The knockout stage for the 2000 Thomas Cup in Kuala Lumpur began on 18 May 2000 with the semi-finals and ended on 21 May 2000 with the final.
The top two placed teams from each of the two groups qualified for this stage.
| Group | Winners | Runners-up |
|---|---|---|
| A | ||
| B |
| Semi-finals | Final | |||||
| 1 | ||||||
| 3 | ||||||
| 0 | ||||||
| 3 | ||||||
| 2 | ||||||
| 3 | ||||||
China 3 |
Putra Stadium 18 May 2000, 18:30 UTC+8 |
South Korea 1 |
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Indonesia 3 |
Putra Stadium 19 May 2000, 18:30 UTC+8 |
Denmark 2 |
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Indonesia 3 |
Putra Stadium 21 May 2000, 18:30 UTC+8 |
China 0 |
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