman et al. 2016]^(L°,N)
  - Gattung 2-01-FULL-56-20^(G)
    - Spezies 2-01-FULL-56-20 sp001818655^(G) [Ca. Liptonbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_56_20^(N,G)]
  - Gattung MHLB01^(G)
    - Spezies MHLB01 sp001818895^(G) [Ca. Liptonbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_53_13^(N,G)]
  - Gattung SURF-56^(G)
    - Spezies SURF-56 sp003599135^(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate SURF_56^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie „Ca. Wolfebacteraceae“ ^(G°) [f__UBA9933^(G)] – früher Phylum „Ca. Wolfeibacteriota“ corrig. Brown et al. 2015 [„Ca. Wolfebacteria“ Brown et al. 2015]^(L°,N)
  - Gattung JAFGBB01^(G)
    - Spezies JAFGBB01 sp016933365^(G) [Ca. Wolfebacteria bacterium isolate Zod_Metabat.1002^(N,G)]
  - Gattung JANLIR01^(G)
    - Spezies JANLIR01 sp024654025^(G) [Ca. Wolfebacteria bacterium isolate S40-20^(N,G)]
  - Gattung JAPLZW01^(G)
    - Spezies JAPLZW01 sp026394835^(G) [Ca. Wolfebacteria bacterium isolate LacPavin_0920_WC70_MAG_44_7^(N,G)]
  - Gattung UBA9933^(G)
    - Spezies UBA9933 sp001000675^(G) [Ca. Wolfebacteria bacterium GW2011_GWE2_44_13^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__1-14-0-10-40-38^(G) – abgetrennt von „Harrisonbacteraceae“ [f__WO2-44-18]
  - Gattung 1-14-0-10-40-38^(G)
    - Spezies 1-14-0-10-40-38 sp002773535^(G) [Ca. Harrisonbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_40_38^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__1-14-0-10-44-23^(G) – abgetrennt von „Harrisonbacteraceae“ [f__WO2-44-18]
  - Gattung 1-14-0-10-44-23^(G)
    - Spezies 1-14-0-10-44-23 sp002773475^(G) [Ca. Harrisonbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_44_23^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__02-FULL-45-10c^(G) – abgetrennt von „Harrisonbacteraceae“ [f__WO2-44-18]
  - Gattung 02-FULL-45-10c^(G)
    - Spezies 02-FULL-45-10c sp001818705^(G) [Ca. Harrisonbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_02_FULL_45_10c^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__GWB1-45-9^(G) – abgetrennt von „Wolfebacteraceae“ [f__UBA9933]
  - Gattung GWB1-45-9^(G)
    - Spezies GWB1-45-9 sp001793855^(G) [Ca. Wolfebacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_45_19^(N,G)]
- Familie f__HR35^(G)
  - Gattung JAGDVT01^(G)
    - Spezies JAGDVT01 sp023255765^(G) [Ca. Paceibacter sp. isolate KUB_Bin06^(N,G)] (verschoben)
- Familie f__JACOXY01^(G) – abgetrennt von „Liptonbacteraceae“ [f__2-01-FULL-56-20]
  - Gattung JACOXY01^(G)
    - Spezies JACOXY01 sp016182095^(G) [Ca. Liptonbacteria bacterium isolate NC_groundwater_165_Ag_S-0.1um_43_15^(N,G)]
- Familie f__JAGOQP01^(G) – abgetrennt von „Wolfebacteraceae“ [f__UBA9933]
  - Gattung DAIEKJ01^(G)
    - Spezies DAIEKJ01 sp027350645^(G) [Ca. Wolfebacteria bacterium isolate clean1070^(N,G)]
  - Gattung GWA1-42-9^(G)
    - Spezies GWA1-42-9 sp001793775^(G) [Ca. Wolfebacteria bacterium GWA1_42_9^(N,G)]
  - Gattung JAGOQP01^(G)
  - Gattung WO2-47-17b^(G)
    - Spezies WO2-47-17b sp001793865^(G) [Ca. Wolfebacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_47_17b^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__MFKM01^(G)
  - Gattung JACPKE01^(G)
    - Spezies JACPKE01 sp016187205^(G) [Ca. Brennerbacteria bacterium isolate NC_groundwater_486_Ag_S-0.1um_40_11^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung MFKM01^(G)
    - Spezies MFKM01 sp001779575^(G) [Ca. Jorgensenbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_42_11^(N,G)] (verschoben)
- Familie f__UBA11618^(G) – abgetrennt von „Harrisonbacteraceae“ [f__WO2-44-18]
  - Gattung UBA11618^(G)
  - Gattung VGJO01^(G)
    - Spezies VGJO01 sp016867415^(G) [Ca. Harrisonbacteria bacterium isolate K_Offshore_120m_m1_041^(N,G)]
  - Gattung …^(G)
- Familie f__XYB1-36-10^(G) – abgetrennt von „Liptonbacteraceae“ [f__2-01-FULL-56-20]
  - Gattung 1-14-0-20-35-14^(G)
    - Spezies 1-14-0-20-35-14 sp002796205^(G) [Ca. Liptonbacteria bacterium CG11_big_fil_rev_8_21_14_0_20_35_14^(N,G)]
  - Gattung JAQVXM01^(G)
  - Gattung XYB1-36-10^(G)
    - Spezies XYB1-36-10 sp001821375^(G) [Ca. Liptonbacteria bacterium RIFOXYD1_FULL_36_11^(N,G)]
- Familie f__XYD1-FULL-40-9^(G) – abgetrennt von „Harrisonbacteraceae“ [f__WO2-44-18]
  - Gattung XYD1-FULL-40-9^(G)
    - Spezies XYD1-FULL-40-9 sp001818015^(G) [Ca. Harrisonbacteria bacterium RIFOXYD1_FULL_40_9^(N,G)]

Ordnung o__UBA9936^(G) – abgetrennt von „Azambacterales“ [o__UBA10092]
- Familie f__UBA9936^(G)
  - Gattung UBA9936^(G)
    - Spezies UBA9936 sp001774105^(G) [Ca. Azambacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_46_26^(N,G)]

Ordnung o__UBA9983^(G)
- Familie f__UBA9983^(G)
  - Gattung JACQXW01^(G)
    - Spezies JACQXW01 sp016208535^(G) [Ca. Terryibacteriota bacterium isolate NC_groundwater_1525_Pr4_S-0.2um_41_30^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung SURF-57^(G)
    - Spezies SURF-57 sp003599625^(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate SURF_57^(N,G)]
  - Gattung SZUA-82^(G)
    - Spezies SZUA-82 sp003231675^(G) [Ca. Campbellbacteria bacterium isolate SZUA-8^(N,G)] (verschoben)
  - Gattung …^(G)

Ordnung …^(G)
Ordnung und Familie incertae sedis^(L)
- Gattung „Ca. Sonnebornia“ Gong et al. 2014^(L,N)
  - Spezies „Ca. Sonnebornia yantaiensis“^(L,N), Stämme YTParaBac1^(N), YTParaBac2^(N), YTParaBac3^(L,N), YTParaBac4^(N)

Klasse „Ca. Parcunitrobacteria“ Castelle et al. 2017^(L,N) [GWA2-38-13b-Gruppe] – früher Phylum „Ca. Parcunitrobacterota“ corrig. Castelle et al. 2017^(L,N) – in der GTDB synonym mit Minisyncoccia

Ordnung „Ca. Parcunitrobacterales“ Castelle et al. 2017 (L,N,G°) [o__GWA2-38-13b^(G)] – in der GTDB zur Klasse Minisyncoccia
- - Familie „Ca. Parcunitrobacteraceae“ Castelle et al. 2017^(L,N) [f__GWA2-38-13b^(G)]
  - Gattung „Ca. Parcunitrobacter“ Castelle et al. 2017^(L,N) [GWA2-38-13b^(G)]
    - Spezies „Ca. Parcunitrobacter nitrogeniphilus“ corrig. Castelle et al. 2017^(L,N) [„Ca. Parcunitrobacter nitroensis“ Castelle et al. 2017^(L), GWA2-38-13b sp000992445^(G) [Parcubacteria group bacterium GW2011_GWA2_38_13b^(N,G)]
    - Spezies GWA2-38-13b sp038065195^(G) [Patescibacteria group bacterium isolate H52-bin103_1^(N,G)]

L – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ),
L° – verwaister LPSN-Eintrag (Taxon ohne ausgewiesene innere und äußere Systematik, aber ggf. Synonyme),
N – Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI),
G – Genome Taxonomy Database (GTDB),
G° – GTDB (veralteter) Release 09-RS220

Etymologie

Die Bezeichnung ‚Minisyncoccia‘ der Klasse ist (ebenso wie die der Ordnung ‚Minisyncoccales‘ und Familie ‚Minisyncoccaceae‘) neulateinisch und verweist auf die Typusgattung Minisyncoccus. Deren Name setzt sich zusammen aus dem lat. Adjektiv minor ‚kleiner‘, der altgriechischen Präposition σύν sýn, deutsch ‚zusammen‘ und dem Substantiv κόκκος kókos, deutsch ‚Korn‘; Minisyncoccus bezeichnet körnchenförmige kleine Organismen, die zusammen mit anderen Organismen in Symbiose leben.

Anmerkungen

1 2 „Plug“: sog. Plug-Struktur des Archaeons, „Div“: Einschnürung der sich teilenden Bakterienzelle.
↑ Markierung mit DAPI (blau), der ARC915-Sonde (markiert mit Fluorescein-Isothiocyanat alias FITC) für den Archaeenstamm DSM 864ᵀ (grün) und der 32-520-1066-Sonde (markiert mit Cy3) für Minisyncoccaceae (magenta).
1 2 Klassen synonymisiert wg. „Ca. Elulimicrobiales“
↑ gesplittet, da das alte Taxon (Phylum) „Azambacteria“ Brown et al. 2015 offenbar polyphyletisch ist
↑ offensichtlich nicht identisch mit „Pacebacteraceae“^(G°) [f__PJMF01^(G)] („Ca. Microgenomatia“ : „Chazhemtobacteriales“^(G°) [o__UBA1400^(G)])
↑ synonymisiert wg. Stämmen SulCav_GS09_5_3_41_19 und SulCav_PC08_66_47_31
↑ gesplittet, da die „Campbellbacteria“ Brown et al. 2015 offenbar polyphyletisch sind
1 2
In der NCBI-Taxonomie ist
- „Candidatus Phycocordibacterales“ equivalent: o__UBA9973, GTDB
- „Candidatus Phycocordibacteraceae“ equivalent: „Candidatus Usinibraceae“, f__UBA2103, GTDB
- „Candidatus Minusculum“ equivalent: „Candidatus Togastosa“ und g__1-14-0-10-45-20, GTDB
- „Candidatus Minusculum obligatum“ includes: Patescibacteria group bacterium UBA2103
- „Candidatus Phycocordibacter“ equivalent: „Candidatus Usinibra“, g__UBA2103, GTDB
- „Candidatus Phycocordibacter aenigmaticus“ includes Patescibacteria group bacterium UBA2163
In der GTDB enthält die Ordnung o__UBA9973 u. a. die folgenden Familien:
- f__UBA2163, u. a. mit Gattung g__UBA2163, mit UBA2163 sp002327585 [Patescibacteria group bacterium UBA2163]
- f__UBA2103, u. a. mit Gattung g__1-14-0-10-45-20 und g__UBA2103, letztere mit UBA2103 sp002331145 [Patescibacteria group bacterium UBA2103]
Die letztere Familie hat nach der GTDB 25 Stämme, die dort Organismen mit Namen Candidatus Kaiserbacteria zugeordnet werden; die erstere keine. Es wäre daher nach der NCBI-Taxonomie
- Ca. Phycocordibacterales syn. o__UBA9973
- Ca. Phycocordibacteraceae syn. Ca. Usinibraceae und f__UBA2103
- Ca. Minusculum syn. Ca. Togastosa und 1-14-0-10-45-20
- Ca. Minusculum obligatum syn. UBA2103 sp002331145 mit Stamm UBA2103
- Ca. Phycocordibacter syn. Ca. Usinbra und UBA2103
- Ca. Phycocordibacter aenigmaticus syn. UBA2163 sp002327585 mit Stamm UBA2163
Das kann so nicht stimmen. Daher werden hier für die Synonymisierungen die Stämme als maßgeblich betrachtet wie folgt:
- Ca. Phycocordibacter aenigmaticus syn. UBA2163 sp002327585 mit Stamm UBA2163, in:
  - Ca. Phycocordibacter syn. Ca. Usinbra und UBA2163, in:
    - Ca. Phycocordibacteraceae syn. Ca. Usinibraceae und f__UBA2163
- Ca. Minusculum obligatum syn. UBA2103 sp002331145 mit Stamm UBA2103, in:
  - Ca. Minusculum syn. Ca. Togastosa und UBA2103, in:
    - f__UBA2103 syn. „Ca. Kaiserbacteraceae“

Einzelnachweise

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Meri Nakajima, Ryosuke Nakai, Yuga Hirakata, Kengo Kubota, Hisashi Satoh, Masaru K. Nobu, Takashi Narihiro, Kyohei Kuroda: Minisyncoccus archaeiphilus gen. nov., sp. nov., a mesophilic, obligate parasitic bacterium and proposal of Minisyncoccaceae fam. nov., Minisyncoccales ord. nov., Minisyncoccia class. nov. and Minisyncoccota phyl. nov. formerly referred to as Candidatus Patescibacteria or candidate phyla radiation. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 75, Nr. 2, 10. Februar 2025; doi:10.1099/ijsem.0.006668, PMC 12281837 (freier Volltext), PMID 39928396 (englisch).
1 2 3 4 LPSN: Class Minisyncoccia Nakajima et al. 2025.
1 2 3 4 5 NCBI Taxonomy Browser: Minisyncoccia. Details: Minisyncoccia Nakajima et al. 2025; heterotypic synonym "Candidatus Paceibacteria" Chuvochina et al. 2023.
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Kyohei Kuroda, Meri Nakajima, Ryosuke Nakai, Yuga Hirakata, Shuka Kagemasa, Kengo Kubota, Taro Q. P. Noguchi, Kyosuke Yamamoto, Hisashi Satoh, Masaru K. Nobu, Takashi Narihiro: Microscopic and metatranscriptomic analyses revealed unique cross-domain parasitism between phylum Candidatus Patescibacteria/candidate phyla radiation and methanogenic archaea in anaerobic ecosystems. In: mBio, Band 15, Nr. 3, 7. Februar 2024, S. e03102-23 [S. e0310223]; doi:10.1128/mbio.03102-23, PMC 10936435 (freier Volltext), PMID 38323857, Epub 13. März 2024 (englisch).
1 2 3 4 5 6 GTDB: Minisyncoccia (class).
1 2 3 4 Kyohei Kuroda, Kyosuke Yamamoto, Ryosuke Nakai, Yuga Hirakata, Kengo Kubota, Masaru K. Nobu, Takashi Narihiro: Symbiosis between Candidatus Patescibacteria and Archaea Discovered in Wastewater-Treating Bioreactors. In: ASM Journals: mBio, Band 13, Nr. 5, 31. August 2022; doi:10.1128/mbio.01711-22 (englisch).
1 2 3 4 5 6 Kyohei Kuroda, Kengo Kubota, Shuka Kagemasa, Ryosuke Nakai, Yuga Hirakata, Kyosuke Yamamoto, Masaru K. Nobu, Takashi Narihiro: Novel cross-domain symbiosis between Candidatus Patescibacteria and hydrogenotrophic methanogenic archaea Methanospirillum discovered in a methanogenic ecosystem. In: Microbes and Environments, Band 37, Nr. 4, 12. November 2022, S. ME22063; doi:10.1264/jsme2.ME22063, PMC 9763046 (freier Volltext), PMID 36372432 (englisch).
↑ Xu Chen, Olivia Molenda, Christopher T. Brown, Courtney R. A. Toth, Shen Guo, Fei Luo, Jane Howe, Camilla L. Nesbø, Christine He, Elizabeth A. Montabana, Jamie H. D. Cate, Jillian F. Banfield, Elizabeth A. Edwards: "Candidatus Nealsonbacteria" Are Likely Biomass Recycling Ectosymbionts of Methanogenic Archaea in a Stable Benzene-Degrading Enrichment Culture. In: Applied and Environmental Microbiology, Band 89, Nr. 5, 31. Mai 2023, S. e0002523; doi:10.1128/aem.00025-23, PMC 10231131 (freier Volltext), PMID 37098974, Epub 26. April 2023 (englisch).
↑ 4′,6-Diamidin-2-phenylindol-dihydrochlorid. Auf: [Sigma-Aldrich] Merck.
1 2
LPSN: Phylum "Candidatus Parcunitrobacterota" corrig. Castelle et al. 2017. Synonym: Phylum "Candidatus Parcunitrobacteria" Castelle et al. 2017. Child taxa:
- Class "Candidatus Parcunitrobacteria" Castelle et al. 2017-
1 2
Genome Taxonomy Database (GTDB) Release 09-RS220
- About. In: GTDB. Abgerufen am 19. Mai 2024 (englisch).
- bac120_r220.sp_labels Tree File. In: GTDB. Abgerufen am 19. Mai 2024.
- Taxon History. In: GTDB. Abgerufen am 19. Mai 2024 (englisch).
1 2 3 4 5 6 7 8 9 Martina Herrmann, Carl-Eric Wegner, Martin Taubert, Patricia Geesink, Katharina Lehmann, Lijuan Yan, Robert Lehmann, Kai Uwe Totsche, Kirsten Küsel: Predominance of Cand. Patescibacteria in Groundwater Is Caused by Their Preferential Mobilization From Soils and Flourishing Under Oligotrophic Conditions. In: Frontiers in Microbiology, Sec. Terrestrial Microbiology, Band 10, 20. Juni 2019, doi:10.3389/fmicb.2019.01407, PMC 6596338 (freier Volltext), PMID 31281301 (englisch).
1 2 3 Alexander L. Jaffe, Cindy J. Castelle, Paula B. Matheus Carnevali, Simonetta Gribaldo, Jillian F. Banfield: The rise of diversity in metabolic platforms across the Candidate Phyla Radiation. In: BMC Biology. Band 18, Nr. 69, Juni 2020; doi:10.1186/s12915-020-00804-5 (englisch). iehe insbes. Fig. S2.
1 2 3 4 5
Mark John Pallen, Nabil-Fareed Alikhan, Luis M. Rodríguez-R: Naming the unnamed: Over 65,000 Candidatus names for unnamed Archaea and Bacteria in the Genome Taxonomy Database. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 72, Nr. 9, 20. September 2022; doi:10.1099/ijsem.0.005482, PMID 36125864, ResearchGate:363695508 (englisch). Dazu:
- Corrigendum, 12. Mai 2023: doi:10.1099/ijsem.0.005885.
- Version 2.0.0, 27. April 2022; doi:10.5281/zenodo.6477137. Hier: Protologues built from named genera.
- 65 000 Mikroben erhalten neue Namen. Auf: VBiO. Quelle: Universität Innsbruck.
↑ NCBI Taxonomy Browser: Candidatus Elulimicrobiota, Details: "Candidatus Elulimicrobiota" Rodriguez-R et al. 2020 (phylum), "Candidatus Elulimicrobia" Rodriguez-R et al. 2020 (class).
1 2 Robert E. Danczak, Michael D. Johnston, Michael Slattery, Kelly C. Wrighton, Michael J. Wilkins: Members of the candidate phyla radiation are functionally differentiated by carbon- and nitrogen-cycling capabilities. In: Microbiome. 5. Jahrgang, Nr. 1, September 2017, ResearchGate:319450132, S. 112, doi:10.1186/s40168-017-0331-1, PMID 28865481, PMC 5581439 (freier Volltext), bibcode:2017AGUFM.B14D..08D (englisch). . Siehe insbes. Additional file 1 (xlsx).
1 2 Cindy J. Castelle, Christopher T. Brown, Brian C. Thomas, Kenneth H. Williams, Jillian F. Banfield: Unusual respiratory capacity and nitrogen metabolism in a Parcubacterium (OD1) of the Candidate Phyla Radiation. In: Scientific Reports. Band 7, Nr. 40101, 9. Januar 2017; doi:10.1038/srep40101, PMC 5220378 (freier Volltext), PMID 28067254 (englisch).
↑ LPSN: Search taxonomy.
↑ Vitaly V. Kadnikov, Andrey V. Mardanov, Alexey V. Beletsky, Olga V. Karnachuk, Nikolai V. Ravin: Microbial Life in the Deep Subsurface Aquifer Illuminated by Metagenomics. In: Frontiers in Microbiology, Sec. Extreme Microbiology, Band 11, 3. September 2020; doi:10.3389/fmicb.2020.572252 (englisch). Sieha insbes. Supplementary Table S1.

[PlugDiv"-1] 1 2 „Plug“: sog. Plug-Struktur des Archaeons, „Div“: Einschnürung der sich teilenden Bakterienzelle.

[11] Markierung mit DAPI (blau), der ARC915-Sonde (markiert mit Fluorescein-Isothiocyanat alias FITC) für den Archaeenstamm DSM 864ᵀ (grün) und der 32-520-1066-Sonde (markiert mit Cy3) für Minisyncoccaceae (magenta).

[c_Elul-14] 1 2 Klassen synonymisiert wg. „Ca. Elulimicrobiales“

[17] splittet, da das alte Taxon (Phylum) „Azambacteria“ Brown et al. 2015 offenbar polyphyletisch ist

[18] sichtlich nicht identisch mit „Pacebacteraceae“^(G°) [f__PJMF01^(G)] („Ca. Microgenomatia“ : „Chazhemtobacteriales“^(G°) [o__UBA1400^(G)])

[20] synonymisiert wg. Stämmen SulCav_GS09_5_3_41_19 und SulCav_PC08_66_47_31

[21] splittet, da die „Campbellbacteria“ Brown et al. 2015 offenbar polyphyletisch sind

[UBA21_3-24] 1 2 In der NCBI-Taxonomie ist
„Candidatus Phycocordibacterales“ equivalent: o__UBA9973, GTDB

„Candidatus Phycocordibacteraceae“ equivalent: „Candidatus Usinibraceae“, f__UBA2103, GTDB

„Candidatus Minusculum“ equivalent: „Candidatus Togastosa“ und g__1-14-0-10-45-20, GTDB

„Candidatus Minusculum obligatum“ includes: Patescibacteria group bacterium UBA2103

„Candidatus Phycocordibacter“ equivalent: „Candidatus Usinibra“, g__UBA2103, GTDB

„Candidatus Phycocordibacter aenigmaticus“ includes Patescibacteria group bacterium UBA2163
In der GTDB enthält die Ordnung o__UBA9973 u. a. die folgenden Familien:
f__UBA2163, u. a. mit Gattung g__UBA2163, mit UBA2163 sp002327585 [Patescibacteria group bacterium UBA2163]

f__UBA2103, u. a. mit Gattung g__1-14-0-10-45-20 und g__UBA2103, letztere mit UBA2103 sp002331145 [Patescibacteria group bacterium UBA2103]
Die letztere Familie hat nach der GTDB 25 Stämme, die dort Organismen mit Namen Candidatus Kaiserbacteria zugeordnet werden; die erstere keine. Es wäre daher nach der NCBI-Taxonomie
Ca. Phycocordibacterales syn. o__UBA9973

Ca. Phycocordibacteraceae syn. Ca. Usinibraceae und f__UBA2103

Ca. Minusculum syn. Ca. Togastosa und 1-14-0-10-45-20

Ca. Minusculum obligatum syn. UBA2103 sp002331145 mit Stamm UBA2103

Ca. Phycocordibacter syn. Ca. Usinbra und UBA2103

Ca. Phycocordibacter aenigmaticus syn. UBA2163 sp002327585 mit Stamm UBA2163
Das kann so nicht stimmen. Daher werden hier für die Synonymisierungen die Stämme als maßgeblich betrachtet wie folgt:
Ca. Phycocordibacter aenigmaticus syn. UBA2163 sp002327585 mit Stamm UBA2163, in:
Ca. Phycocordibacter syn. Ca. Usinbra und UBA2163, in:
Ca. Phycocordibacteraceae syn. Ca. Usinibraceae und f__UBA2163

Ca. Minusculum obligatum syn. UBA2103 sp002331145 mit Stamm UBA2103, in:
Ca. Minusculum syn. Ca. Togastosa und UBA2103, in:
f__UBA2103 syn. „Ca. Kaiserbacteraceae“

[mwEcE] „Candidatus Phycocordibacterales“ equivalent: o__UBA9973, GTDB

[mwEcI] „Candidatus Phycocordibacteraceae“ equivalent: „Candidatus Usinibraceae“, f__UBA2103, GTDB

[mwEcM] „Candidatus Minusculum“ equivalent: „Candidatus Togastosa“ und g__1-14-0-10-45-20, GTDB

[mwEcQ] „Candidatus Minusculum obligatum“ includes: Patescibacteria group bacterium UBA2103

[mwEcU] „Candidatus Phycocordibacter“ equivalent: „Candidatus Usinibra“, g__UBA2103, GTDB

[mwEcY] „Candidatus Phycocordibacter aenigmaticus“ includes Patescibacteria group bacterium UBA2163

[mwEck] __UBA2163, u. a. mit Gattung g__UBA2163, mit UBA2163 sp002327585 [Patescibacteria group bacterium UBA2163]

[mwEcw] __UBA2103, u. a. mit Gattung g__1-14-0-10-45-20 und g__UBA2103, letztere mit UBA2103 sp002331145 [Patescibacteria group bacterium UBA2103]

[mwEdE] Ca. Phycocordibacterales syn. o__UBA9973

[mwEdM] Ca. Phycocordibacteraceae syn. Ca. Usinibraceae und f__UBA2103

[mwEdY] Ca. Minusculum syn. Ca. Togastosa und 1-14-0-10-45-20

[mwEdo] Ca. Minusculum obligatum syn. UBA2103 sp002331145 mit Stamm UBA2103

[mwEd0] Ca. Phycocordibacter syn. Ca. Usinbra und UBA2103

[mwEeE] Ca. Phycocordibacter aenigmaticus syn. UBA2163 sp002327585 mit Stamm UBA2163

[mwEeU] Ca. Phycocordibacter aenigmaticus syn. UBA2163 sp002327585 mit Stamm UBA2163, in:
Ca. Phycocordibacter syn. Ca. Usinbra und UBA2163, in:
Ca. Phycocordibacteraceae syn. Ca. Usinibraceae und f__UBA2163

[mwEek] Ca. Phycocordibacter syn. Ca. Usinbra und UBA2163, in:
Ca. Phycocordibacteraceae syn. Ca. Usinibraceae und f__UBA2163

[mwEe8] Ca. Phycocordibacteraceae syn. Ca. Usinibraceae und f__UBA2163

[mwEfM] Ca. Minusculum obligatum syn. UBA2103 sp002331145 mit Stamm UBA2103, in:
Ca. Minusculum syn. Ca. Togastosa und UBA2103, in:
f__UBA2103 syn. „Ca. Kaiserbacteraceae“

[mwEfc] Ca. Minusculum syn. Ca. Togastosa und UBA2103, in:
f__UBA2103 syn. „Ca. Kaiserbacteraceae“

[mwEfw] __UBA2103 syn. „Ca. Kaiserbacteraceae“

[Nakajima2025-2] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Meri Nakajima, Ryosuke Nakai, Yuga Hirakata, Kengo Kubota, Hisashi Satoh, Masaru K. Nobu, Takashi Narihiro, Kyohei Kuroda: Minisyncoccus archaeiphilus gen. nov., sp. nov., a mesophilic, obligate parasitic bacterium and proposal of Minisyncoccaceae fam. nov., Minisyncoccales ord. nov., Minisyncoccia class. nov. and Minisyncoccota phyl. nov. formerly referred to as Candidatus Patescibacteria or candidate phyla radiation. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 75, Nr. 2, 10. Februar 2025; doi:10.1099/ijsem.0.006668, PMC 12281837 (freier Volltext), PMID 39928396 (englisch).

[LPSN-3] 1 2 3 4 LPSN: Class Minisyncoccia Nakajima et al. 2025.

[NCBI-4] 1 2 3 4 5 NCBI Taxonomy Browser: Minisyncoccia. Details: Minisyncoccia Nakajima et al. 2025; heterotypic synonym "Candidatus Paceibacteria" Chuvochina et al. 2023.

[Kuroda2024-5] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Kyohei Kuroda, Meri Nakajima, Ryosuke Nakai, Yuga Hirakata, Shuka Kagemasa, Kengo Kubota, Taro Q. P. Noguchi, Kyosuke Yamamoto, Hisashi Satoh, Masaru K. Nobu, Takashi Narihiro: Microscopic and metatranscriptomic analyses revealed unique cross-domain parasitism between phylum Candidatus Patescibacteria/candidate phyla radiation and methanogenic archaea in anaerobic ecosystems. In: mBio, Band 15, Nr. 3, 7. Februar 2024, S. e03102-23 [S. e0310223]; doi:10.1128/mbio.03102-23, PMC 10936435 (freier Volltext), PMID 38323857, Epub 13. März 2024 (englisch).

[GTDB-6] 1 2 3 4 5 6 GTDB: Minisyncoccia (class).

[Kuroda2022-08-7] 1 2 3 4 Kyohei Kuroda, Kyosuke Yamamoto, Ryosuke Nakai, Yuga Hirakata, Kengo Kubota, Masaru K. Nobu, Takashi Narihiro: Symbiosis between Candidatus Patescibacteria and Archaea Discovered in Wastewater-Treating Bioreactors. In: ASM Journals: mBio, Band 13, Nr. 5, 31. August 2022; doi:10.1128/mbio.01711-22 (englisch).

[Kuroda2022-11-8] 1 2 3 4 5 6 Kyohei Kuroda, Kengo Kubota, Shuka Kagemasa, Ryosuke Nakai, Yuga Hirakata, Kyosuke Yamamoto, Masaru K. Nobu, Takashi Narihiro: Novel cross-domain symbiosis between Candidatus Patescibacteria and hydrogenotrophic methanogenic archaea Methanospirillum discovered in a methanogenic ecosystem. In: Microbes and Environments, Band 37, Nr. 4, 12. November 2022, S. ME22063; doi:10.1264/jsme2.ME22063, PMC 9763046 (freier Volltext), PMID 36372432 (englisch).

[Chen2023-9] Xu Chen, Olivia Molenda, Christopher T. Brown, Courtney R. A. Toth, Shen Guo, Fei Luo, Jane Howe, Camilla L. Nesbø, Christine He, Elizabeth A. Montabana, Jamie H. D. Cate, Jillian F. Banfield, Elizabeth A. Edwards: "Candidatus Nealsonbacteria" Are Likely Biomass Recycling Ectosymbionts of Methanogenic Archaea in a Stable Benzene-Degrading Enrichment Culture. In: Applied and Environmental Microbiology, Band 89, Nr. 5, 31. Mai 2023, S. e0002523; doi:10.1128/aem.00025-23, PMC 10231131 (freier Volltext), PMID 37098974, Epub 26. April 2023 (englisch).

[10] 4′,6-Diamidin-2-phenylindol-dihydrochlorid. Auf: [Sigma-Aldrich] Merck.

[LPSN_Nitro-12] 1 2 LPSN: Phylum "Candidatus Parcunitrobacterota" corrig. Castelle et al. 2017. Synonym: Phylum "Candidatus Parcunitrobacteria" Castelle et al. 2017. Child taxa:
Class "Candidatus Parcunitrobacteria" Castelle et al. 2017-

[mwEzU] Class "Candidatus Parcunitrobacteria" Castelle et al. 2017-

[GTDB_09-RS220-13] 1 2 Genome Taxonomy Database (GTDB) Release 09-RS220
About. In: GTDB. Abgerufen am 19. Mai 2024 (englisch).

bac120_r220.sp_labels Tree File. In: GTDB. Abgerufen am 19. Mai 2024.

Taxon History. In: GTDB. Abgerufen am 19. Mai 2024 (englisch).

[mwE0E] About. In: GTDB. Abgerufen am 19. Mai 2024 (englisch).

[mwE04] bac120_r220.sp_labels Tree File. In: GTDB. Abgerufen am 19. Mai 2024.

[mwE1o] Taxon History. In: GTDB. Abgerufen am 19. Mai 2024 (englisch).

[Herrmann2019-15] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Martina Herrmann, Carl-Eric Wegner, Martin Taubert, Patricia Geesink, Katharina Lehmann, Lijuan Yan, Robert Lehmann, Kai Uwe Totsche, Kirsten Küsel: Predominance of Cand. Patescibacteria in Groundwater Is Caused by Their Preferential Mobilization From Soils and Flourishing Under Oligotrophic Conditions. In: Frontiers in Microbiology, Sec. Terrestrial Microbiology, Band 10, 20. Juni 2019, doi:10.3389/fmicb.2019.01407, PMC 6596338 (freier Volltext), PMID 31281301 (englisch).

[Jaffe2020-16] 1 2 3 Alexander L. Jaffe, Cindy J. Castelle, Paula B. Matheus Carnevali, Simonetta Gribaldo, Jillian F. Banfield: The rise of diversity in metabolic platforms across the Candidate Phyla Radiation. In: BMC Biology. Band 18, Nr. 69, Juni 2020; doi:10.1186/s12915-020-00804-5 (englisch). iehe insbes. Fig. S2.

[Pallen2022-19] 1 2 3 4 5 Mark John Pallen, Nabil-Fareed Alikhan, Luis M. Rodríguez-R: Naming the unnamed: Over 65,000 Candidatus names for unnamed Archaea and Bacteria in the Genome Taxonomy Database. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 72, Nr. 9, 20. September 2022; doi:10.1099/ijsem.0.005482, PMID 36125864, ResearchGate:363695508 (englisch). Dazu:
Corrigendum, 12. Mai 2023: doi:10.1099/ijsem.0.005885.

Version 2.0.0, 27. April 2022; doi:10.5281/zenodo.6477137. Hier: Protologues built from named genera.

65 000 Mikroben erhalten neue Namen. Auf: VBiO. Quelle: Universität Innsbruck.

[mwE68] Corrigendum, 12. Mai 2023: doi:10.1099/ijsem.0.005885.

[mwE7E] Version 2.0.0, 27. April 2022; doi:10.5281/zenodo.6477137. Hier: Protologues built from named genera.

[mwE7U] 65 000 Mikroben erhalten neue Namen. Auf: VBiO. Quelle: Universität Innsbruck.

[NCBI_Elulimicrobiota-22] NCBI Taxonomy Browser: Candidatus Elulimicrobiota, Details: "Candidatus Elulimicrobiota" Rodriguez-R et al. 2020 (phylum), "Candidatus Elulimicrobia" Rodriguez-R et al. 2020 (class).

[Danczak2017-23] 1 2 Robert E. Danczak, Michael D. Johnston, Michael Slattery, Kelly C. Wrighton, Michael J. Wilkins: Members of the candidate phyla radiation are functionally differentiated by carbon- and nitrogen-cycling capabilities. In: Microbiome. 5. Jahrgang, Nr. 1, September 2017, ResearchGate:319450132, S. 112, doi:10.1186/s40168-017-0331-1, PMID 28865481, PMC 5581439 (freier Volltext), bibcode:2017AGUFM.B14D..08D (englisch). . Siehe insbes. Additional file 1 (xlsx).

[Castelle2017-25] 1 2 Cindy J. Castelle, Christopher T. Brown, Brian C. Thomas, Kenneth H. Williams, Jillian F. Banfield: Unusual respiratory capacity and nitrogen metabolism in a Parcubacterium (OD1) of the Candidate Phyla Radiation. In: Scientific Reports. Band 7, Nr. 40101, 9. Januar 2017; doi:10.1038/srep40101, PMC 5220378 (freier Volltext), PMID 28067254 (englisch).

[LPSN_home-26] LPSN: Search taxonomy.

[Kadnikov2020-27] Vitaly V. Kadnikov, Andrey V. Mardanov, Alexey V. Beletsky, Olga V. Karnachuk, Nikolai V. Ravin: Microbial Life in the Deep Subsurface Aquifer Illuminated by Metagenomics. In: Frontiers in Microbiology, Sec. Extreme Microbiology, Band 11, 3. September 2020; doi:10.3389/fmicb.2020.572252 (englisch). Sieha insbes. Supplementary Table S1.