Literarkritische und formgeschichtliche Untersuchung des Heiligkeitsgesetzes (= Bonner biblische Beiträge, Bd. 19). Hanstein, Bonn 1963 (= Dissertation Universität Tübingen).
Die vorpriesterlichen Abrahamsüberlieferungen. Literarkritisch und traditionsgeschichtlich untersucht (= Bonner biblische Beiträge, Bd. 24). Hanstein, Bonn 1966 (= Habilitationsschrift Universität Bonn).
Die prophetischen Berufungsberichte. In: Joseph Ratzinger (Hrsg.): Theologie im Wandel. Festschrift zum 150 jährigen Bestehen der Katholisch-Theologischen Fakultät an der Universität Tübingen, 1817–1967 (= Tübinger theologische Reihe, Bd. 1). Wewel, München 1967, S. 356–376.
Isaaks Opferung. Zur Überlieferungsgeschichte von Gen 22 (= Stuttgarter Bibelstudien, Bd. 44). Verlag Katholisches Bibelwerk, Stuttgart 1970, ISBN 3-460-03441-6.
Ich bringe Leben in euch. Propheten sprechen uns an. Biblische Situationen heute. KBW-Verlag, Stuttgart 1975, ISBN 3-460-31051-0.
Jesaja 1- 39 (= Erträge der Forschung, Bd. 200). Wissenschaftliche Buchgesellschaft, Darmstadt 1983, ISBN 3-534-08777-1.
Jesaja. T. 1: Jesaja 1-12, T. 2: Jesja 13-39 (= Die neue Echter-Bibel. Kommentar zum Alten Testament, Bd. 17 u. Bd. 32). Echter-Verlag, Würzburg 1986/1994, ISBN 3-429-01041-1 u. ISBN 3-429-01596-0).
Studien zu alttestamentlichen Texten und Situationen. Hrsg. von Wolfgang Werner und Jürgen Werlitz (= Stuttgarter biblische Aufsatzbände / Altes Testament, Bd. 28). Verlag Katholisches Bibelwerk, Stuttgart 1999, ISBN 3-460-06281-9.
↑Prof. Dr. Rudolf Kilian †. In: Bibel und Kirche, Bd. 60 (2005), H. 1, S. 62 u. Bd. 59 (2004), H. 4, S. 236f.; Kilian, Rudolf. In: Otto Wenig (Hrsg.): Verzeichnis der Professoren und Dozenten der Rheinischen Friedrich-Wilhelms-Universität zu Bonn 1818–1968. Bouvier, Bonn 1968, S. 147.