Este torneo tiene una estructura dividida en varias etapas: Fase de Grupos, Fase Zonal de Eliminación y Fase Nacional de Eliminación
1. Fase de grupos
El torneo comienza con una fase de grupos organizada por zonas: Zona Occidental, Zona Central, y Zona Oriental. Cada zona tiene 3 grupos que tienen cuatro equipos que compiten en rondas por puntos. Los mejores 2 clasificados pasan a la siguiente ronda.
2. Fase Zonal de Eliminación
Luego de la fase de grupos, los equipos se distribuyen en partidos eliminatorios en sus respectivas zonas.
Los partidos de eliminación por zona tienen las siguientes instancias:
- Cuartos de final.
- Semifinales Zonales.
- Finales Zonales.
3. Semifinales Nacionales
Los equipos ganadores de cada Zona Final y el mejor subcampeón se enfrentan a nivel nacional. De estos encuentros se eligen los dos equipos que avanzarán a la Final Nacional.
4. Final Nacional
Finalmente, los dos equipos que ganen en las semifinales se enfrentan en el partido de la Final Nacional, que es el partido que determinará el campeón del torneo.
Debate
La Copa Presidente 2005 presentó diversas dificultades relacionadas principalmente con la organización y el interés del público, más que con errores en el reglamento del torneo. Uno de los principales problemas fue la escasa asistencia a los estadios, ya que la mayoría de los encuentros se disputaron con poca presencia de aficionados, lo que redujo el ambiente y la relevancia del torneo a nivel nacional. Además, los partidos se programaron en horarios poco convenientes, especialmente en horas de la tarde y entre semana, lo que dificultó la asistencia del público. A pesar de la participación de equipos de la Primera, Segunda y Tercera División, el torneo no generó gran interés entre los aficionados, quienes priorizaban la liga nacional. El sistema de competencia incluía varias fases, como etapa de grupos, rondas zonales y eliminatorias, lo que resultaba confuso para el seguimiento del torneo debido a la limitada difusión de información. Asimismo, el torneo careció de una adecuada promoción mediática y de incentivos económicos significativos, lo que afectó tanto el interés del público como el compromiso de los equipos participantes. En conjunto, estos factores contribuyeron a que la Copa Presidente 2005 fuera percibida como un torneo de baja relevancia dentro del fútbol salvadoreño.
El Salvador
Águila
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Independiente
Alianza
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